2023-02-15
今天我們要介紹的是基因密度圖，該圖表通過熱圖和密度圖組合的形式，來展示指定窗口內基因組DNA所含的基因數目或基因密度分布情況。具體圖表解析請聽我娓娓道來~
一、圖形解讀 熱圖 當統計方式選擇百分比：它展示每個窗口中與之有重疊的基因重疊部分長度之和 / 窗口大小。顏色越接近藍色表示基因分布越密集，反之基因分布越稀疏。 當統計方式選擇絕對(dui)數：它展示每個窗口中與之有重疊的基因個數。顏色越接近藍色表示基因分布越密(mi)集，反之基因分布越稀疏。 密度圖 展示基因密度趨勢。每個窗口對應的峰越高，表示基因分布越密集，反之基因分布越稀疏。密度圖起伏高低與熱圖顏色紅綠漸變相對應。
二、圖表調整參數 2.1、調整窗口大小 可設置將染色體劃分為指定大小的交疊窗口，來統計這些交疊窗口內基因的密度。 2.2、染色體間距設置 當染色體(ti)之間分布過于密集(ji)的時候，我們可以調整間距讓(rang)圖(tu)表(biao)更加舒展。 2.3、圖表顏色設置 可設置熱圖圖表與密度圖圖表的顏色。
三、數據要求 染色體文件 染色體文件第一列為染色體名稱，第二列為染色體起始位置，第三列為染色體終止位置。三列信息位置固定不可調整。 基因文件 基因文件第一列為基因所在染色體名稱，第二列為基因起始位置，第三列為基因終止位置。三列信息位置固定不可調整。
四、其他圖表 除基因密度圖外，我們還有適用于通用數據的組合密度圖，它的圖表樣式也是非常多樣化的，大家可以去嘗試一下。
