2024-01-03
時光飛(fei)逝(shi),遙(yao)想2023,仿(fang)佛就在(zai)上周!
不(bu)過不(bu)要悲傷!相信你也和小派一樣(yang),在過去的(de)一年(nian)收獲滿滿!這(zhe)里(li)派門為您精(jing)選了2023轉錄調控(kong)精(jing)品文章(zhang),一文囊(nang)括8大研究(jiu)方向(xiang)。看完這(zhe)篇,想必“組學文章(zhang)無從下筆”這(zhe)么(me)冰冷的(de)幾個字(zi),再也不(bu)能從你37℃的(de)嘴(zui)里(li)說出!
目(mu)錄
1、醫學
醫(yi)學研究前沿
中藥(yao)提取物/化合物處理
2、農(nong)學-動物
發育
脅迫
3、農學-植物
生長發育
抗逆
植(zhi)物-微生物
4、其他(ta)方向
食品
環境(jing)
1、醫(yi)學
醫學研究前沿
作(zuo)為(wei)人(ren)類健(jian)康及(ji)發(fa)展(zhan)的基(ji)礎,醫學(xue)(xue)研(yan)(yan)究(jiu)一直備受矚目(mu)。隨著組(zu)學(xue)(xue)技(ji)術的快速發(fa)展(zhan),幫助(zhu)研(yan)(yan)究(jiu)者(zhe)們解決了一個又(you)一個科學(xue)(xue)問題,尤(you)其(qi)在(zai)疾病(bing)研(yan)(yan)究(jiu)中,通(tong)過組(zu)學(xue)(xue)方(fang)法深(shen)入了解疾病(bing)發(fa)展(zhan)、治(zhi)療的分(fen)子機制,已經成(cheng)為(wei)了最(zui)便捷、常(chang)見(jian)的研(yan)(yan)究(jiu)手段之一。下面(mian)就通(tong)過小派精選的部分(fen)前沿研(yan)(yan)究(jiu)項目(mu)文(wen)章,帶你回顧2023的醫學(xue)(xue)研(yan)(yan)究(jiu)熱點!
1、
文(wen)章題目:BRD9-mediated chromatin remodeling suppresses osteoclastogenesis through negative feedback mechanism
期刊:Nature Communications
影(ying)響因子:16.6
技術(shu)手段:RNA-seq,ATAC-seq,Chip-seq等(deng)
技術(shu)路線:
部分研究結論:
研究發現(xian)髓系中BRD9缺失(shi)(shi)通(tong)過下調干擾(rao)素-β(IFN--β)信號(hao)來(lai)(lai)增強(qiang)破骨(gu)(gu)(gu)細(xi)胞譜系定(ding)型和骨(gu)(gu)(gu)吸收,BRD9與轉錄(lu)因子FOXP1相(xiang)互作(zuo)(zuo)用(yong),激(ji)活Stat1轉錄(lu),從而介(jie)導下游IFN-β信號(hao)通(tong)路激(ji)活。作(zuo)(zuo)者利用(yong)BRD9和柔性(xing)(xing)可注(zhu)射(she)絲光(guang)固化絲蛋白(bai)水凝(ning)膠(jiao)的藥理調節(jie)優勢,設計了(le)一種局部給(gei)藥系統,有效(xiao)減輕唑來(lai)(lai)膦(lin)酸(suan)(ZOL)相(xiang)關的頜骨(gu)(gu)(gu)壞死(ONJ),減輕脂多糖(LPS)誘導的局部侵襲性(xing)(xing)牙周(zhou)炎的急(ji)性(xing)(xing)骨(gu)(gu)(gu)丟失(shi)(shi)。這些結果證明(ming)了(le)BRD9在(zai)破骨(gu)(gu)(gu)細(xi)胞形成中的作(zuo)(zuo)用(yong)及其對骨(gu)(gu)(gu)疾病的治療潛(qian)力。
2、KSHV microRNA與擴(kuo)張(zhang)性心(xin)肌(ji)病關聯新機(ji)制(zhi)
文章題目:A Kaposi’s sarcoma-associated herpes virus-encoded microRNA contributes to dilated cardiomyopathy
期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy
影響因子:39.3
技術手段:RIP-seq,轉(zhuan)錄組分析等
部(bu)分研究內容(rong):
kshv-miR-K12-1-5pIFN信號通路(lu)示意圖
組(zu)學分析結果
部分(fen)研(yan)究結論(lun):
擴張型心肌(ji)病(bing)(DCM)是心臟(zang)移植的(de)主(zhu)要原因。通過microRNA (miRNA)陣列,在DCM患者中(zhong)(zhong)檢測到卡(ka)波西肉瘤相關皰疹病(bing)毒(KSHV)編碼的(de)miRNA KSHV-mir-k12-1-5p。測定696例DCM患者血漿中(zhong)(zhong)KSHV DNA載量和KSHV-mir-k12-1-5p水平,KSHV DNA血清(qing)陽性的(de)DCM患者因心血管原因或心臟(zang)移植而(er)死亡(wang)的(de)個體終點風險增加。在心臟(zang)組織中(zhong)(zhong),與健康供者相比(bi),DCM患者心臟(zang)中(zhong)(zhong)的(de)KSHV DNA負荷也有所增加。
此外,KSHV感(gan)染(ran)的(de)(de)心(xin)臟內(nei)皮細胞(bao)(bao)釋放的(de)(de)KSHV-miR-K12-1-5p可(ke)以破壞(huai)心(xin)肌細胞(bao)(bao)中的(de)(de)I型干擾素信(xin)號通路。我們(men)使用(yong)了(le)兩種KSHV-miR-K12-1-5p過表達模型(agomiR和重組腺相關病毒(du)(du))來探索KSHV編(bian)碼的(de)(de)miRNA在體內(nei)的(de)(de)作用(yong)。KSHV-miR-K12-1-5p加(jia)重已知(zhi)嗜心(xin)病毒(du)(du)誘導(dao)的(de)(de)心(xin)功(gong)能障礙和炎癥浸潤。總之,KSHV感(gan)染(ran)是DCM的(de)(de)危險因(yin)素,為DCM的(de)(de)發展提供了(le)涉及(ji)病毒(du)(du)及(ji)其miRNA的(de)(de)見解(jie)。
3、
文(wen)章題目:Biomimetic Convex Implant for Corneal Regeneration Through 3D Printing
期刊(kan):ADVANCED SCIENCE
影響(xiang)因子:15.1
技術(shu)手段:RNA-seq等
技術路線:
部分研究結論:
兔角膜上(shang)皮(pi)細(xi)胞(bao)(bao)(RCECs)在凹凸結構上(shang)更(geng)陡峭的曲(qu)率(lv)表(biao)面(mian)上(shang),細(xi)胞(bao)(bao)組織排列更(geng)整齊,細(xi)胞(bao)(bao)-底物(wu)粘附(fu)更(geng)緊密,這也可以通(tong)過有限元模擬和(he)信號通(tong)路分(fen)析得到驗證。相比于平面(mian)角膜植(zhi)(zhi)入(ru)(ru)體(ti)(ti)(ti),凸面(mian)植(zhi)(zhi)入(ru)(ru)體(ti)(ti)(ti)在體(ti)(ti)(ti)移植(zhi)(zhi)時與(yu)鄰近組織的貼合(he)更(geng)好(hao),細(xi)胞(bao)(bao)黏附(fu)更(geng)強(qiang),可在180天內加(jia)速(su)角膜上(shang)皮(pi)化,促(cu)進膠原纖維(wei)和(he)神(shen)經再(zai)生(sheng)。綜上(shang)所述,打(da)印的凸面(mian)角膜植(zhi)(zhi)入(ru)(ru)物(wu)可以促(cu)進角膜再(zai)生(sheng),為角膜損傷的治療(liao)提供一(yi)種新的轉化策略,這一(yi)發現(xian)加(jia)速(su)了3D打(da)印領域的進展。
4、
文章題目:TRPV1 regulates ApoE4-disrupted intracellular lipid homeostasis and decreases synaptic phagocytosis by microglia
期刊:Experimental & Molecular Medicine
影響因子(zi):12.8
技術手(shou)段(duan):RNA-seq,脂質(zhi)組等
技術路線(xian):
部分研究結論:
闡明APOE4誘(you)發(fa)阿(a)爾(er)(er)茲海(hai)默病(bing)的分子機制(zhi)和(he)細胞(bao)途徑(jing),對預(yu)防和(he)治(zhi)愈阿(a)爾(er)(er)茲海(hai)默病(bing)十分重(zhong)要。本研究發(fa)現(xian),用辣椒(jiao)素激活TRPV1可(ke)(ke)逆轉ApoE4誘(you)導的小膠(jiao)質(zhi)(zhi)細胞(bao)免疫(yi)功能(neng)(neng)障礙(ai)和(he)神經(jing)元(yuan)自噬損傷(shang),另外TRPV1基(ji)因(yin)缺失(shi)加重(zhong)了ApoE4小鼠的識別記憶障礙(ai)和(he)tau病(bing)理。總(zong)而言之,TRPV1調(diao)節脂質(zhi)(zhi)代謝可(ke)(ke)減輕(qing)ApoE4等位(wei)基(ji)因(yin)的影(ying)響,這可(ke)(ke)能(neng)(neng)是一種潛在的阿(a)爾(er)(er)茨海(hai)默癥治(zhi)療(liao)方法(fa)。
5、
文章(zhang)題目:Oxidized mitochondrial DNA induces gasdermin D oligomerization in systemic lupus erythematosus
期刊(kan):Nature Communications
影響因子:16.6
技(ji)術(shu)手段(duan):RNA-seq等(deng)
技術路線(xian):
部分研究結論:
在SLE患者(zhe)血(xue)清和(he)IFN-γ體外(wai)刺激后,中(zhong)性(xing)粒細(xi)胞(bao)(bao)釋(shi)放核(he)DNA和(he)線粒體DNA以及溶解(jie)性(xing)細(xi)胞(bao)(bao)死亡(wang)所需(xu)的(de)成孔蛋白GSDMD。從機制上講(jiang),SLE患者(zhe)血(xue)清體外(wai)刺激后,FcγR的(de)激活下調了SeRpinb1,導致(zhi)caspase-1/caspase-11的(de)自(zi)發(fa)激活和(he)GSDMD裂解(jie)為GSDMD-N。此(ci)外(wai),mtDNA氧化(hua)(hua)促進了GSDMD-N寡聚化(hua)(hua)和(he)細(xi)胞(bao)(bao)死亡(wang)。GSDMD是SLE患者(zhe)和(he)健康人中(zhong)性(xing)粒細(xi)胞(bao)(bao)與(yu)ICs孵育后從低(di)密度(du)粒細(xi)胞(bao)(bao)釋(shi)放細(xi)胞(bao)(bao)外(wai)mtDNA所必需(xu)的(de)。使用降(jiang)植烷誘(you)導的(de)狼瘡模(mo)型,實驗發(fa)現中(zhong)性(xing)粒細(xi)胞(bao)(bao)特異性(xing)Gsdmd缺乏癥(zheng)小鼠(shu)或Gsdmd抑制劑(ji)雙硫侖治療后,疾病嚴重(zhong)程度(du)顯(xian)著降(jiang)低(di)。總之,我們(men)的(de)研究強調了氧化(hua)(hua)mtDNA在誘(you)導GSDMD寡聚化(hua)(hua)和(he)孔形成中(zhong)的(de)重(zhong)要(yao)作(zuo)用。這些發(fa)現也(ye)表明(ming)GSDMD可能是SLE的(de)一個可能的(de)治療靶點。
