2019-10-29
轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,主要包括 mRNA和非編碼RNA。為了解決更多的科研問題,測序平臺與測序技術都處在不斷優化的過程中,轉錄組測序技術也不例外。
由于(yu)PCR偏好性(xing)等客觀因素的(de)影(ying)響,常規轉錄(lu)組測(ce)序的(de)基(ji)因表達定量會受到影(ying)響。絕對(dui)定量轉錄(lu)組測(ce)序技(ji)術解決(jue)了擴(kuo)增(zeng)重復問(wen)題,在cDNA文庫擴(kuo)增前對每一個cDNA片段加上(shang)特異序列標簽(UMI),該標簽(qian)會隨cDNA序(xu)列一起擴(kuo)增(zeng)測序(xu),即來(lai)自于PCR擴增的(de)序(xu)列會與原始序(xu)列帶有相同的(de)UMI,通過(guo)過(guo)濾帶有(you)相(xiang)同(tong)UMI的重復序列還原(yuan)RNA文庫中最原始的RNA表達量(liang),在組間基(ji)因表達相對定(ding)量的(de)基(ji)礎上(shang)實現絕對定(ding)量。
項目流程圖(tu)
跟常規轉錄組測序項目相比,絕對定量轉錄組測序技術在實驗環節多了一步UMI的添加,在分析環節多了一步UMI數據過濾與統計,其余的分析內容和常規轉錄組一樣哦!派森諾生物在不久之前做了分析內容的全面升級,努力做到人無我有,人有我優,老師們提出的個性化分析需求我們也會全力解決!
部(bu)分分析內容展示1
部分分析內容展示2
絕對定(ding)量轉錄組測(ce)序(xu)技術優(you)勢:
1、基(ji)因表達的精準定量。通過特異(yi)標簽去除擴(kuo)增重復與測序重復,解決偏(pian)好(hao)性問題。
2、更精準的堿基識別。帶有相同UMI的序列來自于同一條轉錄本,序列間相互校正獲得精準的序列信息。使SNP等結構分析結果更準確,對于無參考基因組的轉錄組測序尤為重要,精準的堿基識別可大大提高unigene拼接的正確性。
3、建庫所需RNA量低于常規轉錄組。
要做轉(zhuan)錄(lu)組測序(xu)的(de)你,請想(xiang)一個(ge)不選絕對定量轉(zhuan)錄(lu)組測序(xu)的(de)理由~
2019年10月29日
轉錄調控產品部