2023-01-02
新年新氣象，值此元旦佳節。派森諾基因云平臺，重磅推出微生(sheng)物宏基因組分析可視化系(xi)統。該系統集內容全面、分析專業、操作高效、方法創新以及突破性的數據集展現形式等特點于一體，助您科研再攀高峰。下面跟隨小編一起提前了解看看吧！
一、個性化Genes集和Reads集創建 微生(sheng)物宏基因組分析(xi)(xi)可視化系統同時(shi)支持基于Genes集(ji)(ji)和(he)Reads集(ji)(ji)數據(ju)的(de)分析(xi)(xi)和(he)操作。下面(mian)以創建(jian)Genes集(ji)(ji)為(wei)例(li)，一起(qi)看看如何創建(jian)個(ge)性(xing)化Genes集(ji)(ji)吧。 1.1 物種(zhong)/功能的剔(ti)除和保留 我們(men)可以依據研究目的，對(dui)關注或不(bu)關注的物種或功能(neng)，進行保留或剔除進而過濾相應序列。 其實質是基于科研需求，結合物(wu)種、功能等注(zhu)釋信息(xi)，對基因序列進行過濾的(de)過程 。 1.2 創建Genes集 第一(yi)步填寫(xie)Genes集基(ji)本(ben)信息，便于后續對Genes集進行(xing)管理(li)。 第二(er)步搭建流程，根(gen)據(ju)需(xu)求在基因、物(wu)種、功(gong)能(neng)三個過濾模(mo)塊中(zhong)，選(xuan)擇需(xu)要進行基因集(ji)過濾的注釋依據(ju) 。 第三步(bu)配置流程。在物種功能數據可視化界面中(zhong)，選中(zhong)或(huo)剔除(chu)關(guan)注，或(huo)不(bu)關(guan)注的物種或(huo)功能。 1.3 管理Genes集 完成(cheng)配置流程(cheng)后，可以點擊運行按鈕來啟動標(biao)準(zhun)分析流程(cheng)。另外還支持(chi)對Genes集進行配置、刪(shan)除、查看配置等操作。
二、14大主流功能數據庫 微生物宏基因組分析可視化系(xi)統(tong)支(zhi)持14大主(zhu)流(liu)功能數據庫，提(ti)供更加全面的(de)物種功能解讀(du)。 功(gong)能(neng)(neng)數據庫可以在功(gong)能(neng)(neng)分(fen)(fen)析(xi)相關章(zhang)節右側分(fen)(fen)析(xi)設(she)置中進(jin)行(xing)調整，下面以功(gong)能(neng)(neng)組成分(fen)(fen)析(xi)為(wei)例，可切換(huan)不同數據庫提交分(fen)(fen)析(xi)。
三、物種差異分析圖表解析 3.1 分析參數的調整 宏基因組分析可視化系統還推出專業化的物種/功能差異分析模塊。該模塊支持基于分組方案設計，并可依據分組和數據類型，提供多種不同數據格式轉換、數據處理、差異檢驗、事后檢驗、P值校正方法等諸多參數調整項。 3.2 分析結果展示 差異分析的(de)結果支持柱狀圖(tu)(tu)(tu)、森林圖(tu)(tu)(tu)、箱線(xian)圖(tu)(tu)(tu)、小提琴圖(tu)(tu)(tu)+箱線(xian)圖(tu)(tu)(tu)等多(duo)種形式和P值的(de)個性化分面呈現。
四、部分分析結果圖表秀 微生物(wu)宏基因(yin)組分(fen)析(xi)提供各式各樣新(xin)穎圖(tu)表(biao)，幫助您發表(biao)科研論文增添亮點，下(xia)面是(shi)摘選(xuan)的部分(fen)圖(tu)表(biao)，包(bao)括(kuo)物(wu)種/功能(neng)CIRCOS 、層次聚(ju)類分(fen)析(xi) 、關(guan)聯(lian)網絡分(fen)析(xi)、LEfSe分(fen)析(xi) 、物(wu)種貢獻(xian)度分(fen)析(xi)。