6、
文章題目:ovalently Grafted Biomimetic Matrix Reconstructs the Regenerative Microenvironment of the Porous Gradient Polycaprolactone Scaffold to Accelerate Bone Remodeling
期(qi)刊:Small
影響因子:13.3
技(ji)術手(shou)段:蛋白組(zu)等
技術路(lu)線:
部分研究結論:
本研(yan)究通過模仿(fang)骨(gu)(gu)基(ji)質(zhi)的軟硬結合(he)結構(gou),利(li)用多巴胺介導(dao)的仿(fang)生(sheng)細胞(bao)外基(ji)質(zhi)錨定聚(ju)多巴胺包(bao)被的3DP PCL支架(jia)(BM-g-DPCL),構(gou)建(jian)了一(yi)(yi)種化(hua)學(xue)鍵(jian)合(he)結構(gou)。它促進了干(gan)細胞(bao)在(zai)(zai)體(ti)外的遷(qian)移(yi)、增殖和(he)成骨(gu)(gu)分化(hua),并加速(su)(su)了體(ti)內內源性干(gan)細胞(bao)的募集和(he)快(kuai)速(su)(su)血(xue)管生(sheng)成。植入后,能在(zai)(zai)骨(gu)(gu)組織與種植體(ti)之間融合(he),誘導(dao)骨(gu)(gu)基(ji)質(zhi)沉(chen)積。蛋(dan)白質(zhi)組學(xue)證實細胞(bao)因子(zi)粘附、生(sheng)物礦化(hua)、快(kuai)速(su)(su)血(xue)管化(hua)和(he)細胞(bao)外基(ji)質(zhi)形成是臨床尺(chi)寸兔顱骨(gu)(gu)缺損重建(jian)滿(man)意的主(zhu)要因素。該(gai)策(ce)略為無生(sheng)長因子(zi)/細胞(bao)骨(gu)(gu)再生(sheng)支架(jia)提供了一(yi)(yi)種可選的設計思路。
其(qi)他精(jing)選案(an)例
物種 | 組學 | 期刊 |
文章(zhang)題目(mu) | ||
人 | 轉錄組 | Advanced Science |
小鼠 | 轉錄組 | Journal of Hazardous Materials |
小鼠 | 轉錄組+代謝組+TMT蛋白組 | Pharmacological Research |
人 | 轉錄組(zu)+單細(xi)胞(bao)轉錄組(zu) | Science Translational Medicine |
Diverse rescue potencies of p53 mutations to ATO are predetermined by intrinsic mutational properties p53突變對ATO的不同(tong)拯(zheng)救能力是(shi)由(you)其固有的突變特性決(jue)定的 | ||
人(ren) | 轉(zhuan)錄組 | International Journal of Biological Sciences |
NUF2 Drives Cholangiocarcinoma Progression and Migration via Inhibiting Autophagic Degradation of TFR1 NUF2通過(guo)抑制(zhi)TFR1的自噬降解驅動膽管癌的進(jin)展和遷移 | ||
大鼠 | 轉錄組 | Critical Care |
Altered intestinal microbiome and metabolome correspond to the clinical outcome of sepsis 腸道微生物組(zu)和代謝組(zu)的(de)改變與敗血癥的(de)臨(lin)床結果相對應 | ||
人 | 轉錄(lu)組 | Experimental Cell Research |
Hydrogen sulfide protects retinal pigment epithelium cells against ferroptosis through the AMPK- and p62-dependent non-canonical NRF2-KEAP1 pathway 硫化氫(qing)通過AMPK-和(he)p62依賴(lai)的非典(dian)型NRF2-KEAP1途徑保(bao)護視網膜色素上皮細(xi)胞(bao)免(mian)受(shou)鐵死亡 | ||
小鼠 | 轉(zhuan)錄組 | Cell Transplantation |
Human Menstrual Blood–Derived Endometrial Stem Cells Promote Functional Recovery by Improving the Inflammatory Microenvironment in a Mouse Spinal Cord Injury Model 人(ren)經血來源的子宮(gong)內膜干細(xi)胞通(tong)過改善小鼠脊(ji)髓損傷(shang)模型(xing)的炎癥(zheng)微(wei)環境促進(jin)功能恢(hui)復(fu) | ||
人 | 轉錄組 | Journal of Cancer |
LncRNA HOTAIR Enhances Epithelial-to-mesenchymal Transition to Promote the Migration and Invasion of Liver Cancer by Regulating NUAK1 via Epigenetic Inhibition miR-145-5p Expression LncRNA HOTAIR通過表觀遺傳抑制miR-145-5p表達(da)調控NUAK1,增強上(shang)皮(pi)-間質轉化促(cu)進肝(gan)癌遷(qian)移和(he)侵襲 | ||
小鼠 | 轉錄(lu)組+16s+代謝組 | Bioengineering & Translational Medicine |
The efficacy of anti-proteolytic peptide R7I in intestinal inflammation, function, microbiota, and metabolites by multi-omics analysis in murine bacterial enteritis 通(tong)過多組學分析抗蛋白水(shui)解肽R7I對(dui)小(xiao)鼠細菌(jun)性腸(chang)炎腸(chang)道炎癥、功能、微生物群和代(dai)謝物的影響 | ||
人 | 轉錄組(zu) | Cell Reports |
Glutamylation of an HIV-1 protein inhibits the immune response by hijacking STING HIV-1蛋(dan)白的谷氨酰化通(tong)過劫(jie)持STING抑制免疫反應(ying) | ||
大(da)鼠 | 脂質組+轉錄組 | GENES AND IMMUNITY |
αCGRP deficiency aggravates pulmonary fibrosis by activating the PPARγ signaling pathway αCGRP缺失通過激活(huo)PPARγ信號通路加重肺(fei)纖維化 | ||
小鼠 | 轉錄組 | Life Sciences |
ARF1 maintains intestinal homeostasis by modulating gut microbiota and stem cell function ARF1通過調節腸(chang)道(dao)微生物群和(he)干細(xi)胞功(gong)能維持腸(chang)道(dao)內(nei)穩(wen)態 | ||
小鼠 | 轉錄(lu)組 | Experimental Cell Research |
Increased OIT3 in macrophages promotes PD-L1 expression and hepatocellular carcinogenesis via NF-κB signaling 巨(ju)噬(shi)細胞中OIT3的升高通過NF-κB信號通路促進PD-L1表達和(he)肝細胞癌(ai)變(bian) | ||
小(xiao)鼠 | 轉錄(lu)組 | Immunobiology |
TLR-2 agonist Pam3CSK4 has no therapeutic effect on visceral leishmaniasis in BALB/c mice and may enhance the pathogenesis of the disease TLR-2激(ji)動(dong)劑Pam3CSK4對BALB/c小鼠內臟利什曼病無治療作用(yong),可能增(zeng)強其發病機制 | ||
小鼠 | 轉錄組 | Food Science and Human Wellness |
Per1/Per2 double knockout transcriptome analysis reveals circadian regulation of hepatic lipid metabolism Per1/Per2雙敲除轉錄組分析揭示了肝(gan)臟脂質(zhi)代謝的(de)晝夜節律調(diao)節 | ||
小鼠 | 脂質組+16s | Molecules |
Hyperoside Nanomicelles Alleviate Atherosclerosis by Modulating the Lipid Profile and Intestinal Flora Structure in High-Fat-Diet-Fed Apolipoprotein-E-Deficient Mice 金絲桃(tao)苷納米膠束通過調節高(gao)脂(zhi)飲食喂養的載脂(zhi)蛋白e缺乏小鼠的脂(zhi)質譜和腸道菌群結構來(lai)緩解動脈粥(zhou)樣硬化 |
中藥提取物/化合物處理
組學技(ji)術作(zuo)為(wei)優良的(de)技(ji)術手段,廣(guang)泛應用于(yu)評價藥物(wu)、化合物(wu)對生物(wu)體帶來(lai)的(de)療(liao)效或傷害(hai),從分子水平挖掘物(wu)質處理后對機(ji)體產(chan)生的(de)影響。小派(pai)整理了(le)2023一些相關實驗設(she)計的(de)研(yan)究案例,帶你快速(su)get經(jing)典文章(zhang)思(si)路。
1、
文章題目:Chlorogenic Acid Ameliorates Post-Infectious Irritable Bowel Syndrome by Regulating Extracellular Vesicles of Gut Microbes
期刊:Advanced Science
影響因子:15.1
技術手段:非(fei)靶向代(dai)謝組(GC?TOF?MS),蛋白組,16s等
技術路線:
部分研究結論:
