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IF=8.1!“好曲釀好酒”從微生物組裝模式到代謝表型揭示傳統工藝與機械工藝高溫大曲發酵異質性機制~

2024-06-03

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天津科技(ji)大學張翠英教授團隊在(zai)國際食(shi)品Top期(qi)刊(kan)《Food Research International》發(fa)表(biao)(biao)(biao)新科研成果(guo)。通過研究傳統高(gao)溫大曲(qu)(HTD-T)和機(ji)械(xie)高(gao)溫大曲(qu)(HTD-M)在(zai)發(fa)酵參數、酶(mei)學特性、微(wei)(wei)生(sheng)物組裝(zhuang)和演替模式、代謝(xie)表(biao)(biao)(biao)型等(deng)方面的(de)差異,結合相關(guan)性分析和功能預測(ce),發(fa)現(xian)機(ji)械(xie)大曲(qu)峰溫滯后影響了(le)初期(qi)細菌群(qun)落組裝(zhuang)模式,且HTD-T和HTD-M代謝(xie)通路不同,確(que)定(ding)了(le)造成HTD-T和HTD-M大曲(qu)代謝(xie)表(biao)(biao)(biao)型差異的(de)核心物種,以及HTD特征風味微(wei)(wei)生(sheng)物代謝(xie)的(de)關(guan)鍵正向(xiang)驅動因素(su),揭(jie)示了(le)HTD-T和HTD-M之間發(fa)酵異質性機(ji)制(zhi),為優化和改進現(xian)代機(ji)械(xie)化HTD生(sheng)產提供了(le)新的(de)思(si)路。

派森諾提供(gong)了微(wei)(wei)生物多樣(yang)性測(ce)序和部分分析服務(wu)~

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PART 1、研究背景(jing)

大曲(qu)(qu)是白(bai)酒釀造的(de)(de)重(zhong)要(yao)(yao)發酵(jiao)(jiao)劑,長期(qi)以來(lai)一直是白(bai)酒釀造的(de)(de)核(he)心(xin)紐帶。高溫大曲(qu)(qu)(HTD)的(de)(de)糖化(hua)力(li)和發酵(jiao)(jiao)能力(li)明顯弱于其他大曲(qu)(qu),因(yin)此要(yao)(yao)求(qiu)其在醬香型白(bai)酒釀造過程中更高的(de)(de)投入(ru)比(bi)例(~100%),對(dui)醬香型白(bai)酒的(de)(de)香氣形成具(ju)有重(zhong)要(yao)(yao)貢獻作用。隨著科技進步,機(ji)(ji)(ji)械工(gong)藝在大型HTD企業中得(de)到(dao)了廣泛應用,但(dan)機(ji)(ji)(ji)械工(gong)藝生產的(de)(de)HTD與傳統工(gong)藝生產的(de)(de)HTD質(zhi)量存在差異(yi)。然而,現有研究(jiu)(jiu)對(dui)這一現象背(bei)后的(de)(de)機(ji)(ji)(ji)制理解暫不清晰。因(yin)此深入(ru)探究(jiu)(jiu)HTD-T和HTD-M發酵(jiao)(jiao)異(yi)質(zhi)性機(ji)(ji)(ji)制,確(que)定影響HTD質(zhi)量的(de)(de)關鍵因(yin)素,并制定HTD-M高品質(zhi)生產新策略至關重(zhong)要(yao)(yao)。




PART 2、實(shi)驗設計

1.目的(de)(de)(de):以發酵(jiao)不同階段的(de)(de)(de)機(ji)械(xie)大(da)曲(qu)和傳(chuan)統大(da)曲(qu)作(zuo)為研究對象,通過監測大(da)曲(qu)中(zhong)細菌和真菌動(dong)態變化以及代謝(xie)產物(wu)(wu),探究微(wei)生物(wu)(wu)與靶(ba)標代謝(xie)物(wu)(wu)、微(wei)生物(wu)(wu)與理化因子之間的(de)(de)(de)相關性,從而確定導致機(ji)械(xie)大(da)曲(qu)和傳(chuan)統大(da)曲(qu)質量差異的(de)(de)(de)生物(wu)(wu)和非生物(wu)(wu)因素及其作(zuo)用(yong)途(tu)徑。

