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轉錄組測序:解碼水果保鮮的“基因語言”

2025-05-11

水果從(cong)枝(zhi)頭到(dao)餐桌,如何保持(chi)新鮮?采后儲藏是決定水果品質和經(jing)濟(ji)效(xiao)益(yi)的關(guan)鍵環節(jie)。隨(sui)著(zhu)科技發展,轉(zhuan)錄組測序技術(shu)正(zheng)成(cheng)為研究水果耐(nai)儲藏的“利(li)器”,它能從(cong)基(ji)因層(ceng)面揭(jie)示水果衰老、軟化和抗冷害的奧秘,為保鮮技術(shu)提供(gong)精準(zhun)靶點!

河南科技學院園藝與園林學院發表2篇甜柿冷藏保鮮相關研究的文章,文中RNA-seq測序以及部分分析工作由上海派森諾生物科技股份有限公司完成

文章一

Glycine betaine treatment: Effects on alleviating chilling injury and related gene expression in ‘Youhou’ sweet persimmon during cold storage

雜志:Journal of Food Science

時間:2025-02-14

鏈接://doi.org/10.1111/1750-3841.70047

文章主題:甘氨酸(suan)甜菜堿(jian)處理甜柿可(ke)有效防止冷(leng)藏(zang)期(qi)(qi)間的(de)冷(leng)害發生以延(yan)長儲存(cun)期(qi)(qi)。

組學技術:RNA-seq

文章要點:轉錄組測序(xu)分(fen)析表明甘氨酸甜菜堿處理顯著改變了(le)(le)甜柿(shi)的糖(tang)代(dai)謝、GSH代(dai)謝和(he)苯(ben)丙烷類物質合成等相關基因(yin)的表達(da),為研究甜菜堿的冷藏保鮮(xian)作用機制提供了(le)(le)新(xin)思路(lu)。

技術路線

轉錄組結果展示

CK_vs_GB轉錄組分(fen)析

(a.樣本相關性;b.差異(yi)(yi)火山圖;c. DEG聚類熱(re)(re)圖;d.KEGG富(fu)集(ji)分析;e.差異(yi)(yi)轉錄組因子熱(re)(re)圖)

文章二

Treatment with 24-epibrassinolide protects ‘Youhou’ sweet persimmon fruit against chilling injury during cold storage

雜志:Scientia Horticulturae

時間:2025-03-19

鏈接://doi.org/10.1016/j.scienta.2025.114087

文章主題:24-表蕓(yun)苔素(EBR)內酯處(chu)理甜柿可提高抗氧化能力、防止冷害。

組學技術:RNA-seq

文章要點:EBR處(chu)理通過降(jiang)低MDA含量和(he)電(dian)解(jie)質相(xiang)對滲漏率,降(jiang)低ROS積累水平,提高AsA、GSH和(he)花青素(su)含量來緩解(jie)陽豐甜柿冷害。EBR處(chu)理同(tong)時還提高了(le)PAL活性,降(jiang)低了(le)POD和(he)PPO活性水平。此外,通過轉錄(lu)組測序結(jie)果顯示,EBR處(chu)理改變了(le)與植物(wu)激(ji)素(su)信號轉導、花色素(su)苷生(sheng)物(wu)合成、油菜素(su)類(lei)(lei)固醇生(sheng)物(wu)合成、糖代謝、苯丙素(su)類(lei)(lei)生(sheng)物(wu)合成、氧化應激(ji)和(he)脂(zhi)肪(fang)酸代謝等相(xiang)關基因(yin)的表達水平

技術路線

轉錄組結果展示

CK_vs_EBR轉錄(lu)組結果

(A.樣本相關性;B.差異火山圖;C. DEG聚類熱圖;D.KEGG富集分析)

植(zhi)物激素信(xin)號轉導(dao)和抗(kang)寒相關DEG

(A.通(tong)路熱圖;B.轉錄因子(zi)熱圖;C.抗(kang)寒基因熱圖)