2020-03-12
代(dai)謝組(zu)學(xue) (Metabolomics)，是效仿基(ji)因組(zu)學(xue)和蛋(dan)白(bai)質組(zu)學(xue)的(de)(de)研究(jiu)思(si)想(xiang)，對生(sheng)物(wu)體內所有代(dai)謝物(wu)進(jin)行(xing)定量分析，并尋找代(dai)謝物(wu)與生(sheng)理病(bing)理變化(hua)的(de)(de)相對關系的(de)(de)研究(jiu)方式，是系統(tong)生(sheng)物(wu)學(xue)的(de)(de)組(zu)成(cheng)部分。代(dai)謝組(zu)學(xue)研究(jiu)是利用液質聯(lian)用/氣質聯(lian)用技術研究(jiu)在某一時刻(ke)樣本內所有代(dai)謝物(wu)。代(dai)謝組(zu)學(xue)放大(da)了基(ji)因和蛋(dan)白(bai)表達的(de)(de)微小變化(hua), 反映(ying)了機體系統(tong)的(de)(de)生(sheng)理和病(bing)理狀態。
做代謝組學是(shi)選(xuan)擇(ze)非靶向代謝組還是(shi)靶向代謝組學？這是(shi)被(bei)問(wen)過很多次的問(wen)題。
非(fei)靶向(xiang)(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)組(zu)學：又被稱(cheng)為發現(xian)代(dai)(dai)謝(xie)組(zu)學，是對(dui)(dui)生(sheng)物(wu)(wu)(wu)樣本(ben)的(de)(de)(de)整個(ge)代(dai)(dai)謝(xie)組(zu)進行(xing)全面的(de)(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)物(wu)(wu)(wu)鑒定(ding)(ding)與分(fen)析，意在系(xi)統(tong)的(de)(de)(de)發現(xian)不(bu)(bu)同樣本(ben)中的(de)(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)物(wu)(wu)(wu)質差(cha)異(yi)情況(kuang)。非(fei)靶向(xiang)(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)組(zu)學能(neng)夠最大程度上(shang)體現(xian)生(sheng)物(wu)(wu)(wu)樣品體系(xi)中總的(de)(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)物(wu)(wu)(wu)信息，盡可能(neng)地去定(ding)(ding)性(xing)和(he)(he)定(ding)(ding)量（相對(dui)(dui)）所(suo)有的(de)(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)物(wu)(wu)(wu)。對(dui)(dui)不(bu)(bu)同處(chu)理(li)或生(sheng)理(li)狀態的(de)(de)(de)樣本(ben)代(dai)(dai)謝(xie)產物(wu)(wu)(wu)進行(xing)檢測(ce)，可以獲得不(bu)(bu)同狀態之間(jian)的(de)(de)(de)差(cha)異(yi)代(dai)(dai)謝(xie)產物(wu)(wu)(wu)，從而探究差(cha)異(yi)機(ji)制，尋(xun)找生(sheng)物(wu)(wu)(wu)標志物(wu)(wu)(wu)，可用于(yu)植物(wu)(wu)(wu)抗逆，植物(wu)(wu)(wu)營養和(he)(he)藥用價值評價，人和(he)(he)動物(wu)(wu)(wu)疾病治療，微生(sheng)物(wu)(wu)(wu)與發酵工程等領域。
靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)組(zu)(zu)(zu)學(xue)：即有目(mu)標(biao)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)物質群(qun)，需要(yao)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)物質對(dui)(dui)(dui)應的(de)(de)(de)標(biao)準品為參照，對(dui)(dui)(dui)特(te)定的(de)(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)物群(qun)進(jin)行(xing)有針對(dui)(dui)(dui)性(xing)地、特(te)異性(xing)地檢(jian)測(ce)(ce)(ce)(ce)與分(fen)(fen)析。靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)組(zu)(zu)(zu)學(xue)包(bao)含(han)不同(tong)的(de)(de)(de)細(xi)分(fen)(fen)產(chan)品，如短鏈脂肪酸靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)(ce)、氨(an)基(ji)酸靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)(ce)、有機(ji)酸代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)(ce)、神經遞質類物質靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)(ce)，動/植(zhi)物激素靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)檢(jian)測(ce)(ce)(ce)(ce)等等。靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)組(zu)(zu)(zu)分(fen)(fen)析具有特(te)異性(xing)強，檢(jian)測(ce)(ce)(ce)(ce)靈敏度高和定量準確等幾個特(te)點。