序(xu)號 | 分析項目 | 類(lei)別 | 分析(xi) | 備注(zhu) |
1. | 原始數據整理、過濾及質量(liang)評估 | A | √ | |
2. | 參考基因組注釋(shi)信(xin)息整理(li) | A | √ | |
3. | 比對到參(can)考基因組及結果評(ping)估 | A | √ | |
4. | eggNOG分(fen)類分(fen)析 | A | √ | |
5. | 基因表(biao)達量統計(ji) | A | √ | |
6. | 表達差異基因分析(xi) | A | √ | |
7. | 表達差異基因GO富集分析 | A | √ | |
8. | 表達差異(yi)基因(yin)KEGG富集分析(xi) | A | √ | |
9. | 表達差異基因聚(ju)類分(fen)析 | A | √ | |
10. | PCA分(fen)析(xi) | A | √ | |
11. | 組間共有差異基因可視(shi)化 | B | √ | 實驗分組≥3 |
12. | cSNP分析(xi) | B | √ | |
13. | 新轉錄(lu)位點預測 | B | √ | |
14. | 操(cao)縱(zong)子預測分析 | B | √ | |
15. | UTR分析 | B | √ | |
16. | antisense RNA分析 | B | √ |
圖1 RPKM密度分布
圖2 樣品相關性檢(jian)驗
圖(tu)3 RPKM飽和度
圖(tu)4 MA圖(tu)
