2021-12-23
值此雙旦之際，特此和大家一起看看基因云平臺，那些使用上萬次的熱圖，都有哪些功能亮點呢？ 01、熱圖 1.1 簡介 熱圖，通過著色的單元格展示多個樣品之間的關系或相關性。 圖1 熱圖示例 1.2 數據文件 第(di)一(yi)列對應的(de)(de)是基因名稱，其他列對應的(de)(de)是數值。 genename S1 S2 S3 S4 Gene1 5.119 1.407 5.607 1.82 Gene2 5.139 0.485 5.844 0.313 Gene3 3.802 1.824 6.419 2.449 Gene4 4.858 3.031 5.456 2.142 表1 熱圖數據示例 1.3 參數調整 功能亮點：可添加網格線，和顯示數值。 圖2 熱圖圖表樣式調整 02、交互熱圖 2.1 簡介 前(qian)面的(de)【熱(re)圖】生成的(de)圖片是(shi)靜(jing)態的(de)，不能夠(gou)實時動態的(de)進行(xing)調整(zheng)。這款交互熱(re)圖，可以很方便的(de)實現熱(re)圖的(de)實時調整(zheng)。 圖3 交互熱圖含分組示例 2.2 數據文件 熱圖和交互熱圖數據文件相同，交互熱圖多了個分(fen)組(zu)文件，因此能夠支持分(fen)組(zu)數(shu)據的展示。 SampleName Group A1 A A2 A B1 B B2 B 表2 交互熱圖數據示例 2.3 參數調整 亮點一：基因名稱隨意選擇顯示：可隨(sui)意選(xuan)擇基因/樣品名稱的顯示與隱藏，當數據量大時，可以避免圖表名稱堆疊過于雜亂，輕松實現查看特定基因/樣品的表達情況。 圖4 交互熱圖基因名稱示例 圖5 交互熱圖顯示/隱藏名稱 亮點二：單元格隨意縮放，在圖表調整欄，我們可以根據需要，橫向拖動隨意調整單元格的寬度和高度。 圖6 交互熱圖寬高示例 圖7 交互熱圖寬高調整 03、關聯熱圖 3.1 簡介 對物種豐(feng)度和生化指標或影(ying)響因(yin)子(zi)之(zhi)間進(jin)行相(xiang)關性分析。 圖8 關聯熱圖示例 3.2 數據文件 第一(yi)列對(dui)應分類名(ming)稱(cheng)，其它(ta)列為(wei)樣品對(dui)應的(de)數據。 Taxon CK1 CK2 CK3 CK4 Cladosporium 0.04 0.07 0.01 0.002 Rachicladosporium 0 0 0 0.0005 Toxicocladosporium 0.005 0 0 0 Mycosphaerella 0.003 0 0 0 unidentified_Septoria 0 0 0 0 表3 關聯熱圖數據文件示例 因子文件第一列為因子名稱，其(qi)它列為樣品對應(ying)的數(shu)據。 factor CK1 CK2 CK3 CK4 A1 pH 6.23 6.5 6.5 7.53 7.68 TN 2.48 2.24 1.9 2.23 2.11 MC 0.037 0.042 0.038 0.029 0.027 AP 190.02 191.99 190.02 39.53 32.46 表4 關聯熱圖數據因子文件示例 3.3 參數調整 功能亮點：可以調整圖形樣式為圓(yuan)(yuan)形(xing)，熱圖，橢圓(yuan)(yuan)形(xing)等。還可以添加不同樣式的顯著性星標。 圖9 關聯熱圖圖表調整 圖10 關聯熱圖參數調整 04、交互原值熱圖 4.1 簡介 交(jiao)互原值熱圖，顯示原始數值的熱(re)力圖。 圖11 交互原值熱圖示例 4.2 數(shu)據文件(jian) 與熱圖數(shu)據格(ge)式一(yi)樣。（第(di)一(yi)列(lie)對(dui)應的是基(ji)因名稱(cheng)，其(qi)他列(lie)對(dui)應的是數(shu)值） 4.3 參(can)數(shu)調整 功能亮點(dian)：可以(yi)繪制矩(ju)形熱(re)圖和環形熱(re)圖，一個基因數據，也可以繪(hui)出漂亮的圖表(biao)。 圖12 交互原值熱圖圖表調整 05、交互日歷圖 5.1 簡介(jie) 可以查看(kan)每月每天(tian)的數據(ju)分布情(qing)況(kuang)。 圖13交互日歷圖示例 5.2 數(shu)據文件 第一列對應(ying)的(de)是(shi)(shi)時間(jian)，第二列對應(ying)的(de)是(shi)(shi)數據。 Time Value 1/1/20 3 1/2/20 5 1/3/20 7 1/4/20 9 1/5/20 11 1/6/20 13 表5 交互日歷圖數據示例 5.3 參(can)數調(diao)整(zheng) 功能亮(liang)點一：圖表類型隨意切(qie)換(huan)， 可(ke)切(qie)換(huan)熱圖、散點圖兩種圖表(biao)(biao)，熱圖圖表(biao)(biao)通過色塊區分(fen)數據(ju)，而(er)散點圖圖表(biao)(biao)根據(ju)點的大(da)小來區分(fen)。 圖14 交互日歷圖示例 功能亮點(dian)二(er)：可根據不同的數據，顯示不同的圖案。 圖15 交互日歷圖示例 圖16 交互日歷圖示例 06、交互六邊形熱圖 6.1 簡介 六邊(bian)形熱圖（Hexagonal Heatmap）也稱六邊(bian)形分(fen)箱圖(tu)（Hexagonal Binning），是(shi)一種由(you)六邊(bian)形為主要元素構成的統計圖(tu)表。它(ta)既是(shi)散(san)點圖(tu)的延(yan)伸(shen)，又兼具直方圖(tu)（頻數統計）和熱圖(tu)（按值著色）的特征(zheng)。 圖17 六邊形熱圖示例 6.2 數據文件(jian) 分別對應的是兩列數值。 X Y 211 374 500 364 374 446 655 637 556 595 745 436 表6 六邊形熱圖數據示例 6.3 參數(shu)調(diao)整 功能(neng)亮(liang)點：圖形元素顯(xian)示范圍可通過色(se)軸自由控制。 圖18 六邊形熱圖示例
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