通(tong)(tong)過對(dui)(dui)(dui)樣本中(zhong)某一(yi)特(te)定的(de)(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)物的(de)(de)(de)富集與準確定量定性(xing)分(fen)(fen)析，一(yi)方(fang)面可以結合其它實驗(yan)數據揭示相關的(de)(de)(de)分(fen)(fen)子(zi)生物學(xue)作(zuo)用機(ji)制，另一(yi)方(fang)面，也(ye)可以為后續代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)分(fen)(fen)子(zi)標(biao)志物的(de)(de)(de)深入(ru)研究(jiu)和開發利(li)用提(ti)供有力支持。靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)組(zu)(zu)(zu)學(xue)可以用于(yu)(yu)驗(yan)證(zheng)有非靶(ba)(ba)向(xiang)(xiang)(xiang)(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)組(zu)(zu)(zu)學(xue)實驗(yan)提(ti)出的(de)(de)(de)假說：也(ye)可以進(jin)行(xing)基(ji)于(yu)(yu)假說的(de)(de)(de)探索性(xing)實驗(yan)（通(tong)(tong)常根(gen)據 最新的(de)(de)(de)解(jie)釋），針對(dui)(dui)(dui)特(te)定代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)物， 研究(jiu)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)(xie)(xie)模型(xing)。
當沒(mei)有(you)特定關注的(de)代謝(xie)物(wu)質(zhi)，想利用代謝(xie)組(zu)(zu)(zu)學做(zuo)差(cha)異(yi)代謝(xie)物(wu)質(zhi)廣篩的(de)這類基礎(chu)研(yan)究的(de)時(shi)候推薦選擇非靶向代謝(xie)組(zu)(zu)(zu)學，例如，做(zuo)了轉(zhuan)錄組(zu)(zu)(zu)、蛋白(bai)組(zu)(zu)(zu)學研(yan)究，想與代謝(xie)組(zu)(zu)(zu)數據進行多組(zu)(zu)(zu)學關聯分析。
當(dang)做代(dai)(dai)謝(xie)(xie)組檢(jian)測(ce)之前，就(jiu)已(yi)經(jing)通過一(yi)定的(de)(de)實驗方(fang)法(fa)或者(zhe)測(ce)序手段發掘了目(mu)標表型或者(zhe)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)通路，可以鎖定目(mu)標代(dai)(dai)謝(xie)(xie)物(wu)類(lei)型的(de)(de)時(shi)候(hou)推薦選(xuan)擇相(xiang)應的(de)(de)靶(ba)向(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)組學檢(jian)測(ce)，比(bi)如，研(yan)(yan)(yan)究精神(shen)類(lei)疾病時(shi)可以選(xuan)擇神(shen)經(jing)遞質靶(ba)向(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)檢(jian)測(ce)，研(yan)(yan)(yan)究生(sheng)殖(zhi)相(xiang)關(guan)的(de)(de)課題可以考慮(lv)動物(wu)激(ji)素(su)靶(ba)向(xiang)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)檢(jian)測(ce)等等。需要注意一(yi)點，并(bing)不(bu)是所有類(lei)別(bie)的(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)物(wu)都(dou)有成熟(shu)的(de)(de)靶(ba)向(xiang)檢(jian)測(ce)項(xiang)目(mu)，目(mu)前能(neng)靶(ba)向(xiang)檢(jian)測(ce)的(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)(xie)物(wu)質都(dou)是科(ke)研(yan)(yan)(yan)人員使用標準品基于各類(lei)質譜平臺檢(jian)測(ce)慢慢積累下來(lai)的(de)(de)。
下面(mian)這段話(hua)也需(xu)要(yao)特別注意(yi)：
很多老師關注的某一類或者某幾(ji)個代謝物質并沒有對應的靶向檢測項目，怎么辦呢？這時(shi)候(hou)就需要評估可(ke)行性了，評估手段包(bao)括查閱國內外(wai)文獻，是否有標準品，綜合已經具備的檢測條(tiao)件(jian)等等一系列因素來確(que)認是否可(ke)以(yi)順利進行。
除了(le)以上提到的(de)非靶向(xiang)(xiang)以及靶向(xiang)(xiang)代謝組學之外，還(huan)有脂(zhi)(zhi)質組學產品(pin)，可以針(zhen)對8大類(lei)(lei)(lei)脂(zhi)(zhi)質類(lei)(lei)(lei)物質進行檢測分析，包括脂(zhi)(zhi)肪酸類(lei)(lei)(lei)、甘油脂(zhi)(zhi)類(lei)(lei)(lei)、甘油磷脂(zhi)(zhi)類(lei)(lei)(lei)、鞘脂(zhi)(zhi)類(lei)(lei)(lei)、固醇脂(zhi)(zhi)類(lei)(lei)(lei)、孕烯醇酮脂(zhi)(zhi)類(lei)(lei)(lei)、糖脂(zhi)(zhi)類(lei)(lei)(lei)、多聚乙烯類(lei)(lei)(lei)。
最后，對(dui)今天(tian)的主題做(zuo)個總(zong)結對(dui)比
友情提示：做代(dai)謝(xie)組學檢(jian)測一定要有足夠的(de)生物學重(zhong)復(fu)，代(dai)謝(xie)物個體差(cha)異較大，生物學重(zhong)復(fu)數不(bu)足面臨(lin)審稿專家質疑風險會很大哦。
生物學重復數目建議：
植物：6（3）
動物、人：10（6）
臨床樣(yang)品(pin)：推薦30個。
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