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科研服務

動植物基因組全長測序

動植物基因(yin)組分析內容


序號

分(fen)析項目(mu)

1

下機數據(ju)統計

2

數據質控(kong)

3

數據獲取

4

Survey 分析(xi)

5

基因組拼裝

6

基因組拼裝效果(guo)評(ping)價

7

基(ji)因組拼裝完整(zheng)性與(yu)連續(xu)性評估

8

重復序列分(fen)析

9

非編碼(ma) RNA 預測

10

蛋白(bai)編(bian)碼基因預測

11

蛋白編碼基因的序(xu)列比對

12

蛋白編(bian)碼基因(yin)的 GO 注釋(shi)

13

蛋白編碼基(ji)因(yin)的(de) eggNOG 注釋

14

蛋(dan)白編碼基因的 KEGG 注釋

15

蛋白編碼基因的 Swiss-Prot 注釋

16

序列比對分析

17

SNP 分(fen)析

18

InDel 分析

19

種群統計學(xue)分(fen)析

20

基因(yin)家(jia)族分析

21

Venn 繪制

22

單拷(kao)貝基因的蛋白序列一致性(xing)分析

23

基因家(jia)族(zu)擴張(zhang)和收縮(suo)分析

24

dNdS 分析

25

基于全基因組單拷貝基因的進化樹重構

26

分歧(qi)時間估算

27

基(ji)因組數據上(shang)傳