2.分(fen)組設計(ji):傳統發(fa)(fa)(fa)酵室和機械發(fa)(fa)(fa)酵室中分(fen)別采集(ji)發(fa)(fa)(fa)酵0 d、8 d、16 d、40 d的(de)樣(yang)品,即T00-T40和M00-M40,以及成熟樣(yang)品,即TM和MM,共10組高(gao)溫大曲樣(yang)本。

3.測(ce)序平臺(tai):Illumina NovaSeq PE250

4.測序區域(yu):細(xi)菌16S V3-V4區(338F/806R)、真菌ITS1(ITS1F/ITS2R)

5.其他分析:發酵(jiao)參數及酶活檢(jian)測、揮發性代(dai)謝物(wu)檢(jian)測、有機酸(suan)和氨基酸(suan)檢(jian)測等。





PART 3、研究結果

1.機械成品大(da)曲和傳(chuan)統(tong)成品大(da)曲品質具有顯(xian)著(zhu)差異(yi)

TM和(he)(he)MM理化性(xing)(xing)質和(he)(he)酶(mei)學特(te)性(xing)(xing)研究表(biao)明,TM具有較高(gao)(gao)的(de)還原(yuan)糖(RS)、總(zong)(zong)酸(suan)(suan)(suan)(TA)、總(zong)(zong)酯(zhi)(TE)含量(liang)和(he)(he)糖化活(huo)(huo)性(xing)(xing),而MM具有較高(gao)(gao)的(de)水分和(he)(he)酸(suan)(suan)(suan)性(xing)(xing)蛋白酶(mei)活(huo)(huo)性(xing)(xing)。而液化活(huo)(huo)性(xing)(xing)和(he)(he)酯(zhi)化活(huo)(huo)性(xing)(xing)基本一致,均滿足釀酒(jiu)用(yong)大曲的(de)基本指標。代(dai)謝(xie)物(wu)檢測結果表(biao)明,氨(an)基酸(suan)(suan)(suan)和(he)(he)吡嗪(qin)(qin)類物(wu)質可能是傳統高(gao)(gao)溫大曲和(he)(he)機械高(gao)(gao)溫大曲的(de)主要(yao)差(cha)異(yi)代(dai)謝(xie)產物(wu)。其中(zhong)(zhong)(zhong),TM和(he)(he)MM之間有30種差(cha)異(yi)揮發性(xing)(xing)有機物(wu)(P<0.05),TM中(zhong)(zhong)(zhong)吡嗪(qin)(qin)類、苯二氮雜類和(he)(he)酸(suan)(suan)(suan)類含量(liang)均高(gao)(gao)于MM,而MM中(zhong)(zhong)(zhong)酮(tong)類和(he)(he)醇類含量(liang)較高(gao)(gao)。TM和(he)(he)MM中(zhong)(zhong)(zhong)蘋(pin)果酸(suan)(suan)(suan)(MA)、丁酸(suan)(suan)(suan)(BA)、琥珀酸(suan)(suan)(suan)(SA)、酒(jiu)石酸(suan)(suan)(suan)(TA)、乳酸(suan)(suan)(suan)(LA)、乙酸(suan)(suan)(suan)(AA)、檸檬酸(suan)(suan)(suan)(CA)等7種有機酸(suan)(suan)(suan)含量(liang)差(cha)異(yi)顯著(P<0.05),是TM和(he)(he)MM質量(liang)差(cha)異(yi)的(de)潛在(zai)影響因素(Fig.1)。

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Fig.1:不同工藝成品高溫大曲發酵參數(A)、酶活指標(B)及差異(yi)代謝物(C-D)


2.高溫大曲(qu)發酵參數和(he)微(wei)生物群落的時(shi)間動態(tai)演(yan)替規律(lv)

