針(zhen)對動物線(xian)粒體基因組測序是否需要提供純的線(xian)粒體基因組 DNA？
只需要(yao)(yao)提供全基因(yin)組總(zong) DNA，不(bu)需要(yao)(yao)通過密度梯度離心等方法(fa)獲得純的線(xian)粒體DNA。
注意：每一種組織的(de)線粒體 DNA 的(de)含量(liang)不一樣，取樣時，盡量(liang)提(ti)供線粒體 DNA 含量(liang)豐富的(de)組織或細(xi)胞，如肌肉(rou)組織。
如(ru)何從全基因組(zu)測序(xu)中獲(huo)得線粒體 DNA？
一般(ban)來說，一個(ge)真(zhen)核(he)(he)生(sheng)物(wu)中包(bao)含M個(ge)線粒(li)體(ti)(ti)細胞(bao)器，每一個(ge)線粒(li)體(ti)(ti)細胞(bao)中包(bao)含N條(tiao)線粒(li)體(ti)(ti)基(ji)因(yin)(yin)組 DNA，核(he)(he)基(ji)因(yin)(yin)組數(shu)為 2，則線粒(li)體(ti)(ti)基(ji)因(yin)(yin)組與核(he)(he)基(ji)因(yin)(yin)組的(de)比例(li)為 M*N：2。
采(cai)用生物信息學分(fen)析，將全基(ji)因組拼(pin)接結果中高覆蓋度的(de)序列提取出來，并與數(shu)據(ju)庫進行比(bi)對分(fen)析，從而獲得線(xian)粒體基(ji)因組 DNA。
植物的線粒體/葉綠(lv)體葉綠(lv)體基(ji)因組測序工作怎么準備樣品？
植物的(de)(de)線粒(li)體/葉綠體基因組大(da)小(xiao)比較大(da)，一般(ban)我們(men)都(dou)建議采(cai)用Illumina+Pacbio 來進行測序(xu)，對(dui)樣品(pin)的(de)(de)需求就比較高，需要老(lao)師(shi)提供富集的(de)(de)線粒(li)體DNA。常用的(de)(de)富集方法：超高速(su)離心富集、富集線粒(li)體/葉綠體DNA試劑(ji)盒等。
