2018-07-31
文案 | 轉錄(lu)調控(kong)事業(ye)部(bu)
隨(sui)著測(ce)(ce)序通(tong)量(liang)的(de)提高,利用高通(tong)量(liang)測(ce)(ce)序技術進行轉錄組(zu)(zu)研究(jiu)來揭示相關分(fen)(fen)(fen)子機(ji)制已經越來越普(pu)遍(bian),轉錄組(zu)(zu)研究(jiu)結果的(de)重點挖掘一般是放在差(cha)異(yi)基因上,主要(yao)研究(jiu)差(cha)異(yi)基因到底是行使怎(zen)樣的(de)功(gong)能(neng),參(can)與哪些(xie)代謝通(tong)路(lu),然后根據這(zhe)些(xie)功(gong)能(neng)和代謝通(tong)路(lu)分(fen)(fen)(fen)析來闡(chan)述引起差(cha)異(yi)的(de)相關分(fen)(fen)(fen)子機(ji)制。
對(dui)于挖掘到的(de)(de)目的(de)(de)基因(yin),想(xiang)要簡單的(de)(de)做個KEGG富集分析(xi)看看結果的(de)(de)老師們(men),我們(men)今(jin)天特意準備了關于在線做KEGG富集分析(xi)的(de)(de)小技(ji)能(neng)介紹,簡單7步即可(ke)順利完成(cheng),走過路(lu)過不要錯過呀!
第一步(bu)
? 首先百度搜索KEGG,打開(kai)圖中KEGG官網鏈接
第(di)二步(bu)
? 將(jiang)打開的界面拉(la)至最下方(fang),然后點擊BLASTKOALA
第三步
? 上傳(chuan)目標(biao)基因(yin)的(de)氨(an)基酸序列(lie)FASTA 文(wen)件(jian)
第四步
? 選擇您的物種類別
第(di)五步
? 輸入您(nin)的(de)郵箱
第六步
? 提交
第七(qi)步
? 收(shou)到(dao)郵件,點擊(ji)右鍵中(zhong)確(que)認提交任務的(de)鏈接,將進入新(xin)的(de)網址,內容顯示正在計算,計算完成后會將結(jie)果(guo)網址發送至您的(de)郵箱(xiang),然后點擊(ji)結(jie)果(guo)鏈接,就(jiu)能(neng)看(kan)到(dao)結(jie)果(guo)了。點擊(ji)紅(hong)色標(biao)注區域,可(ke)以看(kan)到(dao)通路(lu)圖(tu),通路(lu)中(zhong)富集的(de)基因會被綠色標(biao)注出(chu)來。
備注(zhu)
基因(yin)的核(he)酸序(xu)列如(ru)何轉化為蛋白(bai)的氨(an)基酸序(xu)列,有(you)很多種方法(fa),在線或者(zhe)軟(ruan)(ruan)件DNAMAN 或者(zhe)mega均可,只需下載(zai)軟(ruan)(ruan)件安裝,然后將(jiang)基因(yin)序(xu)列復(fu)制(zhi)粘貼,點擊translate即(ji)可。