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一文滿足您對單細胞基因表達量UMAP圖展示的所有需求

2024-02-04

1、單基因表達量分布umap圖

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NKG7基因在分群圖中表達情況分布（左：0值為灰色，右：0值為藍色）。顏色深淺表示表達值的高低。


2、單基因(yin)表達密度(du)分布umap圖

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NKG7基因在分(fen)群圖中表(biao)達(da)密(mi)度分(fen)布(左(zuo)右為不同色板展(zhan)示結(jie)果)。顏色深淺表(biao)示密(mi)度高低。


3、多基因(yin)表達密度分布umap圖

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IL7R和CCR7基(ji)因在分群圖中表達密度分布。顏(yan)色深淺(qian)表示密度高低(di)。


4、高亮單基因(yin)表(biao)達量超(chao)過(guo)指定閾值的細(xi)胞(bao)

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MS4A1表(biao)(biao)達(da)(da)量超過(guo)指定(ding)閾(yu)值(zhi)的(de)(de)umap分布圖（上左(zuo)圖）。高(gao)亮的(de)(de)點(dian)表(biao)(biao)示(shi)高(gao)表(biao)(biao)達(da)(da)MS4A1的(de)(de)細(xi)胞。灰色點(dian)表(biao)(biao)示(shi)表(biao)(biao)達(da)(da)量低于閾(yu)值(zhi)的(de)(de)細(xi)胞。IL7R表(biao)(biao)達(da)(da)量超過(guo)指定(ding)閾(yu)值(zhi)的(de)(de)umap分布圖（上右圖）。高(gao)亮的(de)(de)點(dian)表(biao)(biao)示(shi)高(gao)表(biao)(biao)達(da)(da)IL7R的(de)(de)細(xi)胞灰。灰色點(dian)表(biao)(biao)示(shi)表(biao)(biao)達(da)(da)量低于閾(yu)值(zhi)的(de)(de)細(xi)胞。


5、高亮多(duo)基因表達量超過閾值的細胞

MS4A1和GZMB表達(da)量超過指定閾值的umap分布圖。高(gao)亮的點(dian)(dian)表示分別高(gao)表達(da)MS4A1和GZMB基因的細胞。灰色點(dian)(dian)表示表達(da)量低于(yu)閾值的細胞。

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參考：//samuel-marsh.github.io/scCustomize/index.html