本(ben)文研究了綠原(yuan)酸(CGA)在緩解大(da)鼠PI-IBS中的(de)(de)作(zuo)用,這是一(yi)種(zhong)具有(you)多(duo)種(zhong)藥理特(te)性的(de)(de)天然化合(he)物。直腸(chang)(chang)(chang)給(gei)藥CGA通(tong)(tong)過調(diao)節腸(chang)(chang)(chang)道(dao)(dao)菌群(qun)及其(qi)代(dai)謝(xie)產物緩解PI-IBS,闡明腸(chang)(chang)(chang)道(dao)(dao)菌群(qun)在PI-IBS發(fa)病機(ji)制(zhi)中起(qi)關鍵作(zuo)用。添(tian)加CGA顯著提高了糞(fen)便(bian)中產酸擬桿菌的(de)(de)豐(feng)度和甘(gan)氨(an)酸水平。原(yuan)核細(xi)(xi)胞(bao)和真核細(xi)(xi)胞(bao)之(zhi)間(jian)的(de)(de)生(sheng)物信(xin)號交換主要(yao)是通(tong)(tong)過細(xi)(xi)胞(bao)外(wai)囊(nang)泡(EVs)的(de)(de)分泌,甘(gan)氨(an)酸結(jie)構(gou)改變Bacteroides acidifaciens 胞(bao)外(wai)囊(nang)泡(EVs)并富集(ji)胞(bao)外(wai)囊(nang)泡中的(de)(de)功(gong)能蛋白;甘(gan)氨(an)酸誘導的(de)(de)EVs通(tong)(tong)過減(jian)輕腸(chang)(chang)(chang)道(dao)(dao)臟器炎癥和超敏反應,維持(chi)黏(nian)膜屏障功(gong)能從而減(jian)輕PI-IBS。因此,CGA通(tong)(tong)過腸(chang)(chang)(chang)道(dao)(dao)微(wei)生(sheng)物群(qun)及其(qi)代(dai)謝(xie)產物介導來緩解PI-IBS。本(ben)研究提出了一(yi)種(zhong)腸(chang)(chang)(chang)道(dao)(dao)微(wei)環(huan)境與宿主之(zhi)間(jian)信(xin)號交換的(de)(de)新(xin)機(ji)制(zhi)。
2、
文章題目:Structure and hepatoprotective activity of Usp10/NF-kB/Nrf2 pathway-related Morchella esculenta polysaccharide
期刊:Carbohydrate Polymers
影響因子:11.2
技術手段:代謝組(zu),16s,蛋(dan)白組(zu)等
技(ji)術路線:
部分研究結論:
從羊肚(du)菌中提取并(bing)純化(hua)了水(shui)溶性羊肚(du)菌多(duo)糖2(MEP2),分子(zi)量為(wei)959kDa的(de)MEP2具有a→4)-α-D-Glcp-(1→葡(pu)聚糖主鏈,并(bing)且該分支在H-6位(wei)置被α-D-Glcp-(1→4)-α-D-Glcp-(1→殘(can)基和(he)α-D-Glcp-(1→殘(can)基。在慢性酒精(jing)(jing)誘導的(de)肝損傷小(xiao)鼠中,MEP2通(tong)過Usp10/Nrf2/NF-kB信號通(tong)路調節血(xue)清(qing)代謝(xie)產物和(he)腸道(dao)微生物群的(de)水(shui)平,以抑制炎癥(zheng)反應和(he)氧化(hua)應激,減輕(qing)肝損傷。這(zhe)些(xie)數據支持了MEP2作為(wei)酒精(jing)(jing)性肝損傷潛在治療策(ce)略(lve)的(de)應用。
3、從摩(mo)氏假(jia)單(dan)胞菌923中(zhong)提取的天(tian)然(ran)抗生(sheng)素吡唑三嗪對植物(wu)病(bing)原細菌和真菌具有抑制作用
文章題(ti)目(mu):The natural pyrazolotriazine pseudoiodinine from Pseudomonas mosselii 923 inhibits plant bacterial and fungal pathogens
期刊(kan):Nature Communications
影響因子:16.6
技術手段:基(ji)因(yin)組,轉錄組等
部分研究內容:
GacA和CsrA介導(dao)吡(bi)唑三(san)嗪(qin)的生物(wu)合成
部分研究結論:
本文報(bao)道了從(cong)水稻(dao)根(gen)際土壤中(zhong)分(fen)離到一(yi)株(zhu)(zhu)具(ju)有特異性抑制植(zhi)物(wu)細菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)性病(bing)(bing)原菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)黃單胞菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)和真菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)病(bing)(bing)原菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)稻(dao)瘟病(bing)(bing)菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)生(sheng)長的假單胞菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)923株(zhu)(zhu)。該抗菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)化(hua)合物(wu)經高分(fen)辨(bian)率質譜、核磁(ci)共振和單晶(jing)x射線衍射純化(hua)并鑒(jian)定(ding)為(wei)pseudoiodinine。全(quan)基因(yin)組隨機(ji)突變、轉錄組分(fen)析和生(sheng)化(hua)分(fen)析確定(ding)pseudoiodinine生(sheng)物(wu)合成(cheng)簇為(wei)psdABCDEFG。通過(guo)優化(hua)發酵(jiao)培養(yang)基,過(guo)表達生(sheng)物(wu)合成(cheng)操縱子,去除CsrA結(jie)合位點,pseudoiodinine產量增加(jia)22.4倍。菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)株(zhu)(zhu)923和植(zhi)物(wu)中(zhong)純化(hua)的pseudoiodinine均(jun)能抑制病(bing)(bing)原菌(jun)(jun)(jun)(jun)(jun)而不(bu)影(ying)響水稻(dao)寄主(zhu),表明pseudoiodinine可用于植(zhi)物(wu)病(bing)(bing)害(hai)的防治。
其他精選案例
物種 | 組學 | 期刊 |
文章題目(mu) | ||
小鼠(shu) | 轉錄組+宏(hong)基因組 | Cell Metabolism |
Hyodeoxycholic acid alleviates non-alcoholic fatty liver disease through modulating the gut-liver axis 羥(qian)脫氧膽(dan)酸通過調(diao)節腸(chang)-肝軸(zhou)減輕非酒精性脂肪(fang)肝疾病 | ||
大鼠 | 代(dai)謝組+16s | Journal of Functional Foods |
Analysis of the alleviating effect of black bean peel anthocyanins on type 2 diabetes based on gut microbiota and serum metabolome 基于腸道菌群和血清代(dai)謝(xie)組分析黑(hei)豆皮花(hua)青素對2型糖尿病的緩(huan)解作(zuo)用(yong) | ||
大鼠 | 全轉錄組 | European Journal of Pharmacology |
Bioinformatics analysis of ceRNA regulatory network of baicalin in alleviating pathological joint alterations in CIA rats 黃芩苷ceRNA調控網絡減輕CIA大鼠(shu)病(bing)理(li)性關節改變(bian)的生物(wu)信(xin)息學分(fen)析 | ||
小鼠 | 轉錄(lu)組 | International Immunopharmacology |
Novel antidepressant-like properties of the fullerenol in an LPS-induced depressive mouse model 富(fu)勒烯(xi)醇在LPS誘導的(de)抑郁小鼠模型(xing)中的(de)新型(xing)抗抑郁特性(xing) | ||
大鼠(shu) | 轉錄(lu)組 | Food Chemistry |
Investigation of isoflavone constituents from tuber of Apios americana Medik and its protective effect against oxidative damage on RIN-m5F cells 北美土圞兒(er)塊莖中異黃酮成分及其對RIN-m5F細胞氧化損傷的保(bao)護作用(yong) | ||
雞 | 轉(zhuan)錄(lu)組 | Metabolites |
Magnolol as a Protective Antioxidant Alleviates Rotenone-Induced Oxidative Stress and Liver Damage through MAPK/mTOR/Nrf2 in Broilers 厚(hou)樸酚(fen)作為保護(hu)性(xing)抗氧(yang)化劑通過MAPK/mTOR/Nrf2緩解魚(yu)藤酮誘(you)導(dao)的肉仔雞氧(yang)化應激(ji)和肝臟損(sun)傷 | ||
白(bai)色念珠菌(jun) | 轉錄組+蛋白(bai)組 | International Journal of Antimicrobial Agents |
Miltefosine exhibits fungicidal activity through oxidative stress generation and Aif1 activation in Candida albicans 米特氟辛在白色念珠(zhu)菌中(zhong)通過氧化應(ying)激(ji)(ji)產生(sheng)和Aif1激(ji)(ji)活(huo)(huo)表現出(chu)殺真菌活(huo)(huo)性 | ||
白(bai)色念珠菌(jun) | 轉錄組 | Microbiology Spectrum |
Hexyl-Aminolevulinate Ethosomes: a Novel Antibiofilm Agent Targeting Zinc Homeostasis in Candida albicans 己基(ji)氨基(ji)乙酰酸體:一種針對白色念珠菌鋅穩態的(de)新型抗(kang)生素(su)膜劑 | ||
意大利青霉 | TMT標記蛋白(bai)組 | Food Quality and Safety |
Integrative cytology and proteome alterations unravel the multitarget effect of a novel alkaloid antofine against Penicillium italicum 綜合細胞學和蛋(dan)白質組學改變揭示了一種新型生物(wu)堿安(an)托芬(fen)對(dui)意大利青霉的多靶點效應 |
2、農學(xue)-動(dong)物(wu)
發育
農(nong)口動(dong)物/昆蟲研究受(shou)限?文章影響因子(zi)大打(da)折扣?不存(cun)在的(de)!看小派準備的(de)2023發育類(lei)研究專(zhuan)題(ti),無論是好思路,還(huan)是新技(ji)術,雙手(shou)奉上(shang)!還(huan)不快收藏起來!
