哪(na)些物種可(ke)以(yi)研究(jiu)lncRNA？
要做(zuo)lncRNA分(fen)析，對物種有以下(xia)要求(qiu)：
a. 物種為真核生物；
b. 物種具有(you)參考基(ji)因組；
c. 具有較為完(wan)整的(de)注釋(shi)。
為什么lncRNA要測鏈(lian)特(te)異性文(wen)庫(ku)？
測(ce)序(xu)后的數(shu)據分析可(ke)(ke)確(que)定轉(zhuan)錄(lu)本(ben)是(shi)來自正(zheng)義還是(shi)反(fan)義DNA鏈。與(yu)普通(tong)轉(zhuan)錄(lu)組(zu)測(ce)序(xu)相比，它更能準確(que)地統計轉(zhuan)錄(lu)本(ben)的數(shu)量(liang)和確(que)定基因的結(jie)構，同時可(ke)(ke)以發(fa)現(xian)更多的反(fan)義轉(zhuan)錄(lu)本(ben)，可(ke)(ke)以更好地鑒定antisense lncRNA。 ;
lncRNA測序，構建文庫時為(wei)什么要去除rRNA？
lncRNA中(zhong)只有lincRNA的(de)3’端帶有polyA結(jie)構，其他lncRNA沒有polyA結(jie)構，因此，為了獲得更全的(de)lncRNA信(xin)息，不建議采(cai)用(yong)oligo(dT)磁珠富集(ji)的(de)方式。
什么是LncRNA測序？
LncRNA-長(chang)鏈非編(bian)(bian)碼RNA（Long noncoding RNA）是一類長(chang)度超過200nt的(de)RNA分子(zi)，它們少有(you)蛋(dan)(dan)白編(bian)(bian)碼潛能，并且能夠和DNA、RNA及蛋(dan)(dan)白質結合(he)，以RNA的(de)形式在多種層(ceng)面(mian)上(shang)（表觀遺傳(chuan)調控(kong)、轉(zhuan)錄調控(kong)以及轉(zhuan)錄后調控(kong)等）調控(kong)基因的(de)表達水平。LncRNA測序是研究已有(you)參考基因組物種的(de)特(te)定(ding)(ding)組織或細胞在某個特(te)定(ding)(ding)時期轉(zhuan)錄出的(de)LncRNA和mRNA。
LncRNA測(ce)序的條件(jian)
有參考基因組(zu)，并且(qie)有LncRNA注釋信(xin)息：常見的包括(kuo)人、小鼠、大鼠、豬、牛、兔、斑馬魚(yu)、酵母、擬(ni)(ni)南(nan)芥、果蠅、秀麗線蟲；擬(ni)(ni)南(nan)芥、玉米、葡萄、金銀花、水稻、西紅柿(shi)、大豆(dou)。
