2019-07-08
Illumina 公司(si)推(tui)出的NovaSeq 6000 SP芯片，其更(geng)高的測(ce)(ce)序(xu)通量及(ji)更(geng)短的測(ce)(ce)序(xu)周期都(dou)使得它能夠在眾多測(ce)(ce)序(xu)平臺中脫穎而(er)出，尤其是PE250測(ce)(ce)序(xu)策略的推出，讓我們(men)在擴增子測(ce)(ce)序(xu)領域(yu)中看到了更(geng)廣(guang)闊(kuo)的前景！
派森諾依靠強大(da)(da)的技術研發實力，和開拓進取的精神，目前已經實現了菌群(qun)多樣性組(zu)成(cheng)譜項(xiang)目的NovaSeq SP芯片(pian)PE250測序！接下來小編按捺(na)不(bu)住激(ji)動的心(xin)情，向大(da)(da)家展(zhan)示派森諾NovaSeq SP芯片(pian)PE250實測數據及分析結果，讓我們一睹為快吧~
本次數(shu)據與(yu)MiSeq PE250數(shu)據進行對比，總結為(wei)以下幾(ji)點(dian)：
1
NovaSeq細菌(jun)16S rRNA基因堿(jian)基質(zhi)量分(fen)布(bu)圖
NovaSeq真(zhen)菌ITS1基(ji)因堿基(ji)質(zhi)量分布(bu)圖
細菌16S rRNA基因與真菌ITS1基因NovaSeq測序質量表格
2
MiSeq與NovaSeq細菌16S rRNA基因門和(he)屬水(shui)平物(wu)種相對豐(feng)度柱形圖
MiSeq與NovaSeq真菌(jun)ITS1基(ji)因門(men)和屬水平物(wu)種相對(dui)豐度柱形圖
無(wu)論(lun)是(shi)(shi)細菌(jun)還是(shi)(shi)真菌(jun)測(ce)(ce)序分(fen)析結果，都可以看出，兩種(zhong)測(ce)(ce)序平臺得到的物(wu)種(zhong)組成(cheng)及豐度分(fen)布保持高度一致，優勢物種分布無差別；
MiSeq與NovaSeq稀(xi)有物種(zhong)（<0.1%）數量對比
在(zai)隨機挑選(xuan)的8個樣(yang)品(pin)中(zhong)，我們(men)針(zhen)對樣(yang)品(pin)中(zhong)屬水平上的稀有物種（即相對豐(feng)度(du)低于(yu)0.1%）進行了(le)數(shu)量統計，結果(guo)顯示(shi)，NovaSeq測序得(de)到的結果(guo)能獲得(de)更多的稀有物種(zhong)，這對于我們研(yan)究關鍵物種意義重大，也展現了(le)NovaSeq測(ce)序平臺更大數據規模(mo)測(ce)序的優勢！
4
MiSeq與NovaSeq的Procrustes一致性比(bi)較分析
同時，Beta多樣(yang)性Procrustes一致(zhi)(zhi)性分(fen)析結果顯示，兩種(zhong)測序平臺的同一樣(yang)品物種(zhong)組成(cheng)及豐度分(fen)布(bu)基本一致(zhi)(zhi)，且(qie)高度相(xiang)關(guan)。
上(shang)述(shu)結果表明，作為Illumina測(ce)序系統中的(de)“新貴”，NovaSeq平臺不僅能獲得(de)和(he)MiSeq平臺高度一(yi)致的(de)菌群組成結構，而且(qie)在測(ce)序質(zhi)量上(shang)，也(ye)相(xiang)比Q30>75%的(de)MiSeq、NovaSeq PE250模式(shi)官方質(zhi)控標(biao)準，有大幅提(ti)升！更重要(yao)的是(shi)，在NovaSeq平臺上，能(neng)輕而易舉(ju)的實(shi)現大樣品量、高測(ce)序量的菌(jun)群多(duo)樣性組成譜(pu)解(jie)析，對于(yu)低豐度物種的探(tan)測(ce)、以及菌(jun)群整體組成的分辨率也將更精細！
派森諾也(ye)將一(yi)如(ru)既往地秉承“解析(xi)基因序列，詮釋生命(ming)密碼，改善人(ren)類生活”的(de)使命(ming)，始(shi)終貫徹“枝源派本，一(yi)諾千金”的(de)服務宗旨，繼續(xu)為(wei)大家(jia)帶來科研(yan)技(ji)術服務！