大(da)曲(qu)發(fa)酵(jiao)(jiao)理化參數表(biao)明,HTD-M溫(wen)(wen)度變(bian)化趨(qu)勢出(chu)與(yu)HTD-T相似,但HTD-T的(de)溫(wen)(wen)度第7天達(da)到峰值(64.5 ℃),HTD-M在(zai)溫(wen)(wen)度第15天達(da)到峰值(62.0 ℃),現(xian)代機械(xie)壓榨使大(da)曲(qu)塊擴(kuo)散(san),影(ying)響(xiang)發(fa)酵(jiao)(jiao)初期保溫(wen)(wen)。而發(fa)酵(jiao)(jiao)后(hou)期機械(xie)曲(qu)塊變(bian)得緊(jin)實,保溫(wen)(wen)性(xing)能提(ti)高(gao),溫(wen)(wen)度上(shang)升速率快。水(shui)分含(han)量(liang)持續下降至接近(jin)11%,傳統(tong)大(da)曲(qu)在(zai)發(fa)酵(jiao)(jiao)前期水(shui)分散(san)失(shi)速率快,而機械(xie)大(da)曲(qu)水(shui)分則是(shi)在(zai)發(fa)酵(jiao)(jiao)后(hou)期散(san)失(shi)速率更(geng)快。RS、銨態氮(dan)(TAN)、總(zong)酸(suan)(TA)、總(zong)酯(TE)含(han)量(liang)均呈現(xian)先升高(gao)后(hou)降低的(de)趨(qu)勢,且T40均顯著高(gao)于M40。此(ci)外,T40的(de)糖化活(huo)性(xing)和酸(suan)性(xing)蛋白酶活(huo)性(xing)均高(gao)于M40,說明傳統(tong)發(fa)酵(jiao)(jiao)方(fang)式有利于HTD的(de)碳氮(dan)代謝(xie)(Fig.2)。

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Fig.2:曲房溫度(A),發酵參數(shu)(B)及酶活指標(biao)(C)隨發酵時間的動(dong)態規律

基于(yu)序(xu)列100%相似性(xing)(xing)標準(zhun)共鑒定出(chu)16,166個細(xi)菌ASV和2,078個真菌ASV。T08中的Chao 1和Shannon指(zhi)數(shu)均顯著低(di)于(yu)M08中的Chao 1和Shannon指(zhi)數(shu)(P<0.05),并且(qie)在(zai)(zai)發(fa)(fa)酵(jiao)(jiao)后期(qi)情況(kuang)相反。同時,在(zai)(zai)發(fa)(fa)酵(jiao)(jiao)早期(qi)(溫(wen)度(du)較低(di))HTD-M的真菌多樣性(xing)(xing)指(zhi)數(shu),而(er)在(zai)(zai)發(fa)(fa)酵(jiao)(jiao)后期(qi)(溫(wen)度(du)較高)HTD-M中該(gai)指(zhi)數(shu)較低(di)。以(yi)上結果表(biao)明,高溫(wen)對ASVs的獨特性(xing)(xing)和微生物多樣性(xing)(xing)有抑制作用,且(qie)溫(wen)度(du)越高,趨同性(xing)(xing)越強(qiang)(Fig.3)。

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Fig.3:HTD發酵過程中細菌(A-B)和真(zhen)菌(C-D)共有和特有的(de)ASVs;細菌群(qun)落(luo)(E)和真(zhen)菌群(qun)落(luo)(F)的(de)α多樣性指(zhi)數變化特征

微生物群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)相對定(ding)量分析表明(ming)(ming),HTD發(fa)酵(jiao)過程中(zhong)細菌(jun)群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)變(bian)化顯著,優勢屬(shu)主(zhu)要為Staphylococcus、Lactococcus、Weissella、Kroppenstedtia、Bacillus和(he)Virgibacillus。而真(zhen)菌(jun)群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)差(cha)異較小,主(zhu)要是Thermomyces和(he)Thermoascus。基(ji)于(yu)(yu)Bray-Curtis距(ju)離矩陣的(de)PCA分析發(fa)現,由于(yu)(yu)初(chu)始發(fa)酵(jiao)期間HTD-T和(he)HTD-M之間的(de)溫度差(cha)異,T08和(he)M08樣品(pin)中(zhong)細菌(jun)群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)具有差(cha)異。而真(zhen)菌(jun)群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)沒有顯著差(cha)異,進一(yi)步說明(ming)(ming)細菌(jun)比真(zhen)菌(jun)更容易受到(dao)外(wai)界(jie)環境(jing)因素的(de)干擾。為深(shen)入了解群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)差(cha)異化的(de)原因,基(ji)于(yu)(yu)零模(mo)型(xing)分析β最近分類單元指數(βNTI),以生態位理(li)論評估(gu)HTD-T和(he)HTD-M群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)組(zu)(zu)裝(zhuang)模(mo)式的(de)差(cha)異,結果表明(ming)(ming)HTD-T發(fa)酵(jiao)細菌(jun)群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)是確(que)定(ding)性組(zu)(zu)裝(zhuang),而HTD-M峰溫滯后影響了初(chu)期細菌(jun)群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)組(zu)(zu)裝(zhuang)模(mo)式,由隨機(ji)性組(zu)(zu)裝(zhuang)到(dao)確(que)定(ding)性組(zu)(zu)裝(zhuang)。兩種(zhong)模(mo)式下真(zhen)菌(jun)群(qun)(qun)(qun)(qun)落(luo)(luo)都是隨機(ji)性組(zu)(zu)裝(zhuang)(Fig.4)。