1、
文章題(ti)目:Multi- and Transgenerational Developmental Impairments Are Induced by Decabromodiphenyl Ethane (DBDPE) in Zebrafish Larvae
期刊:Environmental Science & Technology
影響因子:11.4
技術手段(duan):全(quan)基因(yin)組甲(jia)基化,RNA-seq等
技術路(lu)線:
部分研究結論:
本(ben)研(yan)究(jiu)結(jie)(jie)果(guo)證(zheng)實(shi),DBDPE生(sheng)命(ming)周期暴(bao)露會導致后代多代和(he)跨代發(fa)育障礙,并增加(jia)疾病易感(gan)性。此(ci)外,DBDPE暴(bao)露引發(fa)了(le)(le)三代表(biao)(biao)觀遺傳和(he)基(ji)因(yin)表(biao)(biao)達譜(pu)的變化。生(sheng)物信息學分析表(biao)(biao)明,與(yu)能(neng)量代謝和(he)神經發(fa)育相關的過(guo)(guo)程明顯中斷。此(ci)外,通(tong)過(guo)(guo)機(ji)器學習獲得了(le)(le)一(yi)系(xi)列轉錄和(he)甲基(ji)化水平的候(hou)選基(ji)因(yin),這些候(hou)選基(ji)因(yin)涵蓋了(le)(le)主要受影(ying)響的途(tu)徑(jing),生(sheng)化指標(biao)、神經遞(di)質水平和(he)運動行為結(jie)(jie)果(guo)都證(zheng)明了(le)(le)該觀點。
1、母體免疫因子與生(sheng)殖(zhi)系統(tong)微生(sheng)物對后代發(fa)育的影響
文章題目:Maternal effects drive intestinal development beginning in the embryonic period on the basis of maternal immune and microbial transfer in chickens
期刊:Microbiome
影(ying)響因子:15.5
技術(shu)手段:RNA-seq,16s等
部分研究(jiu)內容:
微生物多樣性分析(xi)
轉錄組分(fen)析
部分研究結論:
該(gai)研(yan)究表(biao)明,母體(ti)(ti)免疫優勢對鳥類(lei)胚胎期(qi)(qi)開始(shi)的(de)(de)(de)后代健康有積極影響。研(yan)究結(jie)果還(huan)表(biao)明,適應性母體(ti)(ti)效應可能(neng)通(tong)過(guo)高水(shui)平的(de)(de)(de)母體(ti)(ti)免疫因子的(de)(de)(de)垂(chui)直轉移(yi)和(he)(he)由增強(qiang)的(de)(de)(de)母體(ti)(ti)免疫形(xing)成的(de)(de)(de)生(sheng)殖(zhi)(zhi)系統微(wei)生(sheng)物群的(de)(de)(de)垂(chui)直轉移(yi)來(lai)實(shi)現(xian)。綜上所述,通(tong)過(guo)改善(shan)產(chan)蛋期(qi)(qi)種(zhong)鳥的(de)(de)(de)營(ying)養(yang)和(he)(he)健康管理(li),提高種(zhong)鳥的(de)(de)(de)免疫力,可以實(shi)現(xian)種(zhong)鳥養(yang)殖(zhi)(zhi)場(chang)(chang)、孵化場(chang)(chang)和(he)(he)養(yang)殖(zhi)(zhi)場(chang)(chang)這三條家禽養(yang)殖(zhi)(zhi)產(chan)業鏈的(de)(de)(de)雙贏。母體(ti)(ti)生(sheng)殖(zhi)(zhi)系統中的(de)(de)(de)微(wei)生(sheng)物可能(neng)是促(cu)進動物健康的(de)(de)(de)有用資源。
其他精選案例
豬(zhu) | smart-seq2 | JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE |
豬 | 轉錄(lu)組 | International Journal of Molecular Sciences |
Transcriptomics and Selection Pressure Analysis Reveals the Influence Mechanism of PLIN1 Protein on the Development of Small Size in Min Pigs 轉錄組學(xue)和選(xuan)擇壓力分析揭示了PLIN1蛋(dan)白對小型豬發育的影響(xiang)機制 | ||
蜚蠊 | 比較轉錄組 | Molecular Phylogenetics and Evolution |
Advances in the understanding of Blattodea evolution: Insights from phylotranscriptomics and spermathecae 昆蟲進化的研究進展:來自(zi)系統轉錄組學和(he)精子(zi)科(ke)的見解 | ||
冰川山蝶 | 有參(can)轉錄組 | International Journal of Molecular Sciences |
Diapause-Linked Gene Expression Pattern and Related Candidate Duplicated Genes of the Mountain Butterfly Parnassius glacialis (Lepidoptera: Papilionidae) Revealed by Comprehensive Transcriptome Profiling 綜合轉錄組分(fen)析揭示高山蝶(鱗翅目:鳳蝶科)滯育相關基因表(biao)達模式及(ji)相關候選重復基因 |
脅迫
環境的(de)(de)變(bian)化(hua)同樣會對機體(ti)產生較大影響,隨(sui)著(zhu)環境惡(e)化(hua)、污染(ran)嚴重(zhong)、全(quan)球(qiu)變(bian)暖等問(wen)題(ti)的(de)(de)加劇(ju)下,研究(jiu)動物在相應環境中的(de)(de)耐受程度,與受到的(de)(de)影響,也(ye)是(shi)當今的(de)(de)重(zhong)要(yao)研究(jiu)課題(ti)。如果您也(ye)是(shi)這(zhe)樣的(de)(de)研究(jiu)課題(ti),又對實(shi)驗設計無從下手,不(bu)如先(xian)從做個組學開(kai)始(shi),幫(bang)您迅(xun)速聚(ju)焦關鍵(jian)信息,為下游(you)實(shi)驗提供指(zhi)導思(si)路。
1、
文章題(ti)目:Triphenyl phosphate induced reproductive toxicity through the JNK signaling pathway in Caenorhabditis elegans
期刊:Journal of Hazardous Materials
影響因子(zi):13.6
技術手段(duan):RNA-seq等
技術路線:
部分研究結論:
本研究表明(ming),暴露于TPHP會影響秀麗(li)隱桿(gan)(gan)線蟲(chong)的(de)生(sheng)殖(zhi)(zhi)能力,包括增加性(xing)(xing)(xing)腺細(xi)胞(bao)凋亡(wang)的(de)數量,減(jian)少子宮內發育胚胎的(de)數量以(yi)及減(jian)少后代的(de)數量。此外,通(tong)(tong)過轉錄組分析、qRT-PCR實驗和(he)突變體(ti)驗證方法證實了TPHP暴露會通(tong)(tong)過JNK信號通(tong)(tong)路誘導(dao)秀麗(li)隱桿(gan)(gan)線蟲(chong)的(de)生(sheng)殖(zhi)(zhi)毒(du)(du)性(xing)(xing)(xing)。其中(zhong),JNK信號通(tong)(tong)路中(zhong)kgb-2和(he)vhp-1基(ji)因的(de)缺失(shi)在秀麗(li)隱桿(gan)(gan)線蟲(chong)暴露于TPHP后生(sheng)殖(zhi)(zhi)性(xing)(xing)(xing)能下降中(zhong)起著至(zhi)關(guan)重要(yao)的(de)作用。這些發現有助于深入了解芳基(ji)OPFRs在無(wu)脊椎動物體(ti)內的(de)生(sheng)物積累性(xing)(xing)(xing),對芳基(ji)OPFRs的(de)毒(du)(du)性(xing)(xing)(xing)評價具有重要(yao)意(yi)義,并可為尋找毒(du)(du)性(xing)(xing)(xing)更小、危害更小的(de)阻燃(ran)劑提供(gong)基(ji)礎的(de)毒(du)(du)性(xing)(xing)(xing)和(he)毒(du)(du)理機制(zhi)數據(ju)。
2、
文章題目:Polystyrene nanospheres-induced hepatotoxicity in swamp eel (Monopterus albus): From biochemical, pathological and transcriptomic perspectives
期刊:Science of the Total Environment
影響因子:9.8
技(ji)術手段:RNA-seq等(deng)
技術(shu)路線:
部分研究結論:
本(ben)研究通過綜合分(fen)析,從分(fen)子、細(xi)胞和(he)組織水平(ping)研究了(le)PS-NPs慢(man)性暴露對(dui)黃鱔的(de)毒(du)理學效應和(he)機制。研究結果揭示了(le)MPs誘(you)導肝毒(du)性的(de)物理化(hua)學和(he)分(fen)子機制,并(bing)強(qiang)調了(le)淡水養殖中(zhong)MPs的(de)生態風(feng)險評估。
3、
文(wen)章(zhang)題目:Geosmin disrupts energy metabolism and locomotor behavior of zebrafish in early life stages
期刊:Science of the Total Environment
影響因子:9.8
技術手段:RNA-seq,代謝組等
技術路線:
部分研究結論:
本研(yan)究通過生化參數檢測(ce)以及(ji)轉錄組(zu)和代謝(xie)組(zu)分析表明,土(tu)臭素(su)可能會導(dao)致水生動(dong)物(wu)的(de)線粒體應(ying)激,這為我們(men)提供了對土(tu)臭素(su)影響能量代謝(xie)潛(qian)在(zai)(zai)機制的(de)新見解。也提醒我們(men),在(zai)(zai)未來的(de)研(yan)究中應(ying)注意(yi)慢(man)性暴露(lu)后的(de)發育毒性。
其他(ta)精選案例
黑斑(ban)原鮡 | 轉錄(lu)組 | Aquaculture Reports |
Liver transcriptome analysis revealing response to high-temperature stress in Glyptosternum maculatum (Sisoridae: Siluriformes) 肝(gan)臟(zang)轉錄組分(fen)析(xi)揭示(shi)斑狀(zhuang)雕胸骨對高溫脅迫的響應 | ||
大黃魚(yu) | TMT標記蛋白組 | Aquaculture |
Proteomic and transcriptomic analysis of large yellow croaker (Larimichthys crocea) during early development under hypoxia and acidification stress 缺(que)氧和(he)酸化脅迫下大黃魚早期發育(yu)的蛋白質組學和(he)轉(zhuan)錄組學分(fen)析 | ||
黃鱔 | 轉(zhuan)錄組 | Science of the Total Environment |
Dietary polystyrene nanoplastics exposure alters hepatic glycolipid metabolism, triggering inflammatory responses and apoptosis in Monopterus albus 飲食中的聚苯乙烯納米塑(su)料(liao)暴露會改(gai)變(bian)黃鱔(shan)的肝糖脂(zhi)代謝,引(yin)發(fa)炎癥反應和細(xi)胞(bao)凋亡 | ||
人 | 轉錄組 | journal of applied toxicology |
Inorganic arsenic exposure promotes malignant progression by HDAC6-mediated down-regulation of HTRA1 無機砷暴(bao)露通過hdac6介導的HTRA1下調促進惡性進展 | ||
小(xiao)鼠 | 轉錄組 | Molecules |
BDE-47 Induces Immunotoxicity in RAW264.7 Macrophages through the Reactive Oxygen Species-Mediated Mitochondrial Apoptotic Pathway BDE-47通過活性(xing)氧介導的線粒體凋亡(wang)途(tu)徑(jing)誘導RAW264.7巨噬(shi)細(xi)胞的免疫(yi)毒(du)性(xing) |
3、農學-植物(wu)
生長發育
生長(chang)(chang)發育是(shi)植物研(yan)究(jiu)的基石,無論是(shi)育種、抗逆、轉基因等研(yan)究(jiu),都離不開(kai)植物生長(chang)(chang)發育過程(cheng)的知識作為(wei)理論研(yan)究(jiu)基礎。這里小派精(jing)選了相關的項目文章,帶您看(kan)(kan)看(kan)(kan)2023年植物生長(chang)(chang)發育方(fang)向(xiang)還有哪些(xie)新收獲(huo)!
