2015-10-30
甲基-茉莉酮酸酯為廣(guang)泛存在于植物(wu)(wu)中(zhong)的(de)(de)誘(you)導因子，可促進茶(cha)葉中(zhong)香味的(de)(de)揮(hui)發(fa)。已(yi)有對茶(cha)葉中(zhong)各種揮(hui)發(fa)物(wu)(wu)成分的(de)(de)報(bao)道，但關于這(zhe)些揮(hui)發(fa)物(wu)(wu)的(de)(de)生物(wu)(wu)合成途徑的(de)(de)研(yan)究較(jiao)少。
中(zhong)國農(nong)業科學(xue)院(yuan)茶葉研(yan)究(jiu)所林(lin)智研(yan)究(jiu)員和(he)他的(de)團隊，通過(guo)轉錄組測序的方法(fa)，就不同甲(jia)基(ji)-茉莉酮酸(suan)酯(zhi)處理時間的茶樹葉片(pian)的基(ji)因(yin)表(biao)(biao)達(da)差異進行研究，于2015年9月30日發(fa)表(biao)(biao)題(ti)為Transcriptional responses and flavor volatiles biosynthesis in methyl jasmonate-treated tea leaves的文章，文章發(fa)表(biao)(biao)在BMC Plant Biology（影(ying)響(xiang)因(yin)子3.813）雜(za)志上。
茶樹葉(xie)片的轉(zhuan)錄組測序及信息分析工作，由上海派森諾(nuo)生物科(ke)技(ji)有限公司完(wan)成。
研究流(liu)程
供試樣本：茶樹葉片
處(chu)(chu)理(li)條(tiao)件：甲(jia)基(ji)-茉莉酮酸酯處(chu)(chu)理(li)，分別處(chu)(chu)理(li)0h，12h，24h，48h
樣本數量：4
分組信息：0h處理為對照，分別與不同(tong)時間的樣本進(jin)行比(bi)較
測序(xu)平臺(tai)：Illumina MiSeq測序平臺
分析(xi)內容：KEGG注釋、GO注釋、聚類分析(xi)、qPCR驗證等
實驗結果
12h，24h和48h處理組(zu)分別檢(jian)測到(dao)19245, 18614, 11890差異表(biao)達基(ji)(ji)因(yin)；α-亞麻(ma)酸(suan)降解途(tu)徑(jing)應答茉莉酮酸(suan)酯途(tu)徑(jing)，MEP/DOXP途(tu)徑(jing)的基(ji)(ji)因(yin)表(biao)達發生(sheng)顯著變化；此外，類(lei)萜(tie)生(sheng)物(wu)合成(cheng)途(tu)徑(jing)的相(xiang)關基(ji)(ji)因(yin)與對照組(zu)相(xiang)比也發生(sheng)顯著變化。
分(fen)析(xi)結果展示
甲(jia)基-茉莉酮酸酯處理(li)后(hou)，Unigenes的差異表達(da)分析（圖(tu)1）
圖1 基因表達聚類分析
Unigenes的基因(yin)功能注釋（圖2）
圖2 基因功能注釋(shi)(shi)（上）GO注釋(shi)(shi)；（下）KEGG注釋(shi)(shi)
qPCR檢(jian)測(ce)(ce)靶標基因表達量，驗(yan)證轉(zhuan)錄組測(ce)(ce)序的準確性（圖3）
圖3 qPCR驗證
參考文獻：
Jiang Shi et al. Transcriptional responsesand flavor volatiles biosynthesis in methyl jasmonate-treated tea leaves. BMC Plant Biology (2015) 15:233
本文由市場(chang)部王智健(jian)博士(shi)整理
