分析內(nei)容(rong):
分析結果展示:
Peak Calling
對 Peak 注(zhu)釋分(fen)析結果(guo)中(zhong) Peak 在所覆(fu)蓋的(de)(de)基因的(de)(de)功能性區域上的(de)(de)分(fen)布(bu)進行統計,并使用 ChIPseeker 包將統計結果(guo)繪制成每個樣(yang)本分(fen)開(kai)查(cha)看的(de)(de)餅(bing)圖如下:
Peak在功(gong)能(neng)元件上的分(fen)布
Peak 鄰近基因GO富集柱狀圖
挑選(xuan)了Peak鄰近(jin)基(ji)因(yin)顯著富集的GO條目中(zhong)的前20條繪制(zhi)柱(zhu)狀圖進行展示:
Peak 鄰近基因 GO 富(fu)集柱狀(zhuang)圖
差異Peak鄰近基因Pathway富集柱狀圖和氣泡圖
差異Peak鄰近基因(yin)Pathway富集氣泡圖
GO網絡圖分析
做完(wan)Pathway富(fu)集(ji)分(fen)析后(hou),可能(neng)會得到(dao)幾(ji)百甚至幾(ji)千個富(fu)集(ji)到(dao)的(de)Pathway條(tiao)目(mu), 為了有效(xiao)的(de)利用富(fu)集(ji)分(fen)析的(de)結果,可以通過條(tiao)目(mu)之間的(de)關系找到(dao)處于更關鍵位置(zhi)的(de)Pathway條(tiao)目(mu):
GO網絡圖