2020-02-18
眾所周知，在中心(xin)法(fa)則上，蛋白質才(cai)是(shi)最終產物，才(cai)是(shi)生命(ming)活動(dong)的(de)主要承擔者(zhe)。對(dui)于做基礎(chu)科研的(de)眾多師生來說，基因(yin)(yin)表(biao)達豐度(du)卻是(shi)大(da)家最基礎(chu)的(de)數據之一，這(zhe)是(shi)因(yin)(yin)為大(da)部分的(de)人會選擇更加便利的(de)檢測技術手(shou)段來研究各種(zhong)生命(ming)現象的(de)機(ji)制(zhi)機(ji)理，例如實時熒光定量PCR（qPCR）或(huo)者(zhe)轉錄組測序（RNA-seq）技術，來快速獲(huo)得基因(yin)(yin)表(biao)達豐度(du)，因(yin)(yin)此大(da)家潛意識里，在一定程度(du)上默認(ren)mRNA表(biao)達豐度(du)=蛋白表(biao)達豐度(du)。（當然，這(zhe)是(shi)很“危險”的(de)想(xiang)法(fa)哦。）
重要(yao)的(de)however來啦~2016年(nian)期(qi)刊Proteomics 有(you)文獻(xian)總結，轉(zhuan)錄組結果和蛋白組結果的(de)一致性非常低，原因有(you)多種：
1、mRNA降解速率；
2、核糖體結合位點；
3、核(he)糖體密(mi)度；
4、密碼子使用的偏好性；
5、蛋白(bai)質周(zhou)轉率；
6、翻譯后修飾(shi)等(deng)9種。
影(ying)響轉錄組數(shu)據與蛋白(bai)組數(shu)據一致性的因素
Doi：10.1002/pmic.201600140
這些(xie)原因大多(duo)是轉錄后(hou)水平(ping)的調(diao)控，在細(xi)胞內，mRNA豐(feng)(feng)(feng)度與實際(ji)翻譯豐(feng)(feng)(feng)度之(zhi)間有很大的差異，mRNA翻譯的過程受到任何的感(gan)染和調(diao)控都會顯著影(ying)響蛋(dan)白的豐(feng)(feng)(feng)度。因此(ci)，在條件(jian)允(yun)許(xu)的情況下(xia)，檢測(ce)翻譯豐(feng)(feng)(feng)度與檢測(ce)轉錄豐(feng)(feng)(feng)度同等重要，甚至更重要，因為翻譯豐(feng)(feng)(feng)度更接近(jin)下(xia)游(you)蛋(dan)白表達(da)水平(ping)。
研究翻譯組(zu)我們首先要記住以(yi)下幾個知識點
1、每條mRNA分子鏈上結合(he)的(de)核(he)糖體數目(mu)是有區(qu)別的(de)
mRNA分(fen)子(zi)鏈上既可以(yi)結(jie)(jie)合一個(ge)核(he)(he)糖體，也可以(yi)結(jie)(jie)合兩個(ge)核(he)(he)糖體，三個(ge)核(he)(he)糖體……大部分(fen)時候，可同時被多個(ge)核(he)(he)糖體結(jie)(jie)合，同時翻譯(yi)出多條肽(tai)鏈。所(suo)以(yi)即使一個(ge)基因在轉錄水平豐度較低，但是(shi)可能(neng)通(tong)過結(jie)(jie)合較多的核(he)(he)糖體，快速翻譯(yi)出大量(liang)的肽(tai)鏈，通(tong)過進一步的盤曲折疊(die)形(xing)成(cheng)具(ju)有空間結(jie)(jie)構的蛋白質。
mRNA分子結合核糖體示意圖
2、并(bing)不(bu)是每一條轉錄后(hou)的mRNA分子都可以成(cheng)功翻(fan)譯成(cheng)蛋白質
在動物體內，存(cun)在miRNA結合(he)mRNA分(fen)子，抑制翻譯過程(cheng)，導致mRNA分(fen)子無法(fa)成(cheng)功翻譯成(cheng)蛋白質；在植物體內，廣泛存(cun)在著miRNA結合(he)mRNA分(fen)子，將mRNA分(fen)子降解成(cheng)小片段(duan)，無法(fa)開展(zhan)翻譯過程(cheng)生成(cheng)蛋白質，此種情(qing)況下，連完(wan)整(zheng)的mRNA分(fen)子都“尸骨無存(cun)”。
翻譯(yi)組檢測技術(shu)和更(geng)多的翻譯(yi)組學知識，請(qing)持續關注上海派森(sen)諾公(gong)眾號(hao)，畢竟，做科研，我們是認真的。
