細胞懸液的(de)制備(bei)過(guo)程(cheng)中(zhong)是(shi)否會影響(xiang)基因的(de)表達?
目前常(chang)用(yong)的(de)方法中,不管是酶消化還是機械操(cao)作都會(hui)不可避免的(de)對細(xi)胞(bao)(bao)產生(sheng)影(ying)響(xiang),前者(zhe)會(hui)使細(xi)胞(bao)(bao)產生(sheng)應激反應,后者(zhe)則容易損傷細(xi)胞(bao)(bao),進而影(ying)響(xiang)細(xi)胞(bao)(bao)活(huo)性。所(suo)以,在單細(xi)胞(bao)(bao)測序實驗設計時,設置對照是非常(chang)重(zhong)要的(de)。前述(shu)的(de)這(zhe)些(xie)影(ying)響(xiang),在case和control中同樣存在,我們關注case和control的(de)差異表達基因(yin),就可以去除實驗的(de)系(xi)統誤差,找到決定感(gan)興趣生(sheng)物學過(guo)程的(de)關鍵基因(yin)。
如何(he)判(pan)斷(duan)細胞類型?
細(xi)胞類型的(de)(de)(de)判(pan)斷是(shi)需要(yao)您(nin)自己選(xuan)擇Marker基(ji)因的(de)(de)(de),您(nin)可以參考同類物種或樣本的(de)(de)(de)已發(fa)表文(wen)章,或者根據(ju)數據(ju)庫去確(que)定Marker,比如CellMarker,panglao等。
10XGenomics單細胞平臺有什么優勢?
一.細胞(bao)通量高,一次可捕獲(huo)上萬細胞(bao) ;
二(er).對細(xi)胞大(da)小及類(lei)型限(xian)制低,且捕獲(huo)效(xiao)率達(da)65% ;
三.從懸液到文庫構建(jian)周期短。