2022-08-24
網(wang)絡(luo)(luo)熱(re)圖(tu)由熱(re)圖(tu)和(he)網(wang)絡(luo)(luo)圖(tu)組(zu)(zu)成,其(qi)中熱(re)圖(tu)可展示組(zu)(zu)內的相關(guan)性,而網(wang)絡(luo)(luo)圖(tu)可展示組(zu)(zu)間(jian)的關(guan)聯性。網(wang)絡(luo)(luo)熱(re)圖(tu)樣式(shi)新穎(ying),應用廣泛,比如可以用于展示微生(sheng)物(wu)豐度與環境因(yin)子之(zhi)間(jian)的關(guan)聯關(guan)系(xi)。接(jie)下來(lai)我們(men)一起看(kan)看(kan)派森諾基因(yin)云如何實現網(wang)絡(luo)(luo)熱(re)圖(tu)的繪(hui)制(zhi)。
一、圖形解讀 …… 熱圖:展示各環境因子之(zhi)間的(de)相關(guan)性。 網絡圖:展示微生(sheng)物豐度數(shu)據與環境因子之間的(de)關聯關系。
二、數據準備和提交 …… 2.1 數據格式 網絡熱圖需要提供豐度數據文件和因子文件。豐度數據文件至少為兩列,第一列為樣本名,其它列為豐度數據。因子文件至少為三列,第一列為樣本名,其它列為因子數據。
2.2 提交繪圖(tu) 首先登錄「派森諾基因云」,將準備好的豐度數據和因子文件上傳,然后點擊提交繪圖。繪圖完成后點擊刷新按鈕,即可刷新任務狀態,任務完成之后就可查看最新結果圖啦。
三、熱圖部分功能介紹 …… 3.1 熱圖位置 可調整熱圖位置為左上角或右下角。
3.2 相關性表示 可使用格子顏(yan)色(se)+大小或僅以顏色來表示相關性。熱圖顏色越深、格子越大表示相關性絕對值越大,反之則越小。 3.3 顯著性值(zhi) 可切換標簽類型為:星號(表示顯著性值)+R值(表示相關性值),星號,無三種不同狀態。
四、網絡圖部分功能介紹 …… 4.1 添加(jia)node節點 默認一個節點,需要展示多個關聯節點與環境因子關聯關系時,可通過" + "新增節點。 4.2 連線(xian)設(she)置 線條粗細表示相關性的強弱,連線越粗表示相關性越強,反之越弱。
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