1、RLI2通過促進翻譯(yi)機制的組裝來調(diao)節擬南芥雌性配子體和胚(pei)胎的發育
文(wen)章題(ti)目:RLI2 regulates Arabidopsis female gametophyte and embryo development by facilitating the assembly of the translational machinery
期刊:Cell Reports
影響因子:8.8
技(ji)術手段:蛋(dan)白組,RNA-seq等
研究路線(xian):
部分研究結論:
本(ben)研究報(bao)道了RNase L抑制劑2/ATP-BINDING CASSETTE E2 (RLI2/ABCE2)調控擬南芥(jie)的(de)(de)(de)翻譯(yi)(yi)。RLI2的(de)(de)(de)零突變是(shi)配(pei)(pei)子(zi)體(ti)(ti)和(he)胚(pei)胎致(zhi)命的(de)(de)(de),而RLI2的(de)(de)(de)敲(qiao)(qiao)低則(ze)引起多(duo)效性(xing)(xing)發(fa)育缺陷。RLI2與幾種翻譯(yi)(yi)相關因子(zi)相互作用(yong)。RLI2的(de)(de)(de)敲(qiao)(qiao)低會影響參與翻譯(yi)(yi)調控和(he)胚(pei)胎發(fa)育的(de)(de)(de)一組蛋(dan)白(bai)質(zhi)的(de)(de)(de)翻譯(yi)(yi)效率,表(biao)明RLI2在這些過程中起著(zhu)關鍵作用(yong)。特(te)別是(shi),RLI2敲(qiao)(qiao)低突變體(ti)(ti)表(biao)現(xian)出與生(sheng)長素信號和(he)雌性(xing)(xing)配(pei)(pei)子(zi)體(ti)(ti)和(he)胚(pei)胎發(fa)育有關的(de)(de)(de)基(ji)因表(biao)達減(jian)少。因此,研究結(jie)果表(biao)明,RLI2促進了翻譯(yi)(yi)機制的(de)(de)(de)組裝,并間接調節了生(sheng)長素信號傳(chuan)導,從而調節了植物的(de)(de)(de)生(sheng)長發(fa)育。
2、
文章題目:Unexpected growth promotion of Chlorella sacchrarophila triggered by herbicides DCMU
期(qi)刊:Journal of Hazardous Materials
影響因子:13.6
技(ji)術手段:RNA-seq等
技術路(lu)線:
部分研究結論:
本(ben)研究結果表明,DCMU對小(xiao)球藻(zao)(zao)光(guang)自養的(de)(de)損害大(da)于混(hun)合營養。此外(wai),低濃(nong)度(du)的(de)(de)DCMU (20 - 80 μg/L) 能促進(jin)小(xiao)球藻(zao)(zao)的(de)(de)混(hun)合營養生(sheng)(sheng)長,特(te)別是在高(gao)(gao)輻照下(xia)。機制(zhi)分析表明,DCMU可以通過抑制(zhi)PSII中(zhong)的(de)(de)電子傳遞來減(jian)輕(qing)光(guang)損傷,維持小(xiao)球藻(zao)(zao)較高(gao)(gao)的(de)(de)葉綠素含(han)量,從而(er)提高(gao)(gao)小(xiao)球藻(zao)(zao)對葡萄糖(tang)的(de)(de)利(li)用,最(zui)終促進(jin)小(xiao)球藻(zao)(zao)的(de)(de)生(sheng)(sheng)長。
其(qi)他精(jing)選案(an)例
物種 | 組學 | 期(qi)刊 |
文章題目(mu) | ||
櫻桃 | 轉錄組 | Frontiers in Plant Science |
Strigolactones modulate stem length and diameter of cherry rootstocks through interaction with other hormone signaling pathways 獨(du)腳金(jin)內酯通過與(yu)其他(ta)激(ji)素信號通路的(de)相互作用(yong)調節(jie)櫻(ying)桃砧(zhen)木(mu)的(de)莖長和直徑(jing) | ||
木茼蒿 | 轉錄組+代謝組 | Scientia Horticulturae |
Integrated transcriptomics and metabolomics analyses provide insights into the mechanisms of capitulum architecture in Argyranthemum frutescens (Asteraceae) 整合轉錄組(zu)學和代謝組(zu)學分析(xi)為木茼蒿(菊(ju)科)頭狀花(hua)序結(jie)構機制提供了新的見解 | ||
桉樹 | 轉錄組(zu) | Tree Physiology |
Natural annual transcriptome dynamics of Eucalyptus reveal seasonal adaptation of tropical/sub-tropical trees 桉樹自然年轉錄(lu)組動態揭示了熱(re)帶/亞熱(re)帶樹木的(de)季節適應性(xing) |
抗逆
植(zhi)物在自(zi)然環(huan)(huan)境中(zhong)生(sheng)(sheng)長(chang),常(chang)遇到(dao)一些不利(li)于(yu)(yu)植(zhi)物體代謝和生(sheng)(sheng)長(chang)發育(yu)的環(huan)(huan)境因素,無論是來(lai)自(zi)自(zi)然環(huan)(huan)境的非生(sheng)(sheng)物脅(xie)迫(po)、生(sheng)(sheng)物脅(xie)迫(po),還是由人類(lei)活(huo)動為植(zhi)物生(sheng)(sheng)長(chang)帶(dai)來(lai)的影響與(yu)脅(xie)迫(po)。對于(yu)(yu)植(zhi)物抗逆的研究,有助(zhu)于(yu)(yu)在未(wei)來(lai)幫助(zhu)植(zhi)物更好的適應環(huan)(huan)境,茁壯成長(chang)。下(xia)面通過小派的2023植(zhi)物抗逆組學文章,帶(dai)你看看“植(zhi)物警長(chang)”如何抵抗“黑惡勢力”!
1、
文章題目:Differentially-expressed genes related to glutathione metabolism and heavy metal transport reveals an adaptive, genotype-specific mechanism to Hg2+ exposure in rice (Oryza sativa L.)
