m6A甲基化(hua)常見(jian)修(xiu)飾部(bu)位有哪些?
m6A傾(qing)向于分布在mRNA的(de)(de)蛋白(bai)質編(bian)碼(ma)序列(CDS)、3′非翻譯(yi)區(qu)(3′UTR)、終止(zhi)密碼(ma)子附近、剪(jian)切位點附近以及(ji)(ji)長的(de)(de)外顯子區(qu)域,而且(qie)其(qi)修(xiu)飾(shi)區(qu)域在人(ren)和鼠中具(ju)有(you)很高的(de)(de)保守性(xing);在microRNA靶(ba)位點及(ji)(ji)其(qi)鄰近區(qu)域也有(you)m6A富集。
常見的m6A甲基(ji)化修(xiu)飾類型
mRNA甲(jia)基化測序(xu)有何技(ji)術優勢?
能夠(gou)直接對任意(yi)物種(zhong)的轉(zhuan)錄組高甲基化片段(duan)進行測序,可(ke)無參(can)。
能夠在實(shi)際結合(he)位(wei)點100-200個堿基范圍內定位(wei)。
覆(fu)蓋整個(ge)轉錄組范(fan)圍的甲(jia)基化區域。
直接對甲基化(hua)片(pian)段進行定量和(he)測序,不(bu)存在傳統芯片(pian)雜交的熒光模擬(ni)信號帶來(lai)的交叉反應和(he)背景噪(zao)音(yin)問題(ti)。