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Fig.4:高溫大曲發酵(jiao)過程微生物(wu)群(qun)落結構和組裝(zhuang)模式


3. 確定傳(chuan)統與機械高溫大曲的靶標差異代(dai)謝產物

GC-MS在發(fa)(fa)酵大(da)曲(qu)中共檢(jian)測到(dao)(dao)87種(zhong)(zhong)揮發(fa)(fa)性化合物(wu)(wu)(wu)(VOCs),HPLC定量檢(jian)測了(le)大(da)曲(qu)發(fa)(fa)酵過程的(de)(de)10種(zhong)(zhong)有機(ji)酸(suan)(suan)和17種(zhong)(zhong)氨基(ji)酸(suan)(suan)。通過投影變量重要度(VIP)分析,篩選到(dao)(dao)16種(zhong)(zhong)差(cha)異VOCs(VIP>1.2)、3種(zhong)(zhong)差(cha)異有機(ji)酸(suan)(suan)和7種(zhong)(zhong)差(cha)異氨基(ji)酸(suan)(suan)(VIP>1.0)。進一步的(de)(de)Venn分析發(fa)(fa)現,發(fa)(fa)酵大(da)曲(qu)差(cha)異代(dai)謝物(wu)(wu)(wu)與成(cheng)品大(da)曲(qu)差(cha)異代(dai)謝物(wu)(wu)(wu)存在14種(zhong)(zhong)共同的(de)(de)差(cha)異代(dai)謝產(chan)物(wu)(wu)(wu),作為后續研究的(de)(de)靶標差(cha)異代(dai)謝產(chan)物(wu)(wu)(wu)(Fig.5)。

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Fig.5:揮發性化合物(A),有機酸(B)和(he)氨基酸(C)的(de)含量動(dong)態變化熱圖與(yu)氣泡(pao)圖以及基于VIP篩選的(de)差(cha)異代謝標志物瀑布圖(D)


4. 鎖定靶標(biao)差異化(hua)合物代謝潛在的ASV水平微生物

靶(ba)標差(cha)異(yi)代(dai)謝(xie)產物(wu)與優勢ASVs的Pearson相關(guan)分析結果表明,Bacillus、Virgibacillus、Oceanobacillus、Kroppenstedtia、Lactobacillus、Monascus被認為是(shi)造成傳統(tong)高溫(wen)大(da)曲和機械高溫(wen)大(da)曲代(dai)謝(xie)表型差(cha)異(yi)的核心物(wu)種(zhong),相應地,BA、精氨(an)酸(Arg)、四甲基吡嗪(TTMP)、三甲基吡嗪(TMP)和2-甲氧基-4-乙烯基苯(ben)酚(4-VG)被篩選為可(ke)調控的靶(ba)標差(cha)異(yi)代(dai)謝(xie)產物(wu)(Fig.6)。

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Fig.6:核(he)心(xin)ASVs與(yu)目標代謝(xie)物之(zhi)間基于(yu)顯著相關性的網絡圖


5.從基因層面驗證引(yin)起目標代謝(xie)物差異(yi)的潛在微(wei)生物

為(wei)了進(jin)一步(bu)揭示大曲風(feng)味(wei)物(wu)(wu)質的(de)形成過(guo)程,基(ji)于KEGG(16S rRNA)和MetaCyc(ITS rRNA)數據庫,對大曲微生物(wu)(wu)的(de)功能譜進(jin)行預測。同時(shi),利用PICRUSt 2預測了細菌和真菌群落中相關酶功能基(ji)因(yin)的(de)豐度變化。此(ci)外(wai),我們關注(zhu)來自18個ASV的(de)酶分布,因(yin)為(wei)它(ta)們可(ke)能參(can)與(yu)與(yu)風(feng)味(wei)化合(he)物(wu)(wu)相關的(de)主要(yao)代謝途徑,包括Arg代謝、BA代謝、4-VG代謝和十六烷生物(wu)(wu)合(he)成(Fig.7)。

