2019-09-10
不知各位小伙伴(ban)是否有過這樣的體驗：
拿到(dao)一份新鮮出爐的轉錄組測序結果，熱火朝天地查找文獻、挖掘信息，最(zui)終(zhong)確(que)定(ding)了目標基因，正準備設計引物進行qPCR驗證時，卻發(fa)現怎么都找不到(dao)基因的序列。
于是(shi)便有了以(yi)下這段對話(hua)：
由于篇幅有限，這次我們(men)先(xian)來學習(xi)一下如何在Ensembl數據庫查找目標基因序列。話(hua)不(bu)多說，讓(rang)我們(men)開始吧！
利用Ensembl數據庫查找目標序列較為簡單，只需根據物種分類，進入不同的庫，然后搜索對應的基因ID即可。我們以大鼠為例，具體操作如下：
01、進入Ensembl數據(ju)庫
登錄網(wang)址
02、搜索結(jie)果(guo)如下
03、點擊第一個結果，然后點擊左邊的sequence
04、得到以下結果
05、下(xia)載相(xiang)應的(de)序列(lie)
點擊download sequence，出現界面如下，選擇要下載的序列類型，如cDNA，cds，還是最后的genomic sequence即DNA基因全長序列，最后點擊download，即可下載相應的序列。
總體而言，Ensembl數據庫對基因信息的呈現方式較為直觀，查找起來也十分方便。需要注意的一點就是：Ensembl根據物種所屬類型的不同，細分出了多個不同的庫，因此我們查找基因時，也應“有的放矢”，選擇正確的數據庫。
如果(guo)蠅的基因，可在Ensembl Metazoa庫中查找：
水稻的基因，則應(ying)在(zai)Ensembl Plants庫中查找：
Ensembl根據物(wu)種類型劃(hua)分的(de)各數據庫(ku)網址如下，供大家參考(kao)：
看(kan)到這(zhe)里，您是否(fou)對在Ensembl數據庫查找目標基因序列的方法有所了解了呢？
