2022-11-22
今天派森諾力邀合作客戶——來自中國科學院分子植物科學卓越創新中心巫永睿研究團隊的黃永財博士&王海海副研究員，詳細深入地解密Nature文章背后的課題設計與發文經驗。（請點擊(ji)：）
玉(yu)(yu)米(mi)(mi)根(gen)據用(yong)途分(fen)為食用(yong)玉(yu)(yu)米(mi)(mi)與飼(si)用(yong)玉(yu)(yu)米(mi)(mi)，其中(zhong)(zhong)后者占約70%，中(zhong)(zhong)國(guo)飼(si)料(liao)“最(zui)卡脖子”的問(wen)題是飼(si)料(liao)中(zhong)(zhong)需(xu)要添加大(da)豆(dou)蛋白(bai)，而我(wo)國(guo)大(da)豆(dou)超85%依賴于進(jin)口，所以提高玉(yu)(yu)米(mi)(mi)蛋白(bai)含(han)量(liang)是保障國(guo)家(jia)糧食與飼(si)料(liao)安全的重大(da)戰略需(xu)求(qiu)。本研究成(cheng)功從野(ye)生玉(yu)(yu)米(mi)(mi)中(zhong)(zhong)克隆出(chu)控(kong)制(zhi)玉(yu)(yu)米(mi)(mi)高蛋白(bai)品質(zhi)形成(cheng)和氮素高效利用(yong)的關(guan)鍵變異(yi)基因THP9，能顯著將(jiang)雜交種籽粒蛋白(bai)含(han)量(liang)。
為了讓(rang)大(da)家從(cong)這篇Nature文章學習(xi)到(dao)更多經驗，派森諾小編專門到巫老師課題組與巫老師、黃永財博士、王海海副研究員進行深入的溝通交流，從2017年的Plant Cell 到2020年的Nature Communications,再到今天的Nature，派森諾與巫老師課題組一直保持不間斷的持續合作，在巫老師的辦公室交談中他還高興地拿出了Plant Cell那個封面的擺臺與派森諾小伙伴一起合影。
左起第(di)二~第(di)四位分別(bie)為(wei)黃永財博士、巫永睿研(yan)究員、王海海副研(yan)究員
小編還特別對兩位一作黃永財博士&王海海副研究員進行了專訪。希望大家都能從此次訪談內容中收獲以下幾點： 1、研究課題的整(zheng)體(ti)設計與(yu)思(si)路； 2、努力(li)后暫時得不到預期(qi)結果(guo)怎(zen)么(me)辦？如何調整(zheng)思路克服困難？ 3、發(fa)Nature過程(cheng)中心理歷(li)程(cheng)的分享; 4、發(fa)高分文(wen)章的經驗總結。
長達四十分(fen)鐘的(de)(de)(de)訪談內容很多，兩位(wei)老師最想與(yu)大家分(fen)享的(de)(de)(de)部分(fen)小(xiao)編(bian)也以文字的(de)(de)(de)形式展現給大家。
Q1：歷經10年堅持(chi)，解決玉(yu)米的(de)(de)世紀(ji)難題(ti)——尋(xun)找“丟(diu)失的(de)(de)”蛋(dan)白(bai)密碼基因，最早這(zhe)個課(ke)題(ti)是如何(he)開始的(de)(de)呢(ni)？課(ke)題(ti)的(de)(de)背景是什么呢(ni)？ 黃永財博士：第(di)一，世界范(fan)圍內無(wu)數的(de)團隊在(zai)瞄準高(gao)蛋白(bai)(bai)做(zuo)研究，巫(wu)老師(shi)在(zai)國外(wai)做(zuo)博后期間在(zai)玉米蛋白(bai)(bai)品(pin)質研究方(fang)向有深厚的(de)知識(shi)積(ji)累與儲備；第(di)二，將玉米高(gao)蛋白(bai)(bai)基因的(de)知識(shi)產權牢(lao)牢(lao)握在(zai)中國人自己手中。
