細(xi)胞(bao)懸(xuan)液的制(zhi)備過程中(zhong)是否會(hui)影響基因的表(biao)達(da)?
目前(qian)常(chang)用的方(fang)法中,不(bu)(bu)管是(shi)酶消(xiao)化還是(shi)機械操(cao)作(zuo)都(dou)會(hui)不(bu)(bu)可避免的對細胞(bao)(bao)產生(sheng)(sheng)(sheng)影(ying)響,前(qian)者會(hui)使細胞(bao)(bao)產生(sheng)(sheng)(sheng)應激反(fan)應,后者則(ze)容易損傷(shang)細胞(bao)(bao),進而(er)影(ying)響細胞(bao)(bao)活性(xing)。所以,在單細胞(bao)(bao)測序實驗設(she)計時,設(she)置對照是(shi)非常(chang)重要的。前(qian)述的這些影(ying)響,在case和(he)control中同樣存在,我們關(guan)注case和(he)control的差異表(biao)達基(ji)(ji)因,就可以去除實驗的系(xi)統(tong)誤差,找(zhao)到決(jue)定(ding)感興趣生(sheng)(sheng)(sheng)物學過程(cheng)的關(guan)鍵(jian)基(ji)(ji)因。
如何判斷細(xi)胞類型?
細(xi)胞類(lei)型的判斷是需(xu)要(yao)您自己選擇Marker基因的,您可以參(can)考同類(lei)物種或樣本的已發表文(wen)章,或者(zhe)根(gen)據數據庫去確定Marker,比如CellMarker,panglao等(deng)。
10XGenomics單細胞(bao)平臺有什么(me)優勢?
一.細胞通(tong)量高,一次可捕獲上萬細胞 ;
二.對細胞(bao)大(da)小及(ji)類型(xing)限(xian)制(zhi)低,且捕獲效率達65% ;
三.從(cong)懸液到文庫(ku)構建周(zhou)期短(duan)。