2022-07-13
在生(sheng)信分(fen)析中(zhong)，如何在染(ran)色體層面查看(kan)不同區域/基因的表(biao)達情況，差異顯著性(xing)呢(ni)？能(neng)否有一個圖能(neng)夠通過(guo)不同的圖表(biao)樣(yang)式，展示P值(zhi)、上下調表(biao)達差異、均值(zhi)等不同類別(bie)數據特(te)征(zheng)呢(ni)？為(wei)了解決這個問題，派森諾基因云特(te)此推(tui)出了“染(ran)色體Circos圖”，耗時(shi)半月(yue)傾心制作，此圖不僅顏值(zhi)頂(ding)頂(ding)而且可調參數眾多，快來(lai)隨小編一探究竟(jing)~
一、圖層設置
1.1圖表繪制模式
每(mei)一(yi)圈層可(ke)以繪制(zhi)不同(tong)圖(tu)表(biao)類型，也可(ke)以繪制(zhi)相(xiang)同(tong)圖(tu)表(biao)類型。
默認繪制的四層圖表分別是熱圖(tu)（常用(yong)于顯(xian)示P值等數據），散點圖（常用于顯示上調(diao)倍數等數據），折線圖（常用于顯示上調(diao)倍數(shu)均值(zhi)等數(shu)據），柱狀圖（常用于顯示上調基因下(xia)調基因表達(da)等(deng)數據），額外增加的兩層分別是散點圖和柱狀圖，每個圈層均可切換以上四種圖表類型。
1.2熱圖圖表調整
根據(ju)上(shang)傳的(de)數(shu)據(ju)，默認將第(di)四列(lie)(lie)到(dao)最(zui)后(hou)一列(lie)(lie)所(suo)有(you)value值當作熱圖(tu)數(shu)據(ju)作圖(tu)，我們可(ke)以通過勾(gou)選列(lie)(lie)名來(lai)篩選實(shi)際熱圖(tu)數(shu)據(ju)作圖(tu)，或選擇熱圖(tu)數(shu)據(ju)中部分value值在圖(tu)上(shang)顯示。
1.3柱狀圖寬度調整
根據(ju)(ju)上(shang)(shang)傳的(de)數據(ju)(ju)，我們會計算出(chu)最(zui)優的(de)柱形寬(kuan)度，可通過寬(kuan)度系數按(an)比例縮小柱形寬(kuan)度；另外(wai)，也可指(zhi)定上(shang)(shang)傳數據(ju)(ju)中某一列為每個柱形設置具體寬(kuan)度。提交繪(hui)圖之后，點擊項目列表(biao)的(de)圖標即可查(cha)看(kan)。
二、背景著色方式
著色(se)(se)方式可分為：環形著色(se)(se)（單色著色模式），扇形著色（多色著色模式）。
三、圖表間距設置
既可以調整軌道（環形）與軌道之間的間距，也可以調整染色體（扇形）與染色體之間的間距。
四、標簽的顯示
可(ke)以控制最外(wai)層標簽以及刻(ke)度線是否顯示，分別組合為(wei)以下4種模式。
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