2016-01-07
簡(jian)介：
梨(li)(li)(li)小(xiao)食(shi)(shi)心蟲(chong)(chong)為重(zhong)要(yao)(yao)的(de)(de)寡食(shi)(shi)性(xing)害蟲(chong)(chong)，分布(bu)范圍較廣，對梨(li)(li)(li)樹嫩(nen)葉及果(guo)(guo)實等部位為害嚴重(zhong)。梨(li)(li)(li)小(xiao)食(shi)(shi)心蟲(chong)(chong)除危(wei)害梨(li)(li)(li)、桃樹外，也危(wei)害李、杏、蘋果(guo)(guo)、山(shan)楂等，嚴重(zhong)影響果(guo)(guo)品質(zhi)量及梨(li)(li)(li)果(guo)(guo)產量。梨(li)(li)(li)小(xiao)食(shi)(shi)心蟲(chong)(chong)成蟲(chong)(chong)觸角(jiao)在尋找寄(ji)主植(zhi)物(wu)、交(jiao)配(pei)、產卵等過(guo)程中(zhong)發揮重(zhong)要(yao)(yao)作用。西北農林科技大學植(zhi)物(wu)保護資源和害蟲(chong)(chong)管理實驗室的(de)(de)仵(wu)均(jun)祥教授和他的(de)(de)團隊以梨(li)(li)(li)小(xiao)食(shi)(shi)心蟲(chong)(chong)觸角(jiao)做為樣本進行轉錄組測序，鑒(jian)(jian)定(ding)(ding)嗅(xiu)覺相關基(ji)因(yin)。結果(guo)(guo)共鑒(jian)(jian)定(ding)(ding)出124個(ge)(ge)嗅(xiu)覺相關基(ji)因(yin)，其(qi)中(zhong)118個(ge)(ge)基(ji)因(yin)為該物(wu)種中(zhong)新發現的(de)(de)，包括28個(ge)(ge)編碼氣味(wei)(wei)結合蛋白(bai)的(de)(de)轉錄本，17個(ge)(ge)化學感受蛋白(bai)，48個(ge)(ge)氣味(wei)(wei)感受器，4個(ge)(ge)味(wei)(wei)覺感受器，24個(ge)(ge)親離子受體(ti)，2個(ge)(ge)感覺神經膜蛋白(bai)及1個(ge)(ge)氣味(wei)(wei)降解酶(mei)。
派森諾生物(wu)測(ce)序項目文章(zhang)：梨(li)小(xiao)食心(xin)蟲(chong)轉錄(lu)組(zu)測(ce)序。文章(zhang)研(yan)(yan)究(jiu)為今后害蟲(chong)味覺識別(bie)的(de)研(yan)(yan)究(jiu)提(ti)(ti)供了分子研(yan)(yan)究(jiu)基礎，特別(bie)是(shi)為使用化(hua)學信息(xi)素控制害蟲(chong)提(ti)(ti)供了可行性。該研(yan)(yan)究(jiu)成(cheng)果Identificationof Putative Olfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis于2015年11月(yue)5日發表在PLoS ONE（影響因子3.234）雜志上。梨(li)小(xiao)食心(xin)蟲(chong)的(de)轉錄(lu)組(zu)測(ce)序及信息(xi)分析工(gong)作，由上海派森諾生物(wu)科技(ji)股份有限公(gong)司完成(cheng)。
方法：
用棉簽蘸(zhan)5%蜂(feng)蜜溶液喂養(yang)雌幼蟲，對3-4天后(hou)剛羽化(hua)的1200個(ge)飛蛾的觸(chu)角進行(xing)轉錄組測序
測序(xu)平(ping)臺：
Illumina MiSeq 平臺
分析內(nei)容：
1. 共有基因和基因分(fen)析
2. 基因表達差異分析
3. 聚類分析
4. eggNOG注釋
5. KEGG注釋
6. qPCR驗(yan)證(zheng)
結果(guo)：
共(gong)鑒定(ding)出124個(ge)(ge)(ge)嗅覺相關基因，其中118個(ge)(ge)(ge)基因為該物種中新(xin)發(fa)現(xian)的(de)，包括28個(ge)(ge)(ge)編碼氣味結(jie)合蛋白(bai)(bai)的(de)轉錄本(ben)，17個(ge)(ge)(ge)化學感(gan)受蛋白(bai)(bai)，48個(ge)(ge)(ge)氣味感(gan)受器，4個(ge)(ge)(ge)味覺感(gan)受器，24個(ge)(ge)(ge)親(qin)離子受體(ti)，2個(ge)(ge)(ge)感(gan)覺神經膜蛋白(bai)(bai)及1個(ge)(ge)(ge)氣味降解酶。
圖1 轉(zhuan)錄組數據不同比(bi)對方式比(bi)較(jiao)
圖(tu)2 OBP及(ji)CSP基因(yin)系統發生樹構建
圖3 梨小食心蟲轉錄組測(ce)序GO基因功能(neng)注(zhu)釋
參考文獻;
Guangwei Li, Juan Du. Identification of PutativeOlfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis. PLoS One. (2015)1-30.
原文索引：10.1371/journal.pone.0142193
本文(wen)由(you)派森諾生物(wu)技術支持徐寧(ning)寧(ning)整(zheng)理
