2016-01-07
簡介：
梨小(xiao)(xiao)食(shi)心(xin)(xin)蟲(chong)為重(zhong)要的寡食(shi)性(xing)害(hai)蟲(chong)，分布范圍較廣，對梨樹嫩葉及(ji)(ji)果(guo)(guo)實(shi)等(deng)部位為害(hai)嚴重(zhong)。梨小(xiao)(xiao)食(shi)心(xin)(xin)蟲(chong)除危害(hai)梨、桃樹外，也危害(hai)李、杏、蘋果(guo)(guo)、山楂等(deng)，嚴重(zhong)影響(xiang)果(guo)(guo)品(pin)質量(liang)(liang)及(ji)(ji)梨果(guo)(guo)產量(liang)(liang)。梨小(xiao)(xiao)食(shi)心(xin)(xin)蟲(chong)成蟲(chong)觸角在尋找寄主植物、交配、產卵等(deng)過程中(zhong)發揮重(zhong)要作用(yong)。西北農林科(ke)技(ji)大學植物保(bao)護資源(yuan)和害(hai)蟲(chong)管理實(shi)驗室的仵均祥教(jiao)授和他的團隊以梨小(xiao)(xiao)食(shi)心(xin)(xin)蟲(chong)觸角做(zuo)為樣本進(jin)行轉(zhuan)(zhuan)錄組測(ce)序，鑒(jian)定嗅(xiu)覺相關(guan)基因(yin)。結果(guo)(guo)共鑒(jian)定出(chu)124個(ge)嗅(xiu)覺相關(guan)基因(yin)，其中(zhong)118個(ge)基因(yin)為該物種中(zhong)新(xin)發現的，包括28個(ge)編(bian)碼氣味(wei)(wei)(wei)結合蛋(dan)白(bai)(bai)的轉(zhuan)(zhuan)錄本，17個(ge)化學感(gan)受(shou)蛋(dan)白(bai)(bai)，48個(ge)氣味(wei)(wei)(wei)感(gan)受(shou)器(qi)，4個(ge)味(wei)(wei)(wei)覺感(gan)受(shou)器(qi)，24個(ge)親離(li)子受(shou)體，2個(ge)感(gan)覺神經(jing)膜(mo)蛋(dan)白(bai)(bai)及(ji)(ji)1個(ge)氣味(wei)(wei)(wei)降解酶(mei)。
國(guo)內基因測(ce)序(xu)(xu)公司派(pai)森諾生物測(ce)序(xu)(xu)項目文章(zhang)(zhang)：梨小食心蟲(chong)(chong)轉(zhuan)錄組(zu)(zu)測(ce)序(xu)(xu)。文章(zhang)(zhang)研究為今(jin)后害蟲(chong)(chong)味覺(jue)識(shi)別(bie)的研究提供(gong)了分子(zi)研究基礎，特別(bie)是為使(shi)用化(hua)學信息(xi)素控制害蟲(chong)(chong)提供(gong)了可行性(xing)。該(gai)研究成果Identificationof Putative Olfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis于(yu)2015年11月5日發(fa)表在PLoS ONE（影響因子(zi)3.234）雜志上(shang)。梨小食心蟲(chong)(chong)的轉(zhuan)錄組(zu)(zu)測(ce)序(xu)(xu)及信息(xi)分析工作，由上(shang)海(hai)派(pai)森諾生物科技股(gu)份有限公司完成。
方法(fa)：
; 用棉(mian)簽蘸5%蜂蜜溶液喂養(yang)雌幼蟲，對3-4天后剛羽化的(de)1200個飛蛾的(de)觸角(jiao)進行(xing)轉錄組測序
樣(yang)本量：
1個樣本
測序平臺：
Illumina MiSeq 平臺
分析內容：
; 1. 共有(you)基(ji)(ji)因和特有(you)基(ji)(ji)因分析
2. 基因表(biao)達差異分(fen)析
3. 聚類分(fen)析
4. eggNOG注(zhu)釋
5. KEGG注(zhu)釋
6. qPCR驗(yan)證
結果：
共鑒定出124個(ge)(ge)嗅覺相(xiang)關基因，其中(zhong)118個(ge)(ge)基因為該物種中(zhong)新(xin)發現的，包括28個(ge)(ge)編碼氣(qi)味結合蛋白的轉錄本，17個(ge)(ge)化學感(gan)(gan)受蛋白，48個(ge)(ge)氣(qi)味感(gan)(gan)受器，4個(ge)(ge)味覺感(gan)(gan)受器，24個(ge)(ge)親離子(zi)受體，2個(ge)(ge)感(gan)(gan)覺神經(jing)膜(mo)蛋白及(ji)1個(ge)(ge)氣(qi)味降(jiang)解酶(mei)。
結果展示：
圖1 轉錄組(zu)數(shu)據不(bu)同比對方(fang)式比較
圖2 OBP及CSP基因系統發生樹(shu)構建(jian)
圖3 梨小食心蟲(chong)轉錄組測序GO基(ji)因功能注釋
參(can)考(kao)文(wen)獻：
Guangwei Li, Juan Du. Identification of PutativeOlfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis. PLoS One. (2015)1-30.
原文索引：10.1371/journal.pone.0142193
本文由派森諾生物技術支(zhi)持徐寧寧整理