Q2：整個課題設(she)(she)計(ji)經(jing)過哪些(xie)(xie)歷程？做了哪些(xie)(xie)嘗試(shi)？有沒有一些(xie)(xie)課題設(she)(she)計(ji)&取樣相關的經(jing)驗分享(xiang)給大(da)家？ 王海海副研究員&黃永財博(bo)士：課題(ti)的(de)(de)設計(ji)首先是克隆基(ji)因，然后是構建遺傳群體，最后是多年多點的(de)(de)基(ji)因驗證(zheng)。整個課題(ti)做了各種嘗試，能想(xiang)到的(de)(de)幾乎(hu)都試過，比如GWAS、遺傳圖譜等，最后選擇用(yong)BSA的(de)(de)方法(fa)定位到一個比較大(da)的(de)(de)區間(jian)，雖然知道就在(zai)9號染色體上但再往(wang)下很難縮小范圍。考慮到野生玉米(mi)基(ji)因組的(de)(de)復雜性(xing)上海(hai)師范大(da)學的(de)(de)王文琴教授(shou)帶領團隊解決了這一攔路(lu)石，之后再采集材料進(jin)行BSA定位結果才得到比較好的(de)(de)結果。
Q3：課(ke)題在未知探索中(zhong)印象(xiang)最(zui)深(shen)刻的困(kun)難是什么(me)？如何(he)克服的？ 王(wang)海海副研究員&黃永(yong)財博士：遇到(dao)的(de)困難太多了！背后的(de)故(gu)事(shi)寫幾本(ben)書都(dou)不(bu)為過，歷歷在目。蛋白含(han)量(liang)是一個(ge)(ge)復(fu)雜的(de)數量(liang)性狀，肉眼很難直觀辨別，每(mei)(mei)(mei)年上(shang)萬(wan)株(zhu)玉米，每(mei)(mei)(mei)一株(zhu)都(dou)要(yao)編號、測(ce)量(liang)、記錄(lu)等，工作量(liang)巨大，結(jie)果未知，每(mei)(mei)(mei)一代都(dou)覺(jue)得該得到(dao)好的(de)結(jie)果了，但(dan)現實是殘酷的(de)，如此反復(fu)，一遍(bian)遍(bian)的(de)打擊，體(ti)力與思想雙透支(zhi)，但(dan)是我們依然(ran)堅信(xin)那個(ge)(ge)基(ji)因就在那里等著(zhu)我們，憑著(zhu)堅定的(de)信(xin)念走(zou)到(dao)今天！
Q4：目(mu)前已(yi)經找(zhao)到控制玉米蛋白(bai)含(han)(han)量的(de)一(yi)個基因，是否也找(zhao)到了其他影響蛋白(bai)質(zhi)含(han)(han)量的(de)基因？ 王海海副研究員&黃永財博士：相(xiang)關的(de)工作(zuo)已經有(you)了答案，高(gao)蛋白(bai)的(de)課題是(shi)分多(duo)步走的(de)，找出THP9基(ji)因(yin)只(zhi)是(shi)第一步，第二步是(shi)找到更(geng)多(duo)的(de)影響高(gao)蛋白(bai)的(de)基(ji)因(yin)，接下來是(shi)如何在(zai)產業上(shang)廣泛應用。
Q5：是否可以(yi)總(zong)結一下高分(fen)文章發文經驗？ 王海海副(fu)研(yan)究(jiu)員&黃永(yong)財(cai)博(bo)士：材料群(qun)體足夠(gou)大、表型鑒(jian)定準(zhun)確、與公司合(he)作充(chong)分溝通、多(duo)方的沉浸式投入，缺少(shao)任何一個環節都(dou)不可能有現在的結果。
訪談雖然結束，但派森諾與巫老師的合作依然在持續。每一個課題都是個性化的設計，派森諾的每一次分析也都會與之匹配，期待與大家更多更深入的交流！如需進一步討論，歡迎發郵件或者致電我們喲（郵箱地址：genome_support@doudin.cn，聯系電話：021-64502808-8203）！
