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微生物組測序解決方案——樣本制備之糞便樣本

2024-02-29

糞便的(de)(de)微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)組(zu)(zu)(zu)研究中常用到(dao)微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)多樣性(xing)組(zu)(zu)(zu)成譜測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)以(yi)及宏(hong)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu),其中微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)多樣性(xing)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)是通(tong)(tong)過(guo)對(dui)16S/18S/ITS 等(deng)微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)菌(jun)群(qun)(qun)特征序(xu)(xu)(xu)列(lie)的(de)(de)擴增及高通(tong)(tong)量測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu),并結(jie)合專業的(de)(de)生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)信息分析,快速準(zhun)確地鑒(jian)定樣本中微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)( 細菌(jun)/ 古菌(jun)/真菌(jun)等(deng) )的(de)(de)物(wu)(wu)(wu)(wu)種組(zu)(zu)(zu)成和多樣性(xing),并同(tong)時(shi)獲(huo)得(de)群(qun)(qun)落(luo)進(jin)化關系、物(wu)(wu)(wu)(wu)種結(jie)構、群(qun)(qun)落(luo)功能等(deng)多種生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)信息;而宏(hong)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)則是對(dui)環(huan)境中所有微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)的(de)(de)完整基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)進(jin)行測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu),相較于(yu)微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)多樣性(xing)測(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu),宏(hong)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)更加注重微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)功能水平的(de)(de)研究,在獲(huo)取(qu)微生(sheng)(sheng)物(wu)(wu)(wu)(wu)功能基(ji)(ji)因(yin)序(xu)(xu)(xu)列(lie)信息的(de)(de)基(ji)(ji)礎上(shang),更有希望獲(huo)得(de)樣本中單菌(jun)基(ji)(ji)因(yin)組(zu)(zu)(zu)的(de)(de)全部信息。

但是(shi),一切都建立(li)在合適的(de)樣本制(zhi)備方法(fa)基礎之(zhi)上。若樣本不合格,那(nei)再完美的(de)解決方案也無法(fa)解決科研問題。因(yin)此,樣本的(de)制(zhi)備是(shi)關(guan)鍵中(zhong)的(de)關(guan)鍵。對于糞便樣本,該如何(he)有效采集和(he)存儲才能保證實驗(yan)結果的(de)準確(que)性呢(ni)?


糞便樣本采集(ji)前注意(yi)事(shi)項(xiang)

1、一周(zhou)內使用過抗生素不建議采樣

2、痔瘡活動期(qi)不可采樣

3、女性(xing)月經(jing)期(qi)間不可(ke)采樣

4、稀便(bian)和水樣便(bian)不建議采樣

5、采樣時尿液和(he)水不可混(hun)入(ru)糞便(bian)

6、確保(bao)實(shi)驗(yan)數據準確性,采(cai)樣時注(zhu)意所使用(yong)耗(hao)材均為(wei)無菌產品(pin)

7、糞便樣本最好在4小時之(zhi)內全(quan)部收集完畢,并迅速(su)轉移至(zhi)超低溫冰箱儲存,建議轉移過程在低溫環(huan)境下(xia)完成(cheng)


糞便樣本(ben)采(cai)集操(cao)作步驟

1、糞便樣(yang)本采集

使(shi)用(yong)無(wu)菌(jun)糞(fen)便(bian)(bian)收(shou)集器或(huo)其他滅菌(jun)器皿收(shou)集糞(fen)便(bian)(bian)樣本(ben),用(yong)無(wu)菌(jun)牙簽或(huo)糞(fen)便(bian)(bian)取樣器挖取樣本(ben)中段里(li)部(bu)(糞(fen)便(bian)(bian)表層(ceng)含有腸(chang)粘膜脫落細胞,外部(bu)易污(wu)染,且接(jie)觸空氣后,部(bu)分細菌(jun)DNA開始(shi)降解)。

2.糞(fen)便樣(yang)本取樣(yang)量(liang)

單個樣(yang)本取(qu)樣(yang)量:0.5~1.5 g/管。為保(bao)證實驗數據充(chong)足,每(mei)個樣(yang)本建(jian)議取(qu)3-5管備份(根據實驗需求(qiu)留取(qu)備份即可)。

3.糞便樣本保存

為防止微生(sheng)物(wu)發(fa)生(sheng)變(bian)化,須(xu)及時將糞便(bian)放入-80℃冰箱(xiang)凍存。

4.糞便樣本運輸

寄(ji)送樣本時選(xuan)擇干冰或足量冰袋(dai)運輸,確保寄(ji)送到實驗室時,樣本仍(reng)處在冷(leng)凍狀態。

但是很(hen)多情況(kuang)下糞(fen)(fen)便(bian)樣(yang)(yang)本的(de)采(cai)集不在實(shi)驗室,不能及時(shi)放(fang)入低溫環境下保存(cun)(cun),所以需要一款(kuan)常(chang)溫下即可保存(cun)(cun)糞(fen)(fen)便(bian)樣(yang)(yang)本的(de)保存(cun)(cun)液。因此上(shang)海派森諾(nuo)生物(wu)(wu)(wu)自主(zhu)研發了(le)微(wei)生物(wu)(wu)(wu)樣(yang)(yang)本常(chang)溫保存(cun)(cun)液,并(bing)推出了(le)糞(fen)(fen)便(bian)樣(yang)(yang)本采(cai)集套裝,旨(zhi)在最大限度地保持樣(yang)(yang)本中微(wei)生物(wu)(wu)(wu)的(de)多樣(yang)(yang)性。

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產品特點

  • 可以在(zai)常溫(wen)下采集、保存人和動物(wu)糞便樣本,保護樣本中微(wei)(wei)生物(wu)DNA不被降(jiang)解(jie);

  • 使用簡單,快速取樣(yang);

  • 采樣管及保存液均為無(wu)菌產品,減少樣本污(wu)染;

  • 從(cong)保存液中提取的微生(sheng)物(wu)DNA,后續可用于酶切和PCR等(deng)多(duo)種分子(zi)生(sheng)物(wu)學實驗,以及宏基因組和微生(sheng)物(wu)多(duo)樣性測序(xu)等(deng)。


保存期(qi)限

常(chang)溫25℃條件下糞便樣本可在保存(cun)液中儲存(cun)30天。


上述指南提供(gong)了一般性的(de)建議。對于具體的(de)產品和服務,建議參考上海派森(sen)諾生物(wu)科(ke)技股份(fen)有限公(gong)司(si)提供(gong)的(de)詳細說明和操作手冊(ce),以確保樣(yang)本(ben)的(de)采集、保存和運(yun)輸符合最佳實踐標準,并(bing)最大限度(du)地保持微(wei)生物(wu)的(de)完整性和多樣(yang)性。


糞便樣本微生物采樣工具套裝可洽詢當地銷售或撥打咨詢電話:021-80118168-6720