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Fig.7:PICRUSt2預測的精氨酸、丁酸、四(si)甲(jia)基吡嗪和2-乙烯基愈(yu)創木酚代謝通路示意(yi)圖。熱圖表示核心ASVs中與上述代謝途徑相關酶的基因相對豐度


6. 探(tan)索高溫大(da)曲中驅動核心(xin)ASVs代謝的(de)生物(wu)和非生物(wu)因素(su)

18個(ge)(ge)(ge)核心ASVs的(de)(de)共線性(xing)網絡分為兩個(ge)(ge)(ge)模(mo)(mo)塊(kuai),模(mo)(mo)塊(kuai)Ⅰ中,9個(ge)(ge)(ge)與(yu)Arg正(zheng)(zheng)相(xiang)關的(de)(de)ASVs之(zhi)間(jian)存在協(xie)同效應,而(er)與(yu)BA、TTMP、TMP、4-VG呈正(zheng)(zheng)相(xiang)關的(de)(de)9個(ge)(ge)(ge)ASVs構成模(mo)(mo)塊(kuai)Ⅱ中的(de)(de)正(zheng)(zheng)相(xiang)關網絡模(mo)(mo)式。一(yi)方面,兩個(ge)(ge)(ge)模(mo)(mo)塊(kuai)的(de)(de)ASVs均受到溫度(du)、TA和RS的(de)(de)正(zheng)(zheng)向驅(qu)動;另一(yi)方面,水分和淀粉與(yu)大多(duo)數ASVs呈負相(xiang)關。上(shang)述結(jie)果綜合表明(ming),造(zao)成代(dai)謝差異(yi)的(de)(de)ASVs具(ju)有(you)(you)良好(hao)(hao)的(de)(de)耐(nai)高溫和耐(nai)酸特性(xing),同時具(ju)有(you)(you)優異(yi)的(de)(de)原料分解和利用(yong)能(neng)力(li),且低水分環境下能(neng)更好(hao)(hao)的(de)(de)發(fa)揮(hui)作用(yong)(Fig.8)。

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Fig.8:核心(xin)(xin)ASVs的共線性(xing)網絡(luo)(A)以及發酵因子對核心(xin)(xin)ASVs的冗(rong)余分析(B-C)





PART 4、研究結(jie)論(lun)

1.在這項研究中,證明機械(xie)壓(ya)榨擴散大(da)曲是(shi)(shi)溫(wen)(wen)度管理模(mo)(mo)式差異的初始(shi)原因(yin),它改變了微生(sheng)物的組裝(zhuang)模(mo)(mo)式和代(dai)謝(xie)(xie)(xie)表型(xing)。Arg、BA、TTMP、TMP、4-VG可(ke)(ke)能是(shi)(shi)影響大(da)曲質量的目標關鍵代(dai)謝(xie)(xie)(xie)物。Bacillus、Virgibacillus、Oceanobacillus、Kroppenstedtia、Lactobacillus、Monascus是(shi)(shi)影響代(dai)謝(xie)(xie)(xie)變異的主要微生(sheng)物。高溫(wen)(wen)、高酸和低水分(fen)可(ke)(ke)能是(shi)(shi)導致熱脫附(fu)過程(cheng)中特征風(feng)味代(dai)謝(xie)(xie)(xie)的主要因(yin)素。

2.以上發現有助(zhu)于更好地理解機(ji)械熱處理中外部發酵環境改變微生態(tai)分化的機(ji)制(zhi),為更好地管理和(he)提(ti)高熱處理質(zhi)量(liang)的新策略(lve)奠(dian)定(ding)理論基礎(chu)。同(tong)時,進一步(bu)通(tong)過(guo)宏轉錄組學和(he)宏蛋白質(zhi)組學解鎖HTD微生物區系功能的更多機(ji)制(zhi),為HTD質(zhi)量(liang)改進可提(ti)供更多信息和(he)思路。


原文引(yin)用:Gailing Shi, Chao Fang, Shuang Xing, Ying Guo, Xin Li, Xiao Han, Liangcai Lin, Cuiying Zhang, Heterogenetic mechanism in high-temperature Daqu fermentation by traditional craft and mechanical craft: From microbial assembly patterns to metabolism phenotypes, Food Research International, Volume 187, 2024, 114327, ISSN 0963-9969.

原文鏈(lian)接(jie):DOI: 10.1016/j.foodres.2024.114327