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芬蘭科學家利用轉錄組測序揭示前列腺癌中重要調控因子

2015-08-25

        近日(ri),芬蘭坦(tan)佩雷理工大學(xue)科(ke)學(xue)家(jia)Antti Ylip??等利用高通(tong)量(liang)測序技術對前列腺(xian)癌患者進行轉錄(lu)組測序,發現前列腺(xian)癌中的重(zhong)要調控lncRNA——PCAT5,PCAT5可作(zuo)為去勢難治性前列腺(xian)癌(CRPC)的生物分子標記。文章于2015年8月17日(ri)發表在(zai)Cancer Research(影響因子9.329)雜(za)志上。

        前(qian)列(lie)腺癌(ai)是(shi)男性(xing)常見惡性(xing)腫瘤,在某些國家和地區發病率高(gao)于肺(fei)癌(ai),并呈逐(zhu)年(nian)上升的(de)(de)趨勢(shi)。對于前(qian)列(lie)腺癌(ai)患(huan)者(zhe)在診斷時大多已(yi)發展到(dao)(dao)中晚期,雖(sui)然通過內分泌(mi)治(zhi)(zhi)(zhi)療(liao)可以(yi)使病情得到(dao)(dao)緩解,但多數(shu)前(qian)列(lie)腺癌(ai)患(huan)者(zhe)會發展成去(qu)勢(shi)難治(zhi)(zhi)(zhi)性(xing)前(qian)列(lie)腺癌(ai),去(qu)勢(shi)難治(zhi)(zhi)(zhi)性(xing)前(qian)列(lie)腺癌(ai)患(huan)者(zhe)預后極差。去(qu)勢(shi)難治(zhi)(zhi)(zhi)性(xing)前(qian)列(lie)腺癌(ai)是(shi)醫學(xue)界面臨的(de)(de)科學(xue)難題(ti),缺乏(fa)有效的(de)(de)治(zhi)(zhi)(zhi)療(liao)手段。

        Antti Ylip??等通過高通量測(ce)序手(shou)段,利用Illumina公司HiSeq 2000測(ce)序平臺對12個(ge)良性前列(lie)(lie)腺增生(sheng)(BPHs)患者(zhe)樣本(ben)(ben)(ben)、28個(ge)未經治療的前列(lie)(lie)腺癌(ai)(PCs)患者(zhe)樣本(ben)(ben)(ben)和(he)13個(ge)去勢(shi)難治性前列(lie)(lie)腺癌(ai)(CRPCs)患者(zhe)樣本(ben)(ben)(ben)進行轉錄組測(ce)序。本(ben)(ben)(ben)研(yan)究新發現145個(ge)未經注(zhu)釋(shi)的lncRNA或同源(yuan)異(yi)構體(isoform)序列(lie)(lie),其中三(san)分之一的序列(lie)(lie)為(wei)CRPCs特(te)有。

        作(zuo)者發(fa)(fa)現PCAT5為特異(yi)性的lncRNA,僅存在于靶標轉錄(lu)因子(zi)ERG-positive前(qian)列腺(xian)癌患(huan)者樣(yang)本和去勢難(nan)治(zhi)性前(qian)列腺(xian)癌患(huan)者樣(yang)本中,PCAT5作(zuo)為新發(fa)(fa)現的致瘤lncRNA,調(diao)節靶標轉錄(lu)因子(zi),并參與細胞(bao)的生長、遷(qian)移和細胞(bao)凋亡等。

        此(ci)外(wai),利用聚(ju)類分析(xi)(xi)和主成分分析(xi)(xi)等方法揭示不同樣本之間關鍵通路的基因表達(da)(da)量變(bian)化;對前(qian)列(lie)腺癌樣本和去勢難治性前(qian)列(lie)腺癌樣本中新發(fa)現(xian)的差異表達(da)(da)lncRNA的表達(da)(da)量進行檢測(ce);抑制PCAT5的表達(da)(da)會(hui)導致ERG-positive前(qian)列(lie)腺癌細(xi)胞的生長、遷(qian)移能力(li)的降低。

        本文通過轉(zhuan)錄組測序為去勢(shi)難(nan)治(zhi)性前列(lie)腺癌(ai)提供(gong)生物分子標記(ji),對臨床治(zhi)療具有(you)重要的指導意義。


原文索引:

//cancerres.aacrjournals.org/content/early/2015/08/15/0008-5472.CAN-15-0217.full.pdf+html?sid=03a5406c-8876-4535-b0f3-09a219dfc537

本文由王智健博士整理