2020-03-07
收藏的文(wen)章太多，之前(qian)看(kan)到的文(wen)章找不(bu)到了怎么辦！？收藏這一篇(pian)就夠了！
抗疫(yi)時(shi)期，
全民宅家變大廚，
科研學(xue)習也不能(neng)落(luo)后！
是時候該掌(zhang)握真正(zheng)的技術了！
轉錄(lu)組(zu)測序（RNA-seq）作為(wei)當(dang)下最有效的從整(zheng)體水平上(shang)研(yan)(yan)究(jiu)細(xi)胞基因表達情況及轉(zhuan)錄調控規律的技(ji)術之一(yi)(yi)，在現在的科研(yan)(yan)項(xiang)目(mu)(mu)中已經(jing)越來越常見(jian)了。可是(shi)聽過那么多(duo)講(jiang)座，看了那么多(duo)文獻，依然搞不懂轉(zhuan)錄組(zu)研(yan)(yan)究(jiu)項(xiang)目(mu)(mu)的“套(tao)路”？對(dui)于(yu)一(yi)(yi)些常見(jian)的轉(zhuan)錄組(zu)數據分析技(ji)巧(qiao)還云里霧里？為(wei)了解決大(da)家在這方面的困(kun)惑，我們把之前推送(song)過的一(yi)(yi)些轉(zhuan)錄組(zu)技(ji)巧(qiao)類的文章進(jin)行匯(hui)總，從做(zuo)項(xiang)目(mu)(mu)前期找(zhao)參考(kao)基因組(zu)，到后續做(zuo)功能驗證給(gei)您詳細(xi)的指(zhi)導。
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研究的(de)物種是否(fou)有參(can)(can)考基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)是做轉(zhuan)錄(lu)組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序之(zhi)前首先要確(que)認的(de)一個問題，這決定了(le)(le)我們是做有參(can)(can)轉(zhuan)錄(lu)組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序還是無(wu)參(can)(can)轉(zhuan)錄(lu)組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序。不同的(de)項目對應的(de)分析方(fang)法不同，在這兩篇文章(zhang)里給大家詳(xiang)細(xi)的(de)介紹了(le)(le)如何在一些主(zhu)流數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)（Ensembl數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)、NCBI數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)）找參(can)(can)考基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)和一些特殊物種的(de)數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)（UCSC數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)、JGI基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)、柑橘類(lei)基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)、 薔薇(wei)科基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)數據(ju)庫(ku)(ku)(ku)等）找參(can)(can)考基(ji)(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)。
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很多不了(le)解RNA-Seq的小伙(huo)伴，在點開(kai)結題報(bao)告的一瞬間(jian)，滿腦子的問號。這篇文章可以讓您快速了(le)解轉錄組測(ce)序結果的三大(da)部分，著重關注(zhu)重點分析內容。
看(kan)懂結(jie)果是解讀數據的第一步，如何把結(jie)果和最(zui)終的課題(ti)相關聯，這篇文章教您如何挖掘(jue)關鍵(jian)基因。
您找(zhao)到關鍵基因后，怎(zen)么把它們對應的表(biao)(biao)達量，差異結果和注釋信息放在一(yi)張表(biao)(biao)里呢？
這篇文(wen)章(zhang)為您介紹了EXCEL的VLOOKUP函數，輕輕松松幫您把(ba)所有的信息整理在一起。
針對有(you)參考基因(yin)(yin)組項目，當您(nin)最(zui)終確(que)定了目標基因(yin)(yin)，準備設計(ji)引物進(jin)行(xing)qPCR驗證(zheng)或(huo)者后續(xu)的基因(yin)(yin)功(gong)能實驗時，這兩篇(pian)文章(zhang)就為您(nin)介紹了如何在NCBI和Ensembl數(shu)據庫里查找(zhao)目標基因(yin)(yin)的序列。
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做完(wan)測序工作，數(shu)據(ju)(ju)(ju)分析和文(wen)章(zhang)撰寫(xie)，但(dan)是在(zai)文(wen)章(zhang)發表前往(wang)(wang)往(wang)(wang)都需(xu)要(yao)上(shang)傳數(shu)據(ju)(ju)(ju)。那(nei)么(me)(me)數(shu)據(ju)(ju)(ju)上(shang)傳到(dao)哪里？怎么(me)(me)進行數(shu)據(ju)(ju)(ju)的上(shang)傳？這篇軟文(wen)就幫大家梳理了這些問題，從此數(shu)據(ju)(ju)(ju)上(shang)傳So easy~
轉錄組結(jie)果(guo)出來后往(wang)往(wang)都會做qPCR驗(yan)證(zheng)，但(dan)有的時候結(jie)果(guo)驗(yan)證(zheng)不上很讓人(ren)苦(ku)惱(nao)，這篇文章就為大家詳細的分析了出現驗(yan)證(zheng)不上的幾種原因。
那么除了qPCR，對(dui)于(yu)轉錄組測序后的其他驗證方法(fa)，這篇文章也有(you)詳(xiang)細的介紹。
以(yi)上(shang)就是我(wo)(wo)們(men)在(zai)去年發(fa)表(biao)(biao)的(de)一些技術類(lei)(lei)文章(zhang)的(de)總結，接下來我(wo)(wo)們(men)也會接著(zhu)發(fa)表(biao)(biao)更多的(de)干(gan)貨(huo)類(lei)(lei)軟(ruan)(ruan)文，助您科研(yan)成功是我(wo)(wo)們(men)的(de)職(zhi)責，讓更多客戶滿意(yi)是我(wo)(wo)們(men)的(de)追求(qiu)！如您有任何想要(yao)了(le)解的(de)轉(zhuan)錄組知識，也歡迎您在(zai)下方的(de)評(ping)論區留言，我(wo)(wo)們(men)會結合大(da)家(jia)(jia)的(de)建(jian)議(yi)，發(fa)表(biao)(biao)更貼(tie)近大(da)家(jia)(jia)需求(qiu)的(de)干(gan)貨(huo)文章(zhang)。