期刊:Environmental Pollution
影響因子:8.9
技術手段:RNA-seq等
技術路線:
部分研究結論:
在汞(gong)脅迫(po)下,兩種(zhong)水(shui)(shui)稻基(ji)(ji)因(yin)型的(de)活(huo)性氧(H2O2)的(de)產(chan)生增加了(le)MDA含量,從(cong)而(er)加劇(ju)了(le)過氧化(hua)(hua)對膜的(de)損(sun)傷。然(ran)而(er),H655中抗(kang)氧化(hua)(hua)酶(mei)和(he)GSH代謝相關基(ji)(ji)因(yin)的(de)上(shang)(shang)調表達(da)(da),使H655的(de)抗(kang)氧化(hua)(hua)酶(mei)活(huo)性(CAT、SOD)和(he)GSH含量高(gao)于H767,從(cong)而(er)增強了(le)H655對Hg的(de)耐受性。另一方(fang)面,GST和(he)PCS的(de)高(gao)表達(da)(da)催化(hua)(hua)H655中Hg與GSH結合,從(cong)而(er)誘導轉(zhuan)運(yun)體基(ji)(ji)因(yin)YLS2在H655中上(shang)(shang)調表達(da)(da)。增加了(le)該水(shui)(shui)稻基(ji)(ji)因(yin)型的(de)汞(gong)轉(zhuan)運(yun)和(he)積累(lei)能(neng)力。因(yin)此,H655的(de)地上(shang)(shang)部組織中汞(gong)的(de)積累(lei)量超過H767(圖6)。本(ben)研究(jiu)通過對汞(gong)脅迫(po)下水(shui)(shui)稻品種(zhong)的(de)生理和(he)分(fen)子特征的(de)研究(jiu),揭示了(le)水(shui)(shui)稻對汞(gong)脅迫(po)的(de)適應機制,有利于制定培育耐汞(gong)水(shui)(shui)稻品種(zhong)的(de)新策略。
2、
文章題目:Effects of cadmium on transcription, physiology, and ultrastructure of two tobacco cultivars
期刊:Science of the Total Environment
影響因子:9.8
技(ji)術(shu)手段:RNA-seq等(deng)
技術(shu)路(lu)線:
部分研究結論:
該研究發現鎘(ge)(ge)脅迫(po)(po)下NC55中(zhong)NtNRAMP5基(ji)因的表(biao)達(da)量(liang)(liang)顯(xian)著高(gao)(gao)(gao)于(yu)(yu)K326,導致NC55葉片(pian)(pian)中(zhong)積(ji)累了更多的鎘(ge)(ge)。同時,NtNRAMP3a, NtNRAMP3b和NtNRAMP6在(zai)NC55中(zhong)的高(gao)(gao)(gao)表(biao)達(da)增加了NC55對鎘(ge)(ge)的敏感性(xing)(xing)。另外,鎘(ge)(ge)脅迫(po)(po)下K326中(zhong)POD活性(xing)(xing)較高(gao)(gao)(gao),ROS和MDA積(ji)累量(liang)(liang)較低,ABA含量(liang)(liang)較高(gao)(gao)(gao),耐鎘(ge)(ge)相關轉(zhuan)錄(lu)因子(zi)(WRKY、MYB、NAC、bHLH)表(biao)達(da)量(liang)(liang)較高(gao)(gao)(gao),提(ti)高(gao)(gao)(gao)了K326對鎘(ge)(ge)的耐受(shou)性(xing)(xing)。導致K326根系和葉片(pian)(pian)超微結構受(shou)鎘(ge)(ge)損傷程度均(jun)低于(yu)(yu)NC55,氮代(dai)謝和光合作用速率均(jun)高(gao)(gao)(gao)于(yu)(yu)NC55。最終導致鎘(ge)(ge)脅迫(po)(po)下K326生(sheng)物量(liang)(liang)顯(xian)著高(gao)(gao)(gao)于(yu)(yu)NC55。這項(xiang)研究闡(chan)明了煙草葉片(pian)(pian)鎘(ge)(ge)積(ji)累和鎘(ge)(ge)耐受(shou)性(xing)(xing)的機理(li),為培育低鎘(ge)(ge)積(ji)累、高(gao)(gao)(gao)鎘(ge)(ge)耐受(shou)性(xing)(xing)煙草品種奠定了理(li)論(lun)基(ji)礎。
其他精選案例
物種 | 組學 | 期刊 |
文章題目 | ||
玉米 | 轉錄組+蛋白組 | Genes |
Proteome and Ubiquitylome Analyses of Maize Endoplasmic Reticulum under Heat Stress 熱脅迫下玉米內質網蛋(dan)白質組(zu)和(he)泛素組(zu)分析(xi) | ||
月牙藻 | 代謝組 | Journal of Environmental Sciences |
Metabolomic profiles in a green alga ( Raphidocelis subcapitata ) following erythromycin treatment: ABC transporters and energy metabolism 紅(hong)霉(mei)素處(chu)理后月牙(ya)藻(zao)(Raphidocelis subcapitata)的代謝(xie)組學特征:ABC轉(zhuan)運蛋白和能量代謝(xie) | ||
枳 | 全轉錄組 | Scientia Horticulturae |
Whole transcriptome analysis of trifoliate orange (Poncirus trifoliata (L.) Raf.) under osmotic stress 枳(Poncirus trifoliata, L.)全轉錄(lu)組分析)在滲透脅迫下 | ||
櫻桃 | 轉錄(lu)組 | Scientia Horticulturae |
Strigolactone and salicylic acid regulate the expression of multiple stress-related genes and enhance the drought resistance of cherry rootstocks 獨腳金(jin)內酯和水(shui)楊酸(suan)調節(jie)多(duo)種脅迫(po)相關基(ji)因(yin)的表達,增(zeng)強了櫻桃砧木的抗(kang)旱(han)性 | ||
苦草(cao) | 轉錄組+16s | Environmental and Experimental Botany |
Ecological effects and molecular mechanisms of single and coexisting PFOS and Cu exposure on submerged macrophytes and periphytic biofilms in aquatic environments 全氟辛烷磺酸和銅單一及共存(cun)暴(bao)露對(dui)水(shui)生(sheng)環(huan)境中(zhong)淹(yan)沒植(zhi)(zhi)物(wu)和周圍植(zhi)(zhi)物(wu)生(sheng)物(wu)膜的生(sheng)態(tai)效應及分(fen)子機制 | ||
甜菜 | 轉錄組 | Journal of Soil Science and Plant Nutrition |
Nitrogen Application Promotes DroughtStressed Sugar Beet Growth by Improving Photosynthesis, Osmoregulation, and Antioxidant Defense 施氮(dan)通過改善(shan)光合(he)作用、滲透(tou)調節和抗氧(yang)化防(fang)御促進干旱脅迫下甜菜(cai)的生(sheng)長 | ||
大豆(dou) | 轉(zhuan)錄(lu)組 | Plants |
Overexpression of lncRNA77580 Regulates Drought and Salinity Stress Responses in Soybean lncRNA77580過表達調(diao)控大豆(dou)干旱和鹽脅迫響應 |
植物-微生物
提起微(wei)生物(wu)(wu),植(zhi)物(wu)(wu)絕對對他“又愛又恨”!一方面(mian)很多(duo)微(wei)生物(wu)(wu)會(hui)引起植(zhi)物(wu)(wu)的(de)真菌、細菌病害,令植(zhi)物(wu)(wu)痛不欲生;另一方面(mian),又有(you)(you)很多(duo)微(wei)生物(wu)(wu)具有(you)(you)促(cu)生作用,與植(zhi)物(wu)(wu)相(xiang)輔相(xiang)成。這里小(xiao)派(pai)歸納了2023年植(zhi)物(wu)(wu)與微(wei)生物(wu)(wu)領域的(de)精品(pin)研究,一起來(lai)品(pin)品(pin)?
1、番茄免疫識別(bie)的(de)二重性(xing)及(ji)青枯(ku)菌多聚半乳糖醛酸外切酶(mei)PehC的(de)毒力活性(xing)
文(wen)章題目:Duality of immune recognition by tomato and virulence activity of the Ralstonia solanacearum exo-polygalacturonase PehC
期刊:Plant Cell
影響因子:11.6
技術手段(duan):RNA-seq等
技術路線:
部分研究結論:
作(zuo)者(zhe)提出了(le)PehC在(zai)(zai)(zai)青(qing)枯(ku)(ku)菌(jun)(jun)侵(qin)染(ran)中發揮多(duo)重(zhong)功能(neng)的(de)工作(zuo)模(mo)(mo)(mo)型(xing):在(zai)(zai)(zai)侵(qin)染(ran)過程中,青(qing)枯(ku)(ku)菌(jun)(jun)分泌PehA水解(jie)寄主植(zhi)物細胞壁的(de)重(zhong)要成(cheng)分果膠,生成(cheng)OGs。OGs作(zuo)為(wei)一種DAMP,可(ke)被(bei)植(zhi)物細膜(mo)表面受體WAK1識別(bie)(bie)并觸發DTI。為(wei)了(le)逃避這種識別(bie)(bie),青(qing)枯(ku)(ku)進化出PehB和(he)(he)PehC來降解(jie)OG,生成(cheng)二聚體GalA2和(he)(he)單體GalA。這些單糖(tang)可(ke)以在(zai)(zai)(zai)侵(qin)染(ran)早期(qi)作(zuo)為(wei)碳源被(bei)青(qing)枯(ku)(ku)菌(jun)(jun)利(li)用,幫(bang)助其在(zai)(zai)(zai)木(mu)質部中定殖和(he)(he)生長。同時為(wei)了(le)抵抗青(qing)枯(ku)(ku)菌(jun)(jun)的(de)入侵(qin),番茄進一步進化出了(le)RLK類型(xing)的(de)模(mo)(mo)(mo)式識別(bie)(bie)受體來識別(bie)(bie)PehC,激活(huo)PTI免疫。該(gai)研究提出了(le)番茄與青(qing)枯(ku)(ku)菌(jun)(jun)共同進化的(de)模(mo)(mo)(mo)型(xing),為(wei)植(zhi)物與病原菌(jun)(jun)之間的(de)競賽提供了(le)新的(de)模(mo)(mo)(mo)式。
