2016-03-21
什么是線粒體基因組?
線(xian)粒(li)體(Mitochondrion)是一種(zhong)存在于大多數真核細(xi)胞(bao)(bao)(bao)中的由雙層膜包被(bei)的細(xi)胞(bao)(bao)(bao)器(qi)。它是細(xi)胞(bao)(bao)(bao)中制造能(neng)量的結構,是細(xi)胞(bao)(bao)(bao)進行(xing)有氧呼吸的主要場(chang)所,被(bei)稱為“power house”。除了為細(xi)胞(bao)(bao)(bao)供(gong)能(neng)外,線(xian)粒(li)體還參與(yu)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)分化、細(xi)胞(bao)(bao)(bao)信息(xi)傳(chuan)遞和(he)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)凋亡等(deng)過(guo)程,并擁有調控細(xi)胞(bao)(bao)(bao)生長和(he)細(xi)胞(bao)(bao)(bao)周期(qi)的能(neng)力(li)。
線(xian)粒(li)體(ti)(ti)擁有自(zi)身(shen)的遺傳物(wu)質和(he)遺傳體(ti)(ti)系(xi)。通(tong)常而言,一個線(xian)粒(li)體(ti)(ti)包含2~10份拷貝的線(xian)粒(li)體(ti)(ti) DNA(mtDNA)。動物(wu) mtDNA 呈雙鏈環狀,其基(ji)因組大(da)小介(jie)于 11~28 kb。以人類 mtDNA 為例,其長(chang)度為16,569 bp,包含 37 個基(ji)因(13 個蛋白編(bian)碼基(ji)因、2個 rRNA 基(ji)因和(he) 22 個 tRNA 基(ji)因)和(he) 1 個非編(bian)碼區(qu)(富含AT的控(kong)制區(qu))。
所有 mtDNA 以單體型進(jin)行遺(yi)(yi)傳(chuan),幾乎不發生(sheng)基因重(zhong)組(zu),是生(sheng)物(wu)(wu)學(xue)(xue)家研究物(wu)(wu)種群體遺(yi)(yi)傳(chuan)學(xue)(xue)和(he)(he)進(jin)化生(sheng)物(wu)(wu)學(xue)(xue)的(de)理(li)想材料。相比于核基因組(zu),mtDNA 拷(kao)貝數(shu)高,穩定(ding)性好(hao),是考古(gu)學(xue)(xue)家和(he)(he)法(fa)醫學(xue)(xue)家開展工作(zuo)的(de)重(zhong)要對象。在(zai)醫學(xue)(xue)領(ling)域,線粒體疾病是一種常(chang)(chang)見的(de)遺(yi)(yi)傳(chuan)紊亂,醫學(xue)(xue)科研工作(zuo)者(zhe)常(chang)(chang)利(li)用 mtDNA 來研究、診斷及治(zhi)療線粒體疾病。
如果獲取線粒體基因(yin)組序列
策(ce)略:根據參(can)考基因組序(xu)列(lie),設計簡并(bing)引(yin)物,進行長距離 PCR 擴增,并(bing)采(cai)用一代(dai)測序(xu)方法獲得 mtDNA 序(xu)列(lie);
缺(que)點:項目周期長;無(wu)法確保獲得(de)全長 mtDNA 序列(lie)。
策略:分離獲(huo)得線(xian)粒體細胞器(qi),抽提線(xian)粒體基(ji)因組 DNA,采用(yong)高(gao)通量測(ce)序(xu)(xu)獲(huo)得 mtDNA 序(xu)(xu)列;
缺點(dian):獲得純的(de)線粒體細胞器(qi)費時費力。
選擇(ze)派森諾的(de)優勢在哪里?
客(ke)戶(hu)僅需提供富含線(xian)粒體(ti)的組(zu)織、細胞(bao)或全基因(yin)組(zu)總 DNA,派森(sen)諾幫(bang)您獲得(de)線(xian)粒體(ti) mtDNA 序列(lie)。
派森諾在(zai)線(xian)粒(li)(li)體(ti)基因(yin)組測序(xu)服務方面經驗豐富,已成功(gong)獲得多個(ge)物種的線(xian)粒(li)(li)體(ti) mtDNA 序(xu)列。從(cong)樣品提(ti)供到(dao)獲得線(xian)粒(li)(li)體(ti) mtDNA 序(xu)列,僅需要 1 個(ge)月的時間,極(ji)大地提(ti)高了科研工作者(zhe)的研究效(xiao)率。
提供拼接的 mtDNA 序列(lie)僅是(shi)我們優質(zhi)服(fu)務(wu)的一(yi)小部分,除(chu)此之(zhi)外,我們還提供包括注釋、可視(shi)化、進化分析(xi)等等服(fu)務(wu)。
注 釋(均以高清圖片形式呈現,如以下注釋內容和圖片)
tRNA 二(er)級結構(gou)預測
mtDNA 拷貝數分析(xi)
mtDNA 異(yi)質性(xing)分析
mtDNA 突變分析
進化(hua)分析(xi)