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今夏“C”位出道的“國自然”選手,算我一個

2020-07-15

大家好,今天我(wo)是(shi)

來做自我介紹噠。


我(wo)是近(jin)些年來的“國自然(ran)”的熱門選手——m6A甲基(ji)化修飾。

如果你還不了(le)解我,沒關系,請繼續往下(xia)看我的簡歷內容,相信你也會愛(ai)上我,pick我~~

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 圖1 m6A相(xiang)關的近十年基金項目統計(ji)



姓名:m6A甲基化修飾

出生日(ri)期:20世紀70年代出生,被發現,近(jin)些(xie)年被重(zhong)視。

本性(xing):我(wo)是(shi)RNA分子上的(de)一(yi)種修飾形式,腺嘌(piao)呤的(de)6號碳原子連接的(de)氨基(ji)基(ji)團中的(de)一(yi)個氫被甲基(ji)基(ji)團取代就成了我(wo),在人和(he)小鼠中有(you)(you)近二分之一(yi)的(de)mRNA中有(you)(you)我(wo)的(de)存在。


●“pick me”的理由(you)一 ●

mRNA分(fen)子(zi)內部除了有(you)我(wo)m6A修(xiu)飾,還有(you)m1A、m5C等修(xiu)飾類型,但是(shi)我(wo)的存在感最強(是(shi)最常(chang)見的RNA修(xiu)飾類型之一),研究我(wo)的技術比(bi)較多(duo)比(bi)較成(cheng)熟,所以我(wo)是(shi)我(wo)們(men)兄弟姐妹中的老大(da),我(wo)受到的關注最多(duo)。

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圖2 mRNA常見的7種修飾類型(xing)

(Li X , Xiong X , Yi C . Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications[J]. Nature Methods, 2016, 14(1):23.)



●“pick me”的(de)理(li)由二 ●

目(mu)前(qian)科(ke)研領域中,多組學聯(lian)合分析是一(yi)大熱點(dian),我(wo)和(he)我(wo)的(de)好(hao)朋友(you)轉(zhuan)錄組聯(lian)合,可以計算甲基化效(xiao)率(lv),明確修飾調控帶來的(de)mRNA表達的(de)影(ying)響;我(wo)和(he)我(wo)的(de)另一(yi)位(wei)好(hao)朋友(you)翻譯(yi)組的(de)聯(lian)合分析,可以挖(wa)掘m6A修飾對mRNA翻譯(yi)成蛋白(bai)質這一(yi)水平帶來的(de)下游影(ying)響,有(you)利于(yu)揭示(shi)m6A的(de)下游調控機(ji)制機(ji)理。

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圖3 m6A修飾(shi)多組學聯合分析



●“pick me”的理由三 ●

適用的(de)(de)(de)研(yan)究范(fan)圍較為廣泛(fan),現有的(de)(de)(de)m6A修(xiu)飾和眾多研(yan)究領域關系緊密,植物,動物,真菌均存在一定的(de)(de)(de)生理調控過程(cheng)與(yu)m6A修(xiu)飾有關,比如腫(zhong)瘤(liu)的(de)(de)(de)增殖,斑馬魚和果蠅的(de)(de)(de)胚胎(tai)發育,擬南芥(jie)的(de)(de)(de)開花(hua)過程(cheng)等(deng)等(deng)。


圖片2.png

圖(tu)4 m6A修飾研究應用領域


以下是(shi)近些年關于m6A的相關綜述(shu)和擬南芥(jie),斑馬魚和腫瘤細胞等(deng)樣本的相關研究,供大家(jia)進(jin)一步(bu)了解。


參(can)考文(wen)獻:

1.Li, X. , Xiong, X. , & Yi, C. . (2016). Epitranscriptome sequencing technologies: decoding rna modifications. Nature Methods, 14(1), 23.

2.Luo, G. Z. , Macqueen, A. , Zheng, G. , Duan, H. , Dore, L. C. , & Lu, Z. , et al. (2013). Unique features of the m6a methylome in arabidopsis thaliana. Nature Communications, 5, 5630.

3.Jiang, Y. , Wan, Y. , Gong, M. , Zhou, S. , & Cheng, W. . (2020). Rna demethylase alkbh5 promotes ovarian carcinogenesis in a simulated tumour microenvironment through stimulating nfκ b pathway. Journal of Cellular and Molecular Medicine(1).

4.Ting, Sun, Ruiyan, Wu, Liang, & Ming. (2019). The role of m6a rna methylation in cancer. Biomedecine & Pharmacotherapie.

5.Zhao, B. S. , Wang, X. , Beadell, A. V. , Lu, Z. , Shi, H. , & Kuuspalu, A. , et al. (2017). M6a-dependent maternal mrna clearance facilitates zebrafish maternal-to-zygotic transition. Nature, 542(7642), 475.

6.Duan, H. C. , Wei, L. H. , Zhang, C. , Wang, Y. , Chen, L. , & Lu, Z. , et al. (2017). Alkbh10b is an rna n6-methyladenosine demethylase affecting arabidopsis floral transition. The Plant Cell, tpc.00912.2016.