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科研服務

動植物基因組全長測序

動植(zhi)物基因組(zu)分析內容


序(xu)號

分析項目

1

下機數據統(tong)計

2

數據質控

3

數據(ju)獲取

4

Survey 分析

5

基因組(zu)拼(pin)裝

6

基因組拼裝(zhuang)效果評價

7

基因組拼裝完整性與連續性評(ping)估(gu)

8

重復序列分析

9

非編碼 RNA 預測(ce)

10

蛋(dan)白編碼基(ji)因預測

11

蛋白編碼基(ji)因的序列比對

12

蛋白(bai)編碼基因的(de) GO 注釋

13

蛋白編碼基因的 eggNOG 注釋

14

蛋(dan)白(bai)編碼(ma)基因的(de) KEGG 注釋

15

蛋白編碼基(ji)因的 Swiss-Prot 注釋

16

序列比對分析

17

SNP 分析(xi)

18

InDel 分析

19

種群統計(ji)學分(fen)析

20

基因家族分析

21

Venn 繪制

22

單(dan)拷(kao)貝(bei)基因的蛋白序列一致性分析

23

基因家(jia)族擴張和收縮分析

24

dNdS 分析

25

基(ji)于(yu)全基(ji)因組單(dan)拷貝(bei)基(ji)因的進化樹重構

26

分歧(qi)時間估算(suan)

27

基(ji)因(yin)組數據上傳