2020-12-23
派森(sen)諾基因云(yun)9月份上線了真核有參(can)轉錄組云(yun)分析(xi)（點(dian)擊查看），12月(yue)份(fen)又上(shang)線了一(yi)系列小(xiao)工具（點(dian)擊查(cha)看） ，為了讓廣大用戶有更(geng)好的(de)分(fen)(fen)析體驗，云(yun)分(fen)(fen)析和(he)小(xiao)工具也在不斷升(sheng)級(ji)，今天就來(lai)一起(qi)看看基因云(yun)的(de)新(xin)面貌(mao)！
一、根據內部使用和用戶反饋，轉錄(lu)組云分析進行(xing)了幾大板塊(kuai)的(de)更(geng)新：
1、項目概況部分-在界面添加(jia)參考(kao)基因組(zu)的(de)注釋表格的(de)下載：
2、表達差異(yi)分(fen)析-差異(yi)基因韋恩(en)圖-分(fen)析設置增加了可以(yi)自(zi)由選擇比較組的(de)功能，大家可以(yi)根據自(zi)己(ji)的(de)需求自(zi)行繪制需要的(de)venn圖：
3、表達(da)差異分(fen)析-聚(ju)類(lei)分(fen)析，熱圖開發了優化版，可以直接在(zai)圖表調整(zheng)部分(fen)，調整(zheng)配色，圖片(pian)高度，聚(ju)類(lei)方式，圖例和標簽大(da)小(xiao)等，參(can)數確定后，點(dian)擊下方“更新繪圖”按(an)鈕(niu)，一(yi)鍵更新，即時獲取(qu)新熱圖：
二、為了(le)更好的提供(gong)個性化的補充分析，云圖(tu)匯增加了(le)轉錄組(zu)相關適用工具：
1、交互相關系(xi)數圖(tu)(tu)(tu)-想要單獨(du)對已(yi)有(you)的表(biao)達量的數據表(biao)格自行(xing)(xing)進行(xing)(xing)相關性分析，可以選(xuan)擇“交互相關系(xi)數圖(tu)(tu)(tu)”，根據示例提交數據后，點擊“提交繪圖(tu)(tu)(tu)”，即可在“圖(tu)(tu)(tu)表(biao)調整”區域進行(xing)(xing)顏(yan)色，聚類方式，方法，圖(tu)(tu)(tu)例等(deng)調整：
2、交互(hu)火山圖(tu)-想要對自己整(zheng)理(li)的(de)數據，有倍(bei)數，有p值(zhi)，單獨(du)拿來(lai)進行(xing)繪制火山圖(tu)，可(ke)以選擇“交互(hu)火山圖(tu)”，按照示(shi)例(li)上傳(chuan)文檔(dang)后，點擊“提交繪圖(tu)”，即可(ke)在(zai)“圖(tu)表調整(zheng)”區域進行(xing)顏色，點大小，倍(bei)數，p值(zhi)范圍，圖(tu)例(li)等的(de)調整(zheng)：
3、熱圖(tu)(tu)(tu)(tu)或者(zhe)是交互(hu)(hu)熱圖(tu)(tu)(tu)(tu)-想要對篩(shai)選得(de)到的(de)(de)目的(de)(de)基因進行熱圖(tu)(tu)(tu)(tu)的(de)(de)繪制，可以選擇“熱圖(tu)(tu)(tu)(tu)”或者(zhe)“交互(hu)(hu)熱圖(tu)(tu)(tu)(tu)”，按照(zhao)示例(li)上傳文(wen)檔(dang)后，點擊(ji)“提交繪圖(tu)(tu)(tu)(tu)”，即可在“圖(tu)(tu)(tu)(tu)表調整(zheng)”區域進行顏色，數據處理(li)方法，圖(tu)(tu)(tu)(tu)例(li)等(deng)的(de)(de)調整(zheng)，點擊(ji)“更新(xin)(xin)繪圖(tu)(tu)(tu)(tu)“即可獲得(de)新(xin)(xin)的(de)(de)結果：
4、GO富(fu)(fu)集(ji)(ji)分析(xi)(xi)(xi)或者KEGG富(fu)(fu)集(ji)(ji)分析(xi)(xi)(xi)-要(yao)對(dui)篩(shai)選得到的(de)目的(de)基因進(jin)(jin)行富(fu)(fu)集(ji)(ji)分析(xi)(xi)(xi)的(de)繪制(zhi)，基因功能富(fu)(fu)集(ji)(ji)可(ke)以(yi)選擇(ze)“GO富(fu)(fu)集(ji)(ji)分析(xi)(xi)(xi)”，代謝通路富(fu)(fu)集(ji)(ji)可(ke)以(yi)選擇(ze)“KEGG富(fu)(fu)集(ji)(ji)分析(xi)(xi)(xi)”，按(an)照示(shi)例上傳文檔后（KEGG富(fu)(fu)集(ji)(ji)分析(xi)(xi)(xi)還需要(yao)選擇(ze)物種），點擊(ji)“提交繪圖”，之后點擊(ji)右上方“結果查(cha)看”按(an)鈕(niu)進(jin)(jin)入(ru)分析(xi)(xi)(xi)進(jin)(jin)程頁面，顯示(shi)分析(xi)(xi)(xi)完成后，即(ji)可(ke)點擊(ji)進(jin)(jin)入(ru)結果查(cha)看，此(ci)時可(ke)以(yi)在“圖表調整”區域進(jin)(jin)行顏色，圖表展示(shi)形(xing)式，圖例等的(de)調整：
常規分(fen)析(xi)，云分(fen)析(xi)可以(yi)一(yi)網打盡；目的基因(yin)的挖掘(jue)后的熱圖到富集分(fen)析(xi)，云圖匯可以(yi)一(yi)一(yi)實現。快來點擊(ji)注冊派森諾基因(yin)云（//www.genescloud.cn/），自(zi)由玩(wan)轉轉錄組分(fen)析(xi)吧!
