序(xu)號(hao) | 分析(xi)項(xiang)目 | 類(lei)別 | 分(fen)析 | 備(bei)注 |
1. | 原始數(shu)據(ju)整理、過濾及質量評估 | A | √ | |
2. | 參考基(ji)因組注釋信(xin)息整理 | A | √ | |
3. | 比對到參考(kao)基(ji)因(yin)組及結果(guo)評估 | A | √ | |
4. | eggNOG分(fen)類(lei)分(fen)析 | A | √ | |
5. | 基因表達量統計 | A | √ | |
6. | 表達差異基因分析 | A | √ | |
7. | 表達(da)差異基(ji)因GO富集分析 | A | √ | |
8. | 表達差異基因KEGG富集(ji)分析 | A | √ | |
9. | 表達差(cha)異基因聚類分(fen)析 | A | √ | |
10. | PCA分(fen)析(xi) | A | √ | |
11. | 組間共有差異基(ji)因可視化 | B | √ | 實驗分組(zu)≥3 |
12. | cSNP分析 | B | √ | |
13. | 新轉(zhuan)錄位點預測(ce) | B | √ | |
14. | 操縱子預(yu)測分(fen)析 | B | √ | |
15. | UTR分析(xi) | B | √ | |
16. | antisense RNA分析(xi) | B | √ |
圖1 RPKM密度分布
圖2 樣品(pin)相關性檢驗
圖(tu)3 RPKM飽(bao)和度
圖4 MA圖
