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單細胞測序懸浮液制備專題-眼角膜組織

2023-08-03

前言

眼(yan)睛、一(yi)個美麗而神(shen)奇的器(qi)官。

人(ren)類眼(yan)睛內部的(de)(de)眼(yan)球(qiu)近似球(qiu)狀(zhuang),由(you)眼(yan)球(qiu)壁(bi)和眼(yan)內容物(wu)構(gou)成。人(ren)的(de)(de)眼(yan)球(qiu)壁(bi)由(you)外至內依(yi)次為纖維膜、血管膜、視網膜。角膜作為眼(yan)球(qiu)壁(bi)組(zu)成部分,是(shi)彎(wan)曲度大于眼(yan)球(qiu)外壁(bi)其他(ta)部分的(de)(de)透明圓盤狀(zhuang)結構(gou);正常人(ren)角膜中央薄(約(yue)0.5mm)周邊厚(約(yue)1.0mm);角膜由(you)無血管的(de)(de)結締組(zu)織構(gou)成;含(han)有豐富的(de)(de)神經(jing)末(mo)梢。


一、眼角膜結構簡介

人的(de)角(jiao)膜(mo)分(fen)為(wei)五(wu)層(ceng),由前向后(hou)依次為(wei):角(jiao)膜(mo)上皮(corneal epithelium)、前界層(ceng)(anterior limiting lamina )、角(jiao)膜(mo)基(ji)質(corneal stroma)、后(hou)界層(ceng)( posterior limiting lamina )、角(jiao)膜(mo)內皮(corneal endothelium)。

由于角膜(mo)的特殊(shu)構成,在(zai)解(jie)離過程(cheng)中(zhong)會出現細胞(bao)量較少且(qie)脆弱容(rong)易凋亡的情況(kuang)。經(jing)過測試優化,小(xiao)派提供(gong)一種高效、穩(wen)定的角膜(mo)組織解(jie)離方案,可獲得活(huo)性好、總(zong)量多、背景干凈的單細胞(bao)懸液。


二、解離方案

1、提(ti)前配(pei)制(zhi)復合酶解離(li)液(含木瓜蛋(dan)白酶、DNase Ⅰ等)及蛋(dan)白酶抑(yi)制(zhi)劑。

2、從組織保(bao)存液中取(qu)出角膜組織樣(yang)本,放入預冷的 DPBS中清洗。

3、將清洗后的(de)組(zu)織放(fang)到復合酶(mei)解離液(ye)中(zhong),用眼科(ke)剪將組(zu)織剪成碎片(pian)狀(zhuang),轉移至(zhi)含有(you)剩余解離液(ye)的(de)50ml離心管(guan)中(zhong),置于37℃水浴(yu)中(zhong)震蕩消(xiao)化 30-90 min,期間可使用巴氏吸管(guan)輕(qing)柔吹打組(zu)織,使其充分接觸解離液(ye)。

4、消化結束后,解離液通過 40um 細(xi)(xi)胞篩進行過濾,收集通過的(de)細(xi)(xi)胞濾液至(zhi)一(yi)新的(de)無菌離心管中。

5、4℃,300 xg 離(li)(li)心 5 min,棄上清。向細胞沉(chen)淀(dian)中加入含蛋白酶(mei)抑制(zhi)劑和DNaseⅠ的培養基(ji)重(zhong)懸細胞,再通過低(di)速離(li)(li)心,獲得(de)背景干(gan)凈的細胞。

6、加(jia)入適量(liang)DPBS(含 2%FBS)重懸(xuan)細胞(bao),取20uL細胞(bao)懸(xuan)液進行細胞(bao)計數(shu)和活力測定。(注:AOPI熒光計數(shu)、臺盼(pan)藍染色鏡(jing)檢(jian))


三、結果展示

角膜(mo)組織

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(注(zhu):新鮮組織(zhi)短(duan)時間(jian)內取出,盡快放入(ru)到(dao)組織(zhi)保存液,送到(dao)實驗(yan)室)

鏡檢(jian)結果

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單細(xi)胞(bao)(bao)懸(xuan)液背景干(gan)凈,細(xi)胞(bao)(bao)狀(zhuang)態(tai)好

活性、濃度檢測

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細胞(bao)活性95%,濃(nong)度655個/ul,總量在(zai)15W以上(shang)。

數據質控

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上圖是下機數(shu)(shu)據cellranger質控結果(guo),細胞(bao)捕獲數(shu)(shu)及基(ji)因(yin)數(shu)(shu)都(dou)符(fu)合前期需求(qiu)。