2023-03-24
今年年初派森諾迎來一位新的“悍將”，它就是Illumina NextSeqTM 2000！（）從下圖官方提供的測序系統性能參數來看，NextSeqTM 2000在PE300模式中有著比MiSeq更高的測序質量和測序通量，以及更短的測序周期，這讓我們在擴增子長片段研究中看到了更多的希望，也讓我們在測序領域中看到了更廣闊的前景！
接下來小編抑制不住激動的心情，向各位展示派森諾NextSeqTM 2000測序系統PE300實測數據及分析結果，讓我們一睹為快吧~
本(ben)次測試(shi)我們平行比(bi)較了相同文(wen)庫樣品分別在NextSeq_PE300與(yu)MiSeq_PE300以(yi)及NextSeq_PE300與(yu)NovaSeq_PE250中(zhong)的表現，總(zong)結(jie)為以(yi)下幾點(dian)：
一、數據質量
NextSeq下機(ji)數據R1端堿基質量分布圖
NextSeq下機數據R2端堿基質量分布圖
NextSeq測試數據質量表格
?從以(yi)上數(shu)據(ju)(ju)圖表可(ke)以(yi)發現，NextSeq_PE300結果數(shu)據(ju)(ju)質(zhi)量(liang)(liang)更高(gao)，堿基質(zhi)量(liang)(liang)Q30平均可(ke)以(yi)達(da)到(dao)90%左(zuo)右，遠(yuan)遠(yuan)高(gao)出官方提(ti)供標準(zhun)，數(shu)據(ju)(ju)利用率也會大幅(fu)提(ti)升；
二、數據分析結果展示
NovaSeq與NextSeq——門和屬水平物種相對豐度柱形圖
MiSeq與NextSeq——門和屬水平物種相對豐度柱形圖
?無論是門水平還是屬水平物種組成(cheng)分(fen)析結果，都可以看出，幾種測序平臺得(de)到的物種組成(cheng)及豐(feng)度分(fen)布保持(chi)高(gao)度一致，優勢(shi)物種分(fen)布無差別；
NovaSeq與NextSeq——Alpha多樣性分析結果
MiSeq與NextSeq——Alpha多樣性分析結果
?Alpha多樣性分析結果顯示，幾種測序平臺(tai)間樣品內微生(sheng)物(wu)的豐度(du)程(cheng)度(du)及多樣性程(cheng)度(du)基本一致(zhi)；
NovaSeq與NextSeq——Beta多樣性分析結果
MiSeq與NextSeq——Beta多樣性分析結果
?同(tong)(tong)時，Beta多樣性(xing)分析結果顯示，幾(ji)種(zhong)測序平臺的同(tong)(tong)一(yi)樣品物(wu)種(zhong)組成(cheng)及(ji)豐(feng)度(du)分布基本(ben)一(yi)致，且高度(du)相(xiang)關。
上述結(jie)果(guo)表明，作為Illumina測序(xu)系統(tong)中的(de)(de)擁有長度長模式的(de)(de)“新貴”，NextSeq平臺不僅能獲得(de)和(he)NovaSeq與MiSeq平臺高(gao)度一致的(de)(de)菌群組(zu)(zu)成結(jie)構，而(er)且在測序(xu)質(zhi)量上，也(ye)相比(bi)Q30>70%的(de)(de)MiSeq PE300模式官方質(zhi)控標準，有了大幅提升！更重要(yao)的(de)(de)是，NextSeq的(de)(de)測序(xu)通(tong)量至(zhi)少(shao)是MiSeq平臺的(de)(de)4倍以(yi)上，能輕而(er)易舉的(de)(de)實現大樣品(pin)量、高(gao)測序(xu)量的(de)(de)長片段(duan)樣品(pin)，對于低豐度物種的(de)(de)探測、以(yi)及(ji)菌群整體組(zu)(zu)成的(de)(de)分辨率也(ye)將更精細！
