2022-12-08
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單細胞和(he)空(kong)轉技術宣傳(chuan)如火(huo)如荼(tu)，那(nei)么(me)它們到底是如何(he)解決(jue)科學問題(ti)的呢(ni)，小派再來做個簡述(shu)~~
單(dan)細(xi)胞(bao)(bao)RNA測序(scRNA-seq)技術目前已經成為解開單(dan)個細(xi)胞(bao)(bao)內(nei)RNA轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)(lu)本的(de)異質性和(he)復雜(za)性，以及揭示高度組(zu)(zu)織的(de)組(zu)(zu)織/器官(guan)/有(you)機體中不同細(xi)胞(bao)(bao)類型(xing)的(de)組(zu)(zu)成和(he)功能的(de)最(zui)先進(jin)方法。但(dan)是scRNA-seq可以識別(bie)組(zu)(zu)織內(nei)的(de)細(xi)胞(bao)(bao)亞(ya)群，卻不能捕(bu)捉它們(men)的(de)空(kong)(kong)間(jian)分布，也(ye)不能揭示作(zuo)用(yong)于細(xi)胞(bao)(bao)間(jian)通訊的(de)局部網絡(luo)。因(yin)此為了解決(jue)這一問題，空(kong)(kong)間(jian)轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)(lu)組(zu)(zu)應運(yun)而生，空(kong)(kong)轉(zhuan)(zhuan)技術不僅能夠帶來(lai)轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)(lu)組(zu)(zu)信息，同時還提供(gong)空(kong)(kong)間(jian)信息，幫研究(jiu)者更好(hao)辨別(bie)轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)(lu)的(de)位置。因(yin)此scRNA-seq和(he)空(kong)(kong)間(jian)轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)(lu)組(zu)(zu)學(xue)搭配(pei)起來(lai)，可以在其天然組(zu)(zu)織環(huan)境中定位具有(you)轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)(lu)特征的(de)單(dan)個細(xi)胞(bao)(bao)。整合scRNA-seq和(he)空(kong)(kong)間(jian)轉(zhuan)(zhuan)錄(lu)(lu)組(zu)(zu)學(xue)數據可以增加人們(men)對特定細(xi)胞(bao)(bao)亞(ya)群的(de)作(zuo)用(yong)及其在發育、穩態和(he)疾病中相互作(zuo)用(yong)的(de)理解。
單細胞(bao)測序技術在(zai)不同物種的應用(yong)（文獻1）
單細胞和空轉聯合分析應用解析（文獻2）
我(wo)們知道細胞本身包含DNA，RNA，蛋白質，代謝產物等多種分(fen)子(zi)，各種分(fen)子(zi)共同作用組成系統整(zheng)(zheng)體。因此單一的(de)轉錄組并不(bu)能全(quan)面體現細胞的(de)變化。為了(le)(le)更加(jia)全(quan)面系統的(de)解讀生(sheng)命機制，單細胞多組學越(yue)來越(yue)受到廣大科研(yan)工作者(zhe)的(de)青睞。了(le)(le)解了(le)(le)單細胞和(he)空轉搭配(pei)的(de)好處，那(nei)么(me)(me)具體二者(zhe)或者(zhe)和(he)其他組學要怎么(me)(me)來進(jin)行設計搭配(pei)呢，不(bu)急(ji)，小派(pai)整(zheng)(zheng)理了(le)(le)以(yi)下思路可供(gong)參考：
單細胞多組學整合研究
文獻思路可以參考 (點擊(ji)標題查看)：
參(can)考文獻：
[1]Jovic D, et al. Single-cell RNA sequencing technologies and applications: A brief overview. Clin Transl Med. 2022 Mar;12(3):e694.
[2]Longo SK, Guo MG, Ji AL, Khavari PA. Integrating single-cell and spatialtranscriptomics to elucidate intercellular tissue dynamics [published onlineahead of print, 2021 Jun 18]. Nat Rev Genet. 2021;10.1038/s41576-021-00370-8.
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