m6A甲(jia)基化常(chang)見(jian)修飾(shi)部(bu)位有哪些(xie)?
m6A傾向于分布在mRNA的(de)(de)蛋(dan)白質編碼序列(CDS)、3′非(fei)翻譯區(3′UTR)、終止密碼子(zi)附近、剪切位點(dian)(dian)附近以及(ji)長的(de)(de)外顯子(zi)區域,而(er)且其修(xiu)飾區域在人和(he)鼠(shu)中具有(you)很(hen)高的(de)(de)保守性;在microRNA靶位點(dian)(dian)及(ji)其鄰近區域也有(you)m6A富集。
常見的m6A甲基化修飾類(lei)型
mRNA甲基化測序有何技術優勢(shi)?
能夠直接對任意物(wu)種(zhong)的轉錄組高甲基化片段進行測(ce)序,可無參(can)。
能夠在實際結合(he)位點(dian)100-200個(ge)堿(jian)基范圍內(nei)定位。
覆蓋整(zheng)個轉錄組范圍的(de)甲基化區域。
直接對甲基化片(pian)段進行定量(liang)和測序,不存在傳統芯片(pian)雜交的熒光(guang)模擬信(xin)號(hao)帶來的交叉反(fan)應和背(bei)景噪音問題。