2、葉際微(wei)生物組誘導宿主代(dai)謝(xie)防(fang)御水(shui)稻(dao)稻(dao)曲(qu)病
文章題目:Phyllosphere microbiome induces host metabolic defence against rice false-smut disease
期刊(kan):Nature Microbiology
影(ying)響因子(zi):28.3
技術手段:RNA-seq, 16s等
部分研(yan)究內容:
微生(sheng)物組分析
轉錄組(zu)分(fen)析
部分研究結論:
本研究確定了(le)水稻(dao)(dao)和(he)常駐微生(sheng)(sheng)物群之間相(xiang)互作用的(de)(de)代謝(xie)防御,以防御全球流(liu)行的(de)(de)植(zhi)(zhi)物病原體Ustilaginoidea virens,這(zhe)導致了(le)稻(dao)(dao)曲病。通(tong)過(guo)對(dui)16S和(he)轉錄組(zu)測序數據的(de)(de)分(fen)析,確定了(le)富含疾(ji)病抑(yi)制穗的(de)(de)關鍵微生(sheng)(sheng)物類(lei)(lei)群,特別是乳酸(suan)(suan)菌和(he)曲霉,將這(zhe)些(xie)數據與(yu)(yu)初(chu)級代謝(xie)分(fen)析、宿主(zhu)基(ji)因(yin)組(zu)編(bian)輯和(he)微生(sheng)(sheng)物分(fen)離(li)物移植(zhi)(zhi)實驗(yan)相(xiang)結合,表明具有(you)這(zhe)些(xie)類(lei)(lei)群的(de)(de)植(zhi)(zhi)物能夠以宿主(zhu)支鏈氨(an)基(ji)酸(suan)(suan)(BCAA)依賴(lai)的(de)(de)方式抵抗U. virens感染。亮(liang)氨(an)酸(suan)(suan)是一種主(zhu)要的(de)(de)支鏈氨(an)基(ji)酸(suan)(suan),通(tong)過(guo)過(guo)量(liang)產生(sheng)(sheng)H2O2誘導細胞凋亡樣死亡,從(cong)而抑(yi)制了(le)U. virens的(de)(de)致病性(xing)。此外,初(chu)步田間試驗(yan)表明,亮(liang)氨(an)酸(suan)(suan)可與(yu)(yu)化學殺(sha)菌劑(ji)聯合使用,劑(ji)量(liang)減少50%,但(dan)效果與(yu)(yu)較高濃度的(de)(de)殺(sha)菌劑(ji)相(xiang)似。這(zhe)些(xie)發現可能有(you)助于保護作物免受全球范圍內流(liu)行的(de)(de)稻(dao)(dao)曲病。
其他精選案例
物種(zhong) | 組學 | 期刊 |
文章題目 | ||
枳-叢(cong)枝菌根 | 轉(zhuan)錄組+miRNA | PLANT CELL AND ENVIRONMENT |
Integrated miRNA-mRNA analysis reveals candidate miRNA family regulating arbuscular mycorrhizal symbiosis of Poncirus trifoliata 綜合miRNA-mrna分析揭示了(le)調控枳叢(cong)枝菌根共生(sheng)的候選miRNA家族 | ||
庫爾勒香(xiang)梨-枯草芽孢桿菌(jun) | 轉錄組 | Postharvest Biology and Technology |
Investigating the resistance responses to Alternaria brassicicola in ’Korla’ fragrant pear fruit induced by a biocontrol strain Bacillus subtilis Y2 研(yan)究枯草芽孢桿(gan)菌Y2對“庫(ku)爾勒”香梨果實的抗(kang)性反(fan)應 | ||
玉(yu)米(mi)-哈茨木(mu)霉 | 轉錄組+miRNA | Journal of Fungi |
Identification of miRNAs Involved in Maize-Induced Systemic Resistance Primed by Trichoderma harzianum T28 agains Cochliobolus heterostrophus 哈茨木霉T28誘導玉米對異養褐蝗系(xi)統性抗性相關mirna的鑒定(ding) | ||
番茄-尖(jian)孢(bao)鐮刀菌(jun) | 轉錄組 | Phytopathology Research |
Enhancing tomato resistance by exploring early defense events against Fusarium wilt disease 探索番茄對枯萎病的早(zao)期防(fang)御事(shi)件,增強番茄的抗(kang)性 |
4、其他方向
食品
組學技術手段不(bu)局限于應用(yong)在(zai)基礎生(sheng)命(ming)科學研(yan)究(jiu)領域(yu),也可以在(zai)實際生(sheng)產應用(yong)中發(fa)揮(hui)廣泛作用(yong),在(zai)果實保鮮、貯(zhu)藏、品質與食(shi)品風味(wei)研(yan)究(jiu)中,都(dou)有他(ta)們不(bu)小的貢獻。這里小派帶(dai)你看看,組學還能(neng)這么用(yong)!
1、
文(wen)章題目:Weissella confusa M1 as an adjunct culture assists microbial succession and flavor formation in gray sufu
期刊:LWT - Food Science and Technology
影響因子:6
技術手段(duan):風味組(zu),宏基因組(zu)等
技術路線:
部分研究結論:
本文首(shou)次從(cong)微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)學(xue)和(he)風味(wei)組的(de)角(jiao)度研究了(le)新菌(jun)株(zhu)Weissella confusa M1作(zuo)為青腐(fu)(fu)乳(ru)輔助(zhu)培(pei)養(yang)物(wu)(wu)(wu)(wu)的(de)適用(yong)性(xing)。結果表明(ming),與(yu)(yu)自然(ran)發酵腐(fu)(fu)乳(ru)相比,接(jie)種(zhong)M1菌(jun)改善了(le)腐(fu)(fu)乳(ru)的(de)風味(wei)、色澤、質地(di)和(he)口(kou)感(gan)。M1增加了(le)13種(zhong)游(you)離氨基酸的(de)含量,特別是(shi)天冬氨酸和(he)谷氨酸,并通過(guo)參與(yu)(yu)氨基酸和(he)碳(tan)水化合物(wu)(wu)(wu)(wu)的(de)運輸和(he)代謝,推動了(le)發酵過(guo)程中(zhong)(zhong)微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)群落(luo)的(de)多(duo)(duo)樣性(xing)和(he)動態。接(jie)種(zhong)M1后產生(sheng)(sheng)了(le)許多(duo)(duo)揮發性(xing)化合物(wu)(wu)(wu)(wu),其中(zhong)(zhong)正(zheng)己(ji)醛和(he)二甲基硫醚對青腐(fu)(fu)乳(ru)的(de)風味(wei)最(zui)重要。在(zai)M1發酵過(guo)程中(zhong)(zhong),腸桿菌(jun)和(he)魏斯氏菌(jun)與(yu)(yu)13種(zhong)關(guan)(guan)鍵風味(wei)化合物(wu)(wu)(wu)(wu)呈正(zheng)相關(guan)(guan)。腸桿菌(jun)和(he)四(si)球菌(jun)與(yu)(yu)多(duo)(duo)種(zhong)氨基酸的(de)產生(sheng)(sheng)有(you)關(guan)(guan)。這些(xie)發現證明(ming)M1是(shi)一種(zhong)很(hen)有(you)前途的(de)加工輔助(zhu)培(pei)養(yang)物(wu)(wu)(wu)(wu)。
2、低溫保(bao)存(cun)過程中草菇采后品質的促進
文章題目:Lysine and threonine supplementation promotes postharvest quality of Volvariella volvacea mushroom during low-temperature preservation via maintenance of the citrate cycle
期刊(kan):LWT - Food Science and Technology
影(ying)響因子:6
技術手段:RNA-seq,代謝組等
部分研究(jiu)內容:
代謝組和(he)轉錄組分(fen)析結果
部分研究結論:
結(jie)果(guo)表明,L345-0044噴霧(wu)處(chu)理(li)對草(cao)菇具有48 h的(de)(de)(de)抗(kang)(kang)凍效果(guo),增加蛋白(bai)質翻譯、蛋白(bai)質輸出、N-聚(ju)糖生物合(he)成和賴(lai)氨(an)酸代謝(xie)(xie)是抗(kang)(kang)冷脅迫的(de)(de)(de)必要條件(jian)。乙(yi)酰輔酶(mei)A的(de)(de)(de)合(he)成通過賴(lai)氨(an)酸或蘇氨(an)酸代謝(xie)(xie)參與維(wei)持(chi)檸檬酸循(xun)環。抑制與UBEV2相互作用(yong)的(de)(de)(de)APC/C可能參與了通路活性(xing)的(de)(de)(de)上調。通過補充L-賴(lai)氨(an)酸或L-蘇氨(an)酸來延(yan)長草(cao)菇的(de)(de)(de)低(di)溫保存。進(jin)一步的(de)(de)(de)努(nu)力應該針對改(gai)進(jin)現有的(de)(de)(de)低(di)溫保存方法的(de)(de)(de)商業應用(yong)。
其他精選案例(li)
物(wu)種 | 組學 | 期刊 |
文章題目 | ||
獼(mi)猴(hou)桃 | 轉錄組(zu)(zu)+代謝組(zu)(zu) | Postharvest Biology and Technology |
The mechanism of gibberellins treatment suppressing kiwifruit postharvestripening processes by transcriptome analysis 赤霉(mei)素處(chu)理(li)抑制獼猴桃采(cai)后成熟過程的轉錄組分析機制 | ||
蘑菇 | 轉錄組 | Journal of Agricultural and Food Chemistry |
LCysteine Treatment Delayed the Quality Deterioration of Fresh-Cut Button Mushrooms by Regulating Oxygen Metabolism, Inhibiting Water Loss, and Stimulating Endogenous H2S Production L-半胱氨酸處理(li)通過調(diao)節氧代謝、抑制(zhi)水(shui)分流(liu)失和刺激(ji)內源(yuan)性(xing)H2S產生(sheng)延緩了鮮(xian)切(qie)蘑(mo)菇的品質惡(e)化 | ||
金針(zhen)菇 | 轉錄組 | Postharvest Biology and Technology |
