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這款工具帶你一鍵搞定差異分析和可視化

2023-01-13

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一、圖表說明

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通過提琴箱線組合圖或柱形圖加顯(xian)著性星號形式展示不同(tong)組樣品之間(jian)的差異,并(bing)支持使(shi)用不同(tong)統(tong)計檢驗方法評價差異是否顯(xian)著。


二、數據準備


2.1、數據文件與分組文件

數據文件以物種在樣品中豐度值為例,第一列為物種名,第二列開始為物種在各樣品中的豐度值分組(zu)文件第一列為樣品名稱,第二列為分組名稱,第一列樣(yang)品(pin)(pin)名(ming)稱需(xu)要(yao)和數(shu)據(ju)文件中第一行樣(yang)品(pin)(pin)名(ming)稱一致。

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三、圖形解讀

圖形分為三部分:

左圖(tu):數據分布情況或均值;

中圖:事后(hou)檢驗(yan)結果。當數據為兩組(zu)時不支(zhi)持做事后(hou)檢驗(yan),中(zhong)圖展示為誤差線;

右圖:各組間差異比較(jiao)結(jie)果P值(zhi),P值(zhi)越小,差異越顯著。

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如下圖(tu)(tu)(tu),以物種在(zai)兩組(zu)(zu)樣(yang)品中(zhong)豐度(du)情(qing)況為例。左(zuo)圖(tu)(tu)(tu)柱狀圖(tu)(tu)(tu)表示(shi)每(mei)個物種在(zai)不同樣(yang)品組(zu)(zu)中(zhong)豐度(du)均值(zhi),中(zhong)圖(tu)(tu)(tu)用誤差(cha)線展示(shi)95%置信區(qu)間(jian),右圖(tu)(tu)(tu)P值(zhi)為該(gai)物種在(zai)兩個樣(yang)品組(zu)(zu)中(zhong)差(cha)異(yi)顯著P值(zhi)。

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四、圖表設置


4.1、圖表類型

可切換左圖(tu)為提琴箱(xiang)線(xian)組(zu)合圖(tu)、提琴圖(tu)、箱(xiang)線(xian)圖(tu)或者柱形圖(tu)四種(zhong)圖(tu)表類型(xing)。

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五、數據設置


5.1、事后檢驗

可選(xuan)擇多(duo)組比(bi)較時(shi)是否做事后檢驗(yan)。當(dang)選(xuan)擇不做事后檢驗(yan)時(shi),圖只展示兩部(bu)分;兩組比(bi)較時(shi)不支持(chi)做事后檢驗(yan)。

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5.2、檢驗比較方法

  • 多(duo)組(zu)比較時提供(gong)Kruskal-Wallis test和ANOVA兩(liang)種方法;

  • 兩組(zu)比較(jiao)時提供Wilcoxon test和Student's test兩種方法;

  • 當(dang)選(xuan)擇(ze)系(xi)統推薦方(fang)法時,該(gai)工具(ju)會對數(shu)據進行正(zheng)態性檢驗,如果數(shu)據滿足正(zheng)態分(fen)布,兩組比較自(zi)動(dong)選(xuan)擇(ze)Student's test方(fang)法,多組比較自(zi)動(dong)選(xuan)擇(ze)ANOVA方(fang)法。

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