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派森諾講解如何繪制好看的3D氣泡圖

2021-09-06

一、圖表介紹

氣泡圖(tu)(tu),顧名思義(yi),就(jiu)是以(yi)(yi)氣泡形狀為主(zhu)繪制的(de)(de)圖(tu)(tu),它(ta)是一種(zhong)多變量的(de)(de)圖(tu)(tu)表(biao),與散(san)(san)點(dian)圖(tu)(tu)外(wai)觀相似。但與散(san)(san)點(dian)圖(tu)(tu)不(bu)同的(de)(de)是,氣泡圖(tu)(tu)除了可以(yi)(yi)用(yong)X、Y軸去表(biao)示變量值之(zhi)外(wai),每一個(ge)氣泡的(de)(de)面積與顏色還(huan)可以(yi)(yi)表(biao)達(da)第三和第四個(ge)維度的(de)(de)數據。

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我(wo)們(men)先看兩款(kuan)大家常見的氣泡圖(tu):


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From Daniel Min(Ref1)

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今天想給大家重點介紹的是下面這款具有3D效果的氣泡圖:

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圖(tu)1 氣泡圖(tu)示例(li)

二、平臺實現

首先,登入派森諾基因云, 進入【云圖匯→氣泡圖

1. 準備數據

準(zhun)備圖2所示(shi)數(shu)據,數(shu)據文件第(di)一列(lie)對(dui)應(ying)的(de)(de)是(shi)組(可有(you)可無),第(di)二(er)列(lie)對(dui)應(ying)的(de)(de)是(shi)樣品名稱,第(di)三(san)、四列(lie)對(dui)應(ying)的(de)(de)是(shi)變量數(shu)值。第(di)五列(lie)對(dui)應(ying)的(de)(de)是(shi)氣泡大小。

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圖2  數據文件示例


2. 提交繪圖

上傳數據后,一鍵提交繪圖(tu)即可。

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圖3 提交數據(ju)繪圖


3. 參數調整

1)著色模式:按照分組和按樣品配色,另外用戶根據我們提供的色卡,也可以自行配色。

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圖(tu)(tu)4 圖(tu)(tu)表顏色示例


(2)標簽設置:可以控制標簽顯示與隱藏。

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圖5  標(biao)簽顯示與(yu)隱藏示例

參考文獻:

[1] Daniel Min et al.AXIOME3: Automation, eXtension, and Integration Of Microbial Ecology . GigaScience, 10, 2021, 1–4 doi: 10.1093/gigascience/giab006 


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