針對無參考基(ji)因組(zu)物種(zhong)的轉錄(lu)組(zu)測序你們(men)可以提供哪些分析內容？
常規信息(xi)分析內容如下：
1、序列(lie)拼接(jie)及(ji)拼裝(zhuang)統計；
2、Unigene功能注(zhu)釋；
3、Unigene功能聚類分析；
4、Unigene的代謝途徑分析；
5、Unigene的表達差(cha)異(yi)分(fen)析(xi)（兩個或者(zhe)兩個以上的樣本）；
6、樣品間差異(yi)表達Unigene的(de)富集分析（GO、KEGG）；
7、樣(yang)品間差(cha)異Unigene的表達模式聚類分析（3個(ge)樣(yang)本(ben)及以上）；
8、SNP鑒定；
9、SSR分析。
除(chu)了常(chang)規信(xin)息分(fen)(fen)析(xi)外，還可根(gen)據客戶需求，進(jin)行可選性(xing)信(xin)息分(fen)(fen)析(xi)，例如：基因(yin)共表達網絡分(fen)(fen)析(xi)、PCA分(fen)(fen)析(xi)、差異mRNA蛋白互作(zuo)網絡分(fen)(fen)析(xi)、轉錄因(yin)子(zi)分(fen)(fen)析(xi)（適(shi)用于(yu)植物物種）、樣本特異表達及共有表達基因(yin)分(fen)(fen)析(xi)、樣品(pin)間相關性(xing)分(fen)(fen)析(xi)、mRNA與(yu)miRNA互作(zuo)分(fen)(fen)析(xi)、mRNA與(yu)LncRNA互作(zuo)分(fen)(fen)析(xi)、DEU分(fen)(fen)析(xi)（適(shi)用于(yu)有生物學重復）。
