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微生物繪圖高頻圖表—差異檢驗箱線圖

2023-03-15

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差(cha)異統計檢(jian)驗是科學研究的重要組成部分,其分析結果可用于檢驗我們實驗結果的真實性、準確性可重復性。派森諾基因云推出的小工具——差異檢驗箱線圖,理論上可用于任何數據的差異檢驗分析。

例如,對于微生物組研究,我們可以用差異檢驗箱線圖對不同物種的豐度或功能基因的含量進行組間差異統計檢驗,還可以比較Alpha多樣性指數的差異大小等等,適用的繪圖場景很多,一起來看看吧。


一、圖(tu)表解(jie)讀

每組至(zhi)少(shao)3個樣本,每列數據對應一個箱(xiang)線圖子圖。

P值:展示Kruskal-Wallis非參數檢驗(yan)獲得的組間總(zong)體差異的P值。

*號:展(zhan)示各組(zu)之間Dunn's test事后兩(liang)兩(liang)比較獲得的(de)差異(yi)顯著性水平(*,P<0.05;**,P<0.01;***,P<0.001)

帶端點的橫線(xian):代表是橫線兩端的兩組(zu)之間的比較。

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二、數據獲得(de)途徑(jing)


1. 通過云分析系統獲取

如果您是云分析項目用戶,首先找到云分析模塊,進入微生物群落多樣性組成譜分析系統頁面,通過點擊【立即體驗】按鈕進入分析界面,找到【 序列處理分析  → 物種分類學注(zhu)釋 這一章節,分別下載數據文件和分組文件,然后在云圖匯中上傳使用。

0:06

分組文(wen)件下載與處理(li):

分組文件下載之后,需要刪除多余的樣本列數據,然后導出文件即可。:04


2. 其他途徑

當然,除(chu)了從分析系統(tong)導(dao)出數(shu)(shu)據,差異檢(jian)驗(yan)箱(xiang)線圖同樣支持其他途徑數(shu)(shu)據,只要符合(he)規定的繪圖數(shu)(shu)據格式即(ji)可。

第一列為樣本名稱,其他列為相關變量名稱

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分組(zu)文(wen)件:

 第一列為樣本名稱,第二列為分組名稱。調整分組文件中的分組順序,就等于調整圖形中分組的實際顯示順序。

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三、圖表(biao)調整

面板(ban)寬度

合(he)理地(di)調整圖表面板寬(kuan)度,可以展(zhan)示更好的圖表效果。