針對無參考基因組(zu)物種的轉錄組(zu)測序(xu)你們(men)可(ke)以提供哪些分析內容？
常規(gui)信息分(fen)析內容如(ru)下(xia)：
1、序列拼接及拼裝統計；
2、Unigene功能注(zhu)釋；
3、Unigene功能(neng)聚類分析；
4、Unigene的(de)代謝途徑分(fen)析；
5、Unigene的表(biao)達差異分析（兩個或者兩個以上的樣本）；
6、樣品間差(cha)異表達Unigene的(de)富集分析（GO、KEGG）；
7、樣(yang)品間差異Unigene的(de)表達模式聚類分(fen)析（3個樣(yang)本及以上）；
8、SNP鑒定；
9、SSR分析。
除了常規信(xin)息(xi)(xi)分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)外，還可(ke)根據客戶需求(qiu)，進行(xing)可(ke)選性信(xin)息(xi)(xi)分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)，例如：基因共表(biao)達網(wang)絡(luo)分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)、PCA分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)、差異mRNA蛋白互作網(wang)絡(luo)分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)、轉(zhuan)錄(lu)因子分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)（適用(yong)于植物物種(zhong)）、樣本特(te)異表(biao)達及共有表(biao)達基因分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)、樣品(pin)間相關性分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)、mRNA與miRNA互作分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)、mRNA與LncRNA互作分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)、DEU分(fen)(fen)(fen)(fen)析(xi)(xi)（適用(yong)于有生物學重復）。
