1.ATAC-seq是否適合您?
ATAC能回答以(yi)下三個問題:
①找調控某一(yi)生(sheng)物學(xue)過程的(de)關鍵(jian)轉錄因子
②找哪個轉錄因(yin)子調控(kong)了我感(gan)興趣的基因(yin)
③找我感興趣的(de)轉錄因子調控的(de)靶基因
2.ATAC-seq與ChIP-seq異同點?
1.ATAC-Seq是(shi)在全(quan)基因組范圍(wei)內(nei)檢測染色質(zhi)的(de)(de)開放區(qu)域,可以得到(dao)蛋白質(zhi)的(de)(de)潛在結合位(wei)點,不依(yi)賴于抗體,一(yi)般用于不知道特定(ding)的(de)(de)轉錄因子(zi)。
2.ChIP-Seq是明確知道感興(xing)趣的(de)(de)轉(zhuan)錄因子是什么,利用(yong)(yong)特(te)異(yi)性抗體富集蛋白(bai)質及其結合的(de)(de)DNA片(pian)段,從(cong)而驗(yan)證蛋白(bai)質與DNA的(de)(de)相互作用(yong)(yong)關系(xi)。