針對動物線粒(li)(li)體基(ji)因(yin)組(zu)測序(xu)是(shi)否需要(yao)提(ti)供(gong)純(chun)的(de)線粒(li)(li)體基(ji)因(yin)組(zu) DNA？
只需要(yao)提(ti)供全基因組總 DNA，不需要(yao)通(tong)過(guo)密度(du)(du)梯度(du)(du)離心等(deng)方法獲得純的線粒體DNA。
注意：每(mei)一種(zhong)組織的(de)線粒(li)體 DNA 的(de)含量不(bu)一樣(yang)，取樣(yang)時，盡量提供線粒(li)體 DNA 含量豐富的(de)組織或細胞(bao)，如肌(ji)肉組織。
如何從全基(ji)因組測序中(zhong)獲得線(xian)粒體 DNA？
一般來說，一個真(zhen)核(he)生物中(zhong)(zhong)包含M個線(xian)粒(li)體(ti)細胞器，每(mei)一個線(xian)粒(li)體(ti)細胞中(zhong)(zhong)包含N條(tiao)線(xian)粒(li)體(ti)基因組(zu)(zu) DNA，核(he)基因組(zu)(zu)數為(wei) 2，則線(xian)粒(li)體(ti)基因組(zu)(zu)與核(he)基因組(zu)(zu)的比例為(wei) M*N：2。
采(cai)用(yong)生物信息學分析，將(jiang)全基因組拼接結果(guo)中高覆(fu)蓋(gai)度的(de)序(xu)列提取(qu)出來，并與數據庫進行(xing)比對分析，從而(er)獲得線粒(li)體基因組 DNA。
植(zhi)物的線粒體/葉(xie)綠(lv)體葉(xie)綠(lv)體基(ji)因組測序工作怎么準備樣品？
植物的(de)線(xian)粒(li)(li)體(ti)(ti)/葉綠體(ti)(ti)基因組(zu)大小比(bi)較(jiao)大，一般我們都(dou)建議采(cai)用Illumina+Pacbio 來(lai)進行測序，對樣品的(de)需求(qiu)就(jiu)比(bi)較(jiao)高，需要老(lao)師(shi)提供富集(ji)的(de)線(xian)粒(li)(li)體(ti)(ti)DNA。常用的(de)富集(ji)方法：超高速離心(xin)富集(ji)、富集(ji)線(xian)粒(li)(li)體(ti)(ti)/葉綠體(ti)(ti)DNA試劑盒等。
