序號(hao) | 分析項目 | 類型 | 分(fen)析 | 備注 |
1 | 下機數據統計 | A | ||
2 | 數據質控 | A | ||
3 | 數據獲取 | A | ||
4 | Survey 分析(xi) | A | ||
5 | 基(ji)因組(zu)拼裝 | A | ||
6 | 基因組拼(pin)裝效(xiao)果(guo)評價(jia) | A | ||
7 | 基因(yin)組拼裝(zhuang)完(wan)整性(xing)與連續性(xing)評估(gu) | A | ||
8 | 重復序列分(fen)析 | A | ||
9 | 非(fei)編碼 RNA 預測 | A | ||
10 | 蛋白編(bian)碼(ma)基因預測 | A | ||
11 | 碳(tan)水化(hua)合物(wu)活性酶（CAZy）分析 | A | ||
12 | 細胞色素 P450 家族分析 | A | ||
13 | 蛋白編碼基(ji)因的(de)序(xu)列(lie)比對 | A | ||
14 | 蛋(dan)白編碼(ma)基(ji)因的 GO 注釋 | A | ||
15 | 蛋白編碼基(ji)因(yin)的(de) eggNOG 注釋(shi) | A | ||
16 | 蛋白編碼基因的 KEGG 注釋 | A | ||
17 | 蛋白編碼基因的 Swiss-Prot 注釋 | A | ||
18 | 蛋白編碼基因的結構域分析 | A | ||
19 | 序列比(bi)對分析(xi) | A | ||
20 | SNP 分析 | A | ||
21 | InDel 分(fen)析(xi) | A | ||
22 | 基因家族分析(xi) | B | 基因組數量 ≥ 2 | |
23 | Venn 繪制 | B | 基因組數(shu)量 ≥ 2 | |
24 | 單拷(kao)貝基因的蛋(dan)白序列一致(zhi)性分析 | B | 基因組(zu)數(shu)量 ≥ 3 | |
25 | 基因家族擴張和收縮(suo)分(fen)析 | B | 基因組(zu)數(shu)量(liang) ≥ 3 | |
26 | dNdS 分析 | B | 基因組數量 ≥ 2 | |
27 | 基于全基因組單拷(kao)貝基因的進化樹重構 | B | 基因(yin)組數(shu)量 ≥ 3 | |
28 | 分歧時間估算 | B | 基因組數(shu)量 ≥ 3 | |
29 | 基因組數(shu)據上傳(chuan) | B | ||
30 | 基因(yin)組圈圖繪制 | A |
A：標準(zhun)信(xin)息分(fen)析(xi)； B：信息(xi)分析(xi)。
基(ji)于(yu)單拷貝的全基(ji)因組進化分析
ω值分布圖
