2016-02-16
簡介
派森諾生物與南京農業大學李榮教授領銜的團隊攜手合作，應用高通量測序的方法及宏基因組分析手段對連續2年施用抑制香蕉枯萎病的生物肥料的香蕉樹根際土壤中微生物群落的變化情況進行了剖析。讓我們一起來目睹一下香蕉樹根的微生物多樣性是怎么樣的吧！
本(ben)篇(pian)文章用Roche 454焦(jiao)磷酸測(ce)序(xu)研(yan)究(jiu)(jiu)了(le)生物肥(fei)料(liao)（BIO），豬糞(fen)堆肥(fei)（PM），和化學肥(fei)料(liao)（CF）對根際細菌和真(zhen)菌群落的(de)影響(xiang)，并(bing)探索微生物群落組成和香(xiang)蕉枯萎病的(de)潛在關系。研(yan)究(jiu)(jiu)成果《Rhizosphere microbial community manipulated by 2 years of consecutive biofertilizer application associated with banana Fusarium wilt disease suppression》發表在Biol Fertil Soils上。
實(shi)驗目的
研(yan)究生物肥(fei)料（BIO），豬糞堆肥(fei)（PM），和(he)化學肥(fei)料（CF）對根際(ji)微生物群(qun)落(luo)的影響，并探索微生物群(qun)落(luo)組成和(he)香(xiang)蕉(jiao)枯萎(wei)病的潛在(zai)關系。
研究(jiu)對象(xiang)
細菌和真菌。
實(shi)驗方法
對三種肥料(liao)處理(li)研究人員分別收(shou)集了相距5m以上(shang)的(de)(de)(de)5棵香蕉樹(shu)的(de)(de)(de)根(gen)(gen)際(ji)土(tu)(tu)并混合。對每(mei)棵樹(shu)從(cong)樹(shu)干(gan)基部0-20cm的(de)(de)(de)深度隨機取樣，從(cong)中心獲取根(gen)(gen)段并合在一起，根(gen)(gen)段上(shang)的(de)(de)(de)土(tu)(tu)用手(shou)輕抖下來(lai)，之后根(gen)(gen)被切成(cheng)約5cm的(de)(de)(de)小段，放入(ru)裝有250ml滅菌水的(de)(de)(de)1L的(de)(de)(de)錐(zhui)形瓶(ping)中搖動30min，4000×g離心10min收(shou)集沉淀得到根(gen)(gen)際(ji)土(tu)(tu)用于提(ti)取DNA。
測序平臺
Roche 454 FLX+。
測序區域(yu)
16s V4-V5區和ITS 。
實驗結果
1. Acidobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Proteobacteria和Ascomycota是所有樣(yang)品中豐度細菌和真菌的門。
2. 與(yu)PM和(he)CF對(dui)照相(xiang)比，連續兩年施(shi)用BIO后，細菌門(men)的多樣性(xing)顯(xian)著增加，而真菌多樣性(xing)顯(xian)著降低。
3. BIO處理組，Acidobacteria，Firmicutes, Leptosphaeria和Phaeosphaeriopsis 顯著增多，而Proteobacteria 和Ascomycota 顯著減少。
4. BIO 處理中(zhong)Fusarium（香蕉枯萎病的(de)致病病原體）的(de)豐(feng)度與(yu)CF相(xiang)比(bi)顯著降低，與(yu)PM相(xiang)比(bi)略有下降 。
5. 香蕉枯(ku)萎病的發生率與(yu)(yu)Acidobacteria (Gp1 and Gp3)，Firmicutes, Leptosphaeria和 Phaeosphaeriopsis這些(xie)類(lei)群的豐(feng)度負相關，但是與(yu)(yu)Proteobacteria, Ascomycota, Fusarium, Cylindrocarpon, Gymnascella, Monographella, Pochonia和Sakaguchia類(lei)群的豐(feng)度正相關。
實驗結論
連續(xu)兩年施用生(sheng)物肥(fei)料影響(xiang)根際微(wei)生(sheng)物組成，通過增加細菌(jun)多樣性(xing)和促進Acidobacteria (Gp1 and Gp3), Firmicutes, Leptosphaeria和Phaeosphaeriopsis 等的含(han)量(liang)抑制Fusarium（香蕉枯萎病(bing)的致病(bing)病(bing)原體）的種群(qun)含(han)量(liang)。
部分結果展(zhan)示(shi)
