序號 | 分(fen)析項(xiang)目 | 類型 | 分析 | 備注 |
1 | 下(xia)機數據統(tong)計 | A | ||
2 | 數據質控 | A | ||
3 | 數據獲取(qu) | A | ||
4 | Survey 分析 | A | ||
5 | 基因組拼裝 | A | ||
6 | 基因(yin)組(zu)拼裝效果評(ping)價 | A | ||
7 | 基因組拼裝完整性(xing)與連續性(xing)評估 | A | ||
8 | 重復序(xu)列分析 | A | ||
9 | 非(fei)編碼 RNA 預測 | A | ||
10 | 蛋白(bai)編碼基因預測 | A | ||
11 | 碳(tan)水(shui)化(hua)合物活性(xing)酶（CAZy）分析 | A | ||
12 | 細胞色(se)素(su) P450 家族分析 | A | ||
13 | 蛋白編碼基因的序列比(bi)對 | A | ||
14 | 蛋白編碼基因的 GO 注釋 | A | ||
15 | 蛋白編碼(ma)基因的 eggNOG 注(zhu)釋 | A | ||
16 | 蛋白編碼基因(yin)的(de) KEGG 注釋 | A | ||
17 | 蛋白編碼(ma)基因的 Swiss-Prot 注(zhu)釋 | A | ||
18 | 蛋白編碼基因(yin)的結構域分析 | A | ||
19 | 序列比對分(fen)析(xi) | A | ||
20 | SNP 分析 | A | ||
21 | InDel 分(fen)析 | A | ||
22 | 基因家族分析(xi) | B | 基(ji)因組數(shu)量 ≥ 2 | |
23 | Venn 繪制 | B | 基因組數量 ≥ 2 | |
24 | 單拷貝(bei)基因的(de)蛋白序列一致性分析 | B | 基因(yin)組(zu)數量 ≥ 3 | |
25 | 基因家族擴(kuo)張和收縮分(fen)析 | B | 基因(yin)組數量 ≥ 3 | |
26 | dNdS 分析(xi) | B | 基因組(zu)數量(liang) ≥ 2 | |
27 | 基(ji)于全(quan)基(ji)因組單拷貝基(ji)因的進化(hua)樹重構 | B | 基因組數量 ≥ 3 | |
28 | 分歧時間估(gu)算 | B | 基(ji)因組數量 ≥ 3 | |
29 | 基因組數據上傳 | B | ||
30 | 基因組圈圖繪制 | A |
A：標準(zhun)信息分析； B：信息分析。
基于(yu)單(dan)拷貝的(de)全基因組進化(hua)分(fen)析
ω值分布(bu)圖
