2019-01-22
多組學（Multi-omics）研究是探究生物系統中多種物質之間相互作用的方法，包括基因組學、表觀基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、代謝組學、微生物組學等，這些物質共同影響生命系統的表型、性狀等。隨著高通量測序技術的發展，組學（Omics）研究不斷深入，通過對各組學進行高通量測序并對數據整合研究，可以全面和系統地了解基礎研究、分子育種、臨床診斷和藥物研發等領域中多種物質的相互關系。為網絡生物學、系統生物學的研究提供重要的技術手段。
為(wei)便(bian)于對多組(zu)學(xue)研究(jiu)思路的理解(jie)，我們將近(jin)期(qi)發表(biao)的多組(zu)學(xue)文(wen)章進行整理。
1 、Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome
基(ji)因組(zu)(zu)、外顯子組(zu)(zu)、轉錄組(zu)(zu)測序在(zai)臨床癌癥基(ji)因組(zu)(zu)學中的研究
期刊：Nature Communications
影響因(yin)子(zi)：12.353
發表時間：2018
研(yan)究(jiu)思(si)路(lu)：對(dui)78例臨床(chuang)腫(zhong)瘤(liu)樣本(ben)，通過基(ji)因組、外顯(xian)子組、轉錄組測序，對(dui)基(ji)因結(jie)構進行(xing)研(yan)究(jiu)，找到與腫(zhong)瘤(liu)相關的結(jie)構變異（structure variation,SV）、體細胞突變、致病性(xing)突變等。
2 、Omics and multi-omics approaches to study the biosynthesis of secondary metabolites in microorganisms
微生物次生代謝產物生物合成的多組學研究
期刊：Current Opinion in Microbiology
影響(xiang)因子：6.710
發表(biao)時間：2018
研究(jiu)思路：利用(yong)基(ji)因組(zu)學(xue)、轉錄組(zu)學(xue)、蛋白質組(zu)學(xue)和代(dai)謝(xie)組(zu)學(xue)的方法，開發天(tian)然(ran)代(dai)謝(xie)產物(wu)。基(ji)因組(zu)學(xue)，挖掘天(tian)然(ran)產物(wu)的生物(wu)合成基(ji)因；轉錄組(zu)學(xue)，代(dai)謝(xie)通路分析(xi)；蛋白質組(zu)學(xue)，代(dai)謝(xie)通路分析(xi)；代(dai)謝(xie)組(zu)學(xue)，代(dai)謝(xie)通路分析(xi)、天(tian)然(ran)產物(wu)新家族的發現。具體研究(jiu)思路見下圖。
3 、Multi-omics approaches to disease
疾病的多組學研究方法
期刊：Genome Biology
影響因子：13.214
發表時(shi)間：2017
研(yan)究思路：本文(wen)為綜述(shu)類文(wen)章，闡述(shu)多組(zu)(zu)學在(zai)(zai)疾病中的(de)研(yan)究思路，包括基(ji)因組(zu)(zu)、表觀基(ji)因組(zu)(zu)、轉錄(lu)組(zu)(zu)、蛋白質組(zu)(zu)、代謝組(zu)(zu)、微生物組(zu)(zu)學的(de)整(zheng)合(he)及各組(zu)(zu)學的(de)相互關系。除基(ji)因組(zu)(zu)外(wai)(wai)，其它的(de)組(zu)(zu)學都(dou)反映了遺傳調控和環(huan)境的(de)關系，這可能在(zai)(zai)不(bu)同程度上影響(xiang)到每個組(zu)(zu)學的(de)特(te)定物質。各組(zu)(zu)之間會頻繁發生交(jiao)互作用(yong)。此外(wai)(wai)，利用(yong)多組(zu)(zu)學研(yan)究，可對GWAS突變進(jin)行優先(xian)級排序。
以上是通(tong)過發表的文獻對多組(zu)學整合研究(jiu)思路的梳(shu)理(li)。后(hou)續(xu)，我(wo)們將陸續(xu)推出多組(zu)學研究(jiu)案例的解讀，敬請期待。