Integrated multi-omic analyses on yellow Flammulina filiformis cultivar reveal postharvest oxidative damage responses 綜合多(duo)組學(xue)分析揭示黃色金針(zhen)菇采后氧化損傷反應(ying) |
環境
環(huan)(huan)境性質復雜,對于(yu)環(huan)(huan)境的研(yan)究(jiu)往(wang)往(wang)需(xu)要大量的數據分析(xi)與挖(wa)掘。組學作為(wei)可以直接獲(huo)取大規模(mo)實驗數據的技術手(shou)段之一,非常適(shi)用于(yu)環(huan)(huan)境相關研(yan)究(jiu),同(tong)時結合多(duo)組學方法,可以從多(duo)角(jiao)度、多(duo)維(wei)度挖(wa)掘數據,解析(xi)環(huan)(huan)境信息。
1、
文章題目:Natural Algaecide Sphingosines Identi?ed in Hybrid Straw Decomposition Driven by White-Rot Fungi
期刊:Advanced Science
影響因子:15.1
技術(shu)手(shou)段:RNA-seq,代(dai)謝組等
技術路線(xian):
部分研究結論:
該研究(jiu)結合轉錄(lu)組(zu)和(he)非(fei)靶向(xiang)代謝組(zu)學方法,發現了一類(lei)新(xin)型高效化(hua)感抑藻(zao)劑——鞘(qiao)(qiao)氨(an)醇(chun)類(lei)天然分(fen)子。初步研究(jiu)發現,鞘(qiao)(qiao)氨(an)醇(chun)類(lei)物質可破壞藻(zao)類(lei)光合作用系(xi)(xi)統(tong)和(he)抗氧(yang)(yang)化(hua)系(xi)(xi)統(tong)、影響藻(zao)類(lei)對(dui)二氧(yang)(yang)化(hua)碳(tan)的(de)吸收、誘導藻(zao)類(lei)細胞凋亡。預期未來可為藻(zao)華化(hua)感控制提供新(xin)的(de)解決方案。
2、協同微(wei)(wei)生物相(xiang)互作用驅動孔隙(xi)環境中(zhong)的空間分布
文(wen)章題目:Cooperative microbial interactions drive spatial segregation in porous environments
期刊:Nature Communications
影響因(yin)子(zi):16.6
技術(shu)手段:基因組,轉錄(lu)組,非靶(ba)向(xiang)代謝組,16S rRNA擴(kuo)增(zeng)子等
部分研(yan)究內容:
生物膜形成過程中的空間(jian)生態位劃分(fen)
群落組裝期間的(de)外(wai)代謝產(chan)物(wu)池動態
部分研究結論:
本研究(jiu)采用(yong)(yong)微流控(kong)芯片來表(biao)征多孔(kong)的(de)(de)(de)(de)(de)地下(xia)環(huan)境(jing),并表(biao)明自(zi)由(you)生(sheng)活和(he)(he)形成生(sheng)物膜(mo)(mo)(mo)的(de)(de)(de)(de)(de)細菌(jun)之(zhi)間的(de)(de)(de)(de)(de)合作(zuo)微生(sheng)物相(xiang)互(hu)作(zuo)用(yong)(yong)觸發了(le)主動(dong)的(de)(de)(de)(de)(de)空(kong)間隔離,從(cong)而(er)促(cu)進(jin)了(le)它們(men)各自(zi)在(zai)(zai)隔離的(de)(de)(de)(de)(de)微棲(qi)息(xi)(xi)地中(zhong)的(de)(de)(de)(de)(de)優(you)勢(shi)地位。在(zai)(zai)最初的(de)(de)(de)(de)(de)定植過(guo)(guo)程中(zhong),自(zi)由(you)生(sheng)活和(he)(he)形成生(sheng)物膜(mo)(mo)(mo)的(de)(de)(de)(de)(de)微生(sheng)物從(cong)混合的(de)(de)(de)(de)(de)浮(fu)游接(jie)種物中(zhong)分(fen)離出來,占(zhan)據環(huan)境(jing)流體和(he)(he)顆粒表(biao)面。與(yu)競爭導致的(de)(de)(de)(de)(de)空(kong)間排斥相(xiang)反,主動(dong)的(de)(de)(de)(de)(de)空(kong)間隔離是由(you)合作(zuo)相(xiang)互(hu)作(zuo)用(yong)(yong)引(yin)起的(de)(de)(de)(de)(de),這提(ti)高了(le)生(sheng)物膜(mo)(mo)(mo)和(he)(he)浮(fu)游生(sheng)物種群的(de)(de)(de)(de)(de)適合度。我們(men)進(jin)一步表(biao)明,自(zi)由(you)生(sheng)活的(de)(de)(de)(de)(de)節桿菌(jun)通過(guo)(guo)清(qing)除生(sheng)物膜(mo)(mo)(mo)抑制劑D-氨(an)基(ji)酸誘導表(biao)面定植,并從(cong)形成生(sheng)物膜(mo)(mo)(mo)的(de)(de)(de)(de)(de)菌(jun)株分(fen)泌的(de)(de)(de)(de)(de)公(gong)共(gong)產物中(zhong)獲益。總的(de)(de)(de)(de)(de)來說,該研究(jiu)結果揭示(shi)了(le)合作(zuo)微生(sheng)物相(xiang)互(hu)作(zuo)用(yong)(yong)如(ru)何有(you)助于微生(sheng)物在(zai)(zai)分(fen)離的(de)(de)(de)(de)(de)微棲(qi)息(xi)(xi)地中(zhong)共(gong)存,并推動(dong)地下(xia)生(sheng)物膜(mo)(mo)(mo)群落演(yan)替。
3、海洋鹵代(dai)有(you)機(ji)(ji)物呼吸菌(OHRB)協同交互及其對鹵代(dai)有(you)機(ji)(ji)物(HOCs)的適應機(ji)(ji)制
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文章題目:Marine Dehalogenator and Its Chaperones: Microbial Duties and Responses in 2,4,6-Trichlorophenol Dechlorination
期刊(kan):Environmental Science & Technology
影響因子:11.4
技術手段(duan):宏(hong)蛋(dan)白(bai)組,代(dai)謝組,宏(hong)基(ji)因組等
技術(shu)路線:
部分研究結論:
本研(yan)究(jiu)(jiu)鑒定到一株新的(de)(de)非專性海洋(yang)(yang)OHRB,該(gai)菌具多個保守基序相似卻系統發育多樣性的(de)(de)RdhA,這對(dui)研(yan)究(jiu)(jiu)海洋(yang)(yang)OHRB在地理和(he)遺傳上的(de)(de)基因流動具有重要意義。研(yan)究(jiu)(jiu)還(huan)揭(jie)示了Dendrosporobacter、Methanosarcina 和(he)Peptococcaceae DCH的(de)(de)基因組信息(xi),并構建和(he)驗證(zheng)了它(ta)們(men)的(de)(de)代(dai)謝(xie)(xie)通路。結(jie)果表明,TCP脫(tuo)氯培(pei)養物(wu)中產甲烷菌的(de)(de)發生(sheng)(sheng)主要與消耗代(dai)謝(xie)(xie)中間體有關,而不是(shi)輔助(zhu)(zhu)脫(tuo)氯。此外(wai),研(yan)究(jiu)(jiu)還(huan)闡(chan)明了Dendrosporobacter在輔助(zhu)(zhu)TCP脫(tuo)氯中的(de)(de)重要作用,以(yi)及它(ta)對(dui)TCP的(de)(de)強適應性,為HOCs如何塑造(zao)微生(sheng)(sheng)物(wu)群(qun)落(luo)結(jie)構和(he)功(gong)能提(ti)供深入的(de)(de)見解。綜上所述,本研(yan)究(jiu)(jiu)加深了我(wo)們(men)對(dui)海洋(yang)(yang)OHRB (rdhAs)、輔助(zhu)(zhu)微生(sheng)(sheng)物(wu)以(yi)及微生(sheng)(sheng)物(wu)對(dui)HOC適應機制的(de)(de)理解。
4、
文章題(ti)目:Aerobic Degradation of the Antidiabetic Drug Metformin by Aminobacter sp. Strain NyZ550
期刊(kan):Environmental Science & Technology
影(ying)響因(yin)子:11.4
技術(shu)手段:基因組,轉錄組,代謝組等
技術路(lu)線:
部分研究結論:
研(yan)究(jiu)首先調研(yan)了全(quan)國12個污(wu)水(shui)處理廠污(wu)水(shui)樣(yang)品中(zhong)的(de)(de)(de)二(er)(er)甲(jia)雙(shuang)胍(gua)及(ji)其(qi)(qi)代(dai)(dai)謝(xie)產物(wu)(wu)的(de)(de)(de)污(wu)染情(qing)況,在所有(you)(you)樣(yang)品中(zhong)均檢測(ce)(ce)到(dao)(dao)μg/L水(shui)平的(de)(de)(de)二(er)(er)甲(jia)雙(shuang)胍(gua)及(ji)其(qi)(qi)代(dai)(dai)謝(xie)產物(wu)(wu)的(de)(de)(de)總累積濃度(du),同時檢測(ce)(ce)了污(wu)水(shui)樣(yang)品中(zhong)的(de)(de)(de)土著微生(sheng)物(wu)(wu)對(dui)于(yu)二(er)(er)甲(jia)雙(shuang)胍(gua)的(de)(de)(de)降解能力,最終分離到(dao)(dao)一(yi)(yi)株(zhu)能以(yi)二(er)(er)甲(jia)雙(shuang)胍(gua)為唯一(yi)(yi)碳、氮(dan)源生(sheng)長的(de)(de)(de)菌(jun)株(zhu),將其(qi)(qi)命名為Aminobacter sp 菌(jun)株(zhu) NyZ550。通過同位素標記、離子色譜、質譜檢測(ce)(ce)等技術(shu)鑒定NyZ550代(dai)(dai)謝(xie)二(er)(er)甲(jia)雙(shuang)胍(gua)的(de)(de)(de)直接代(dai)(dai)謝(xie)產物(wu)(wu)為胍(gua)基脲和二(er)(er)甲(jia)胺,并借(jie)助轉錄(lu)組測(ce)(ce)序確定菌(jun)株(zhu)NyZ550代(dai)(dai)謝(xie)二(er)(er)甲(jia)雙(shuang)胍(gua)的(de)(de)(de)關(guan)鍵基因簇,提(ti)出了其(qi)(qi)完整(zheng)的(de)(de)(de)代(dai)(dai)謝(xie)途徑。該代(dai)(dai)謝(xie)途徑可能與環境中(zhong)頻繁檢出的(de)(de)(de)高濃度(du)胍(gua)基脲殘留有(you)(you)關(guan),其(qi)(qi)生(sheng)態意義有(you)(you)待進一(yi)(yi)步探